MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bartonella quintana str. Toulouse

Total Repeats: 10484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005955	ATT	2	6	3627	3632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005955	A	7	7	3657	3663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005955	GGGGA	2	10	3676	3685	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005955	AGG	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005955	TAT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005955	ACTA	2	8	3785	3792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_005955	A	11	11	3820	3830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005955	A	8	8	3873	3880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005955	A	6	6	7772	7777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005955	ATT	2	6	7819	7824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005955	ACA	2	6	8665	8670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_005955	CTT	2	6	8743	8748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005955	ATTT	2	8	8758	8765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005955	A	6	6	8792	8797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005955	TG	3	6	8861	8866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005955	AAT	2	6	8948	8953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005955	CAA	2	6	8968	8973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005955	AGA	2	6	8985	8990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005955	GAG	2	6	9009	9014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005955	TGGTT	2	10	9027	9036	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005955	T	7	7	9101	9107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005955	GAA	2	6	9118	9123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005955	CTT	2	6	9140	9145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_005955	TTC	2	6	9146	9151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_005955	T	6	6	9154	9159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005955	AAT	2	6	9191	9196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005955	AAG	2	6	9261	9266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005955	TGAC	2	8	9280	9287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_005955	TTC	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_005955	TC	3	6	9304	9309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_005955	TTAC	2	8	9460	9467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_005955	AAAAT	2	10	9509	9518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005955	A	7	7	9532	9538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005955	TAA	2	6	9584	9589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005955	GTT	2	6	9666	9671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005955	AGG	2	6	9700	9705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005955	A	6	6	9721	9726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005955	TTA	2	6	9746	9751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005955	CG	3	6	9797	9802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005955	TAA	2	6	9805	9810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005955	GGT	2	6	11254	11259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005955	TTC	2	6	11260	11265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_005955	CCA	2	6	11297	11302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_005955	GAAG	2	8	11341	11348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005955	AAG	2	6	11380	11385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005955	TTG	2	6	11387	11392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005955	TTG	2	6	11421	11426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005955	GTAA	2	8	11427	11434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005955	ATCAT	2	10	11495	11504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_005955	T	6	6	11508	11513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005955	CAA	2	6	11532	11537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_005955	T	6	6	11623	11628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005955	A	7	7	11696	11702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005955	TTC	2	6	11743	11748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_005955	GGC	2	6	11854	11859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005955	CTT	2	6	11888	11893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_005955	TAA	2	6	11943	11948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005955	AAT	2	6	11982	11987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005955	CTG	2	6	12102	12107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_005955	GT	3	6	12110	12115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005955	TAA	2	6	12198	12203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005955	A	6	6	12240	12245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005955	ATG	2	6	12262	12267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005955	A	6	6	12285	12290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005955	CAT	2	6	12305	12310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005955	CT	3	6	12891	12896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_005955	A	6	6	12904	12909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005955	T	7	7	12912	12918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005955	ATGC	2	8	12934	12941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_005955	AT	3	6	12949	12954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005955	TAAAA	2	10	12968	12977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005955	A	6	6	12983	12988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005955	GA	3	6	13060	13065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005955	GTATGT	2	12	13789	13800	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005955	CAAA	2	8	13802	13809	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_005955	TGA	2	6	13821	13826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005955	CTTAAA	2	12	15262	15273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_005955	AT	3	6	15307	15312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005955	ATTT	2	8	15349	15356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005955	TTTC	2	8	15367	15374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_005955	AAT	2	6	15387	15392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005955	GAAA	2	8	15406	15413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005955	GAG	2	6	15446	15451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005955	GTT	2	6	15457	15462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005955	T	6	6	15486	15491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005955	CTT	2	6	15573	15578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_005955	GTC	2	6	15587	15592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_005955	TAAA	3	12	15610	15621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005955	A	8	8	15619	15626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005955	TCA	2	6	15629	15634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_005955	AATG	2	8	15716	15723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005955	AAAT	2	8	15738	15745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005955	GTT	2	6	15752	15757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005955	TAA	2	6	15769	15774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005955	TGT	2	6	15782	15787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005955	ATT	2	6	15807	15812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005955	TGG	2	6	15826	15831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005955	TA	4	8	15842	15849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005955	GTA	2	6	15872	15877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005955	TTG	2	6	15880	15885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005955	TTG	2	6	15987	15992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005955	TAGT	2	8	15993	16000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005955	CA	3	6	16011	16016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_005955	AAAGT	2	10	16025	16034	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005955	ATC	2	6	16057	16062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005955	AGGAAG	2	12	16084	16095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005955	A	6	6	16132	16137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005955	ACA	2	6	16194	16199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_005955	TATT	2	8	16244	16251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005955	AAAT	2	8	16308	16315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005955	GAT	2	6	16324	16329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005955	ACC	2	6	16915	16920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_005955	GAA	2	6	16991	16996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005955	GAA	2	6	17020	17025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005955	GAGC	2	8	17036	17043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_005955	T	7	7	17058	17064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005955	TGA	2	6	17147	17152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005955	GA	3	6	17210	17215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005955	GCT	2	6	17253	17258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_005955	T	6	6	17343	17348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005955	GTT	2	6	17392	17397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005955	TGT	2	6	17429	17434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005955	A	6	6	17437	17442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005955	TTTA	2	8	17455	17462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005955	TGG	2	6	17519	17524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005955	A	6	6	17525	17530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005955	ATT	2	6	17578	17583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005955	GAT	2	6	17612	17617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005955	GGT	2	6	17664	17669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005955	TAGG	2	8	17670	17677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005955	ATA	2	6	17713	17718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005955	GAAA	2	8	17809	17816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005955	CAA	2	6	17933	17938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_005955	T	6	6	17998	18003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005955	A	6	6	18039	18044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005955	TGA	2	6	18051	18056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005955	TGT	2	6	18070	18075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005955	T	6	6	18075	18080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005955	TAA	2	6	18118	18123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005955	GGT	2	6	18187	18192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005955	TGA	2	6	18215	18220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005955	TTG	2	6	18225	18230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005955	TTA	2	6	18253	18258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005955	AAG	2	6	18266	18271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005955	AAAAC	2	10	20089	20098	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_005955	TAA	2	6	20263	20268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005955	AAT	2	6	20297	20302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005955	TGTT	2	8	20373	20380	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005955	GA	3	6	20382	20387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005955	A	7	7	20461	20467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_005955	ACA	2	6	20660	20665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_005955	TTG	2	6	21237	21242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_005955	ATTT	2	8	25482	25489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_005955	A	7	7	32299	32305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_005955	A	6	6	44469	44474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_005955	GAACA	2	10	44647	44656	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_005955	GTT	2	6	44684	44689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_005955	GTA	2	6	44855	44860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_005955	T	7	7	44958	44964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_005955	TGC	2	6	44986	44991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_005955	TGA	2	6	44993	44998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_005955	CCT	2	6	45017	45022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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