MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM400

Total Repeats: 474

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004604	T	6	6	6	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004604	T	7	7	13	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004604	T	7	7	31	37	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004604	TTCCT	2	10	85	94	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_004604	AG	3	6	120	125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004604	A	6	6	551	556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004604	TTGTA	2	10	572	581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004604	A	7	7	585	591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004604	CA	3	6	859	864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_004604	TC	3	6	895	900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004604	T	7	7	903	909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004604	ACT	2	6	916	921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004604	GGA	2	6	1185	1190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004604	TGA	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004604	CATC	2	8	1239	1246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004604	TA	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004604	AGAA	2	8	1336	1343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004604	AAC	2	6	1352	1357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004604	T	6	6	1563	1568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004604	A	6	6	1583	1588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004604	A	6	6	1596	1601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004604	AGA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004604	AC	3	6	1690	1695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_004604	A	6	6	1718	1723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004604	ATG	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004604	AT	3	6	1814	1819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004604	T	6	6	1828	1833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004604	ACT	2	6	1847	1852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004604	TAA	2	6	1861	1866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004604	A	6	6	1891	1896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004604	AGTT	2	8	1990	1997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004604	TTTTA	2	10	2020	2029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004604	TTAA	2	8	2067	2074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004604	TTC	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004604	GAA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004604	TAT	3	9	3472	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004604	AT	3	6	3505	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004604	AGG	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004604	CT	3	6	4295	4300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004604	AGG	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004604	AT	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004604	AAT	2	6	5230	5235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004604	TTTTC	2	10	5273	5282	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_004604	AATG	2	8	5291	5298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004604	GC	3	6	5401	5406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_004604	ATA	2	6	5422	5427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004604	TATACA	2	12	5438	5449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004604	TA	3	6	5468	5473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004604	AGG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004604	ATT	2	6	6197	6202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004604	TCT	2	6	6393	6398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_004604	TTAA	2	8	6425	6432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004604	AAT	2	6	6475	6480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004604	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004604	TTTA	2	8	6801	6808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004604	TGCC	2	8	6861	6868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_004604	TA	3	6	6937	6942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004604	AT	3	6	6946	6951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004604	TAAT	2	8	7345	7352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004604	AT	3	6	7379	7384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004604	CTA	2	6	7527	7532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_004604	GAAT	2	8	7591	7598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004604	AT	3	6	7614	7619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004604	AGAA	2	8	9245	9252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004604	A	6	6	9903	9908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004604	ATAAAA	2	12	9912	9923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004604	TTA	2	6	9965	9970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004604	TTCTA	2	10	10027	10036	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_004604	CCT	2	6	10898	10903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_004604	ACTC	2	8	11779	11786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_004604	AAT	2	6	11796	11801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004604	A	7	7	11844	11850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004604	AG	3	6	11863	11868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004604	ATA	2	6	12217	12222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004604	ATCT	2	8	12275	12282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_004604	AT	3	6	12287	12292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004604	TAA	2	6	14315	14320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004604	A	6	6	14334	14339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004604	TTTA	2	8	14340	14347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004604	AAT	2	6	14366	14371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004604	TTA	2	6	14384	14389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004604	AT	5	10	14411	14420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004604	TCTTA	2	10	14479	14488	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004604	CAT	2	6	14490	14495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004604	TAAA	2	8	14619	14626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004604	ACTAA	2	10	14713	14722	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004604	TA	3	6	14749	14754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004604	ACC	2	6	14812	14817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_004604	AAT	2	6	14839	14844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004604	TAT	2	6	15318	15323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004604	A	6	6	15324	15329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004604	CAAA	2	8	15353	15360	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_004604	AAAGAA	2	12	15382	15393	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004604	T	6	6	15417	15422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004604	A	6	6	15444	15449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004604	TATC	2	8	15452	15459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_004604	A	6	6	15468	15473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004604	AATA	2	8	15516	15523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004604	CAC	2	6	15557	15562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_004604	AAAG	2	8	15572	15579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004604	TCC	2	6	15584	15589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_004604	ATT	2	6	16815	16820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004604	TAT	2	6	16833	16838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004604	TAA	2	6	16853	16858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004604	ATT	2	6	16866	16871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004604	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004604	TGG	2	6	16926	16931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004604	AAAGA	2	10	16954	16963	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004604	AGGG	2	8	17258	17265	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004604	ATTC	2	8	20485	20492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_004604	A	6	6	20516	20521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004604	GA	3	6	20785	20790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004604	ATG	2	6	20845	20850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004604	TTA	3	9	20899	20907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004604	AAT	2	6	20931	20936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004604	TTTA	2	8	20989	20996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004604	A	6	6	21006	21011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004604	GAA	2	6	21050	21055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004604	ACCG	2	8	21066	21073	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_004604	TTAACA	2	12	21874	21885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_004604	ATC	2	6	21902	21907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_004604	A	7	7	21918	21924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004604	AAT	2	6	21951	21956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004604	TAA	2	6	22001	22006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004604	ATTT	2	8	22072	22079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004604	T	7	7	22077	22083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004604	TAC	2	6	22126	22131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_004604	CTT	2	6	22143	22148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_004604	ATT	2	6	23413	23418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004604	ACC	2	6	23465	23470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_004604	ATTT	2	8	23471	23478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004604	TGAATT	2	12	23539	23550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004604	A	7	7	23575	23581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004604	TCAC	2	8	23619	23626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_004604	ATG	2	6	23629	23634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004604	CAAA	2	8	23641	23648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004604	GAT	2	6	23657	23662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004604	GAA	2	6	23742	23747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004604	GAT	2	6	23763	23768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004604	T	6	6	23799	23804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004604	AGA	2	6	23835	23840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004604	CT	3	6	23850	23855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_004604	T	6	6	23861	23866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004604	ACT	2	6	24332	24337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_004604	TATT	2	8	24357	24364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004604	GAT	2	6	24389	24394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004604	T	7	7	24445	24451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004604	GAG	2	6	24924	24929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004604	AGT	2	6	24946	24951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004604	TGG	2	6	24953	24958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004604	ACA	2	6	24969	24974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_004604	TAGC	2	8	24994	25001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_004604	A	7	7	25052	25058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_004604	T	6	6	52839	52844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_004604	T	7	7	52852	52858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_004604	GTT	2	6	52865	52870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_004604	GT	3	6	52875	52880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NC_004604	ACG	2	6	52885	52890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_004604	TAA	3	9	52896	52904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_004604	TACT	2	8	52909	52916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
446	NC_004604	A	6	6	52937	52942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_004604	TATT	2	8	52948	52955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_004604	GTT	2	6	52985	52990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NC_004604	TA	3	6	53010	53015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_004604	TAAA	2	8	53041	53048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_004604	GCGT	2	8	53049	53056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
452	NC_004604	A	6	6	53064	53069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_004604	TA	3	6	53114	53119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_004604	GAA	2	6	53122	53127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_004604	AAT	2	6	53294	53299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_004604	TTA	2	6	53306	53311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_004604	T	6	6	53367	53372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_004604	CTT	2	6	53503	53508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_004604	TCC	2	6	53617	53622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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470	NC_004604	A	7	7	53752	53758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_004604	CT	4	8	53824	53831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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474	NC_004604	A	7	7	53849	53855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.