MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) chromosome

Total Repeats: 4156

< Previous123456789Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004061	A	6	6	619692	619697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_004061	T	7	7	620465	620471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_004061	TGA	2	6	622006	622011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_004061	TAT	2	6	622025	622030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_004061	ATT	2	6	622059	622064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_004061	A	6	6	622067	622072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_004061	T	7	7	624124	624130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_004061	T	8	8	624132	624139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_004061	TTAT	2	8	624170	624177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_004061	A	8	8	624219	624226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_004061	TAATA	2	10	624238	624247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_004061	TAT	2	6	624253	624258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_004061	T	6	6	624647	624652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_004061	A	6	6	624661	624666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_004061	A	8	8	624716	624723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_004061	CTA	2	6	624736	624741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_004061	ACA	2	6	624761	624766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_004061	A	8	8	624781	624788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_004061	TAT	2	6	624790	624795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_004061	ATA	2	6	624847	624852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_004061	TAAA	2	8	624856	624863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_004061	AGG	2	6	624878	624883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_004061	GTTT	2	8	624889	624896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_004061	AGAATT	2	12	624902	624913	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_004061	CTT	2	6	624918	624923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_004061	AGA	2	6	624932	624937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_004061	GAA	2	6	624956	624961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_004061	AGT	2	6	625079	625084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_004061	AAG	2	6	625100	625105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_004061	ATT	2	6	625140	625145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_004061	TAGAT	2	10	625181	625190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_004061	ATG	2	6	625201	625206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_004061	ATT	2	6	625209	625214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_004061	TCC	2	6	625289	625294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_004061	TA	3	6	625316	625321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_004061	T	8	8	625350	625357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_004061	AAAT	2	8	625390	625397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_004061	A	6	6	625416	625421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_004061	A	7	7	625473	625479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_004061	ATA	2	6	625518	625523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_004061	TGGT	2	8	625541	625548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_004061	AGA	2	6	625559	625564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_004061	TAA	2	6	625595	625600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_004061	A	8	8	625634	625641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_004061	GAA	2	6	625689	625694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_004061	AAT	2	6	625701	625706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_004061	TCT	2	6	625728	625733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_004061	A	6	6	625769	625774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_004061	A	7	7	625784	625790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_004061	TA	3	6	625801	625806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_004061	T	6	6	625825	625830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_004061	A	6	6	625833	625838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_004061	TATT	2	8	625841	625848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_004061	A	8	8	625865	625872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_004061	TA	3	6	625888	625893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_004061	A	8	8	625949	625956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_004061	T	7	7	625957	625963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_004061	A	9	9	625967	625975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_004061	TTA	2	6	625991	625996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_004061	A	7	7	626009	626015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_004061	A	9	9	626023	626031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_004061	TTA	2	6	626037	626042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_004061	TAA	2	6	626065	626070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_004061	TTAA	2	8	626079	626086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_004061	AT	3	6	626098	626103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_004061	GTT	2	6	626106	626111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_004061	T	6	6	626146	626151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_004061	A	6	6	626159	626164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_004061	AAAT	2	8	626179	626186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_004061	GTA	2	6	626193	626198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_004061	AAT	2	6	626231	626236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_004061	GTT	2	6	626261	626266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_004061	T	6	6	626280	626285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_004061	A	8	8	626312	626319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_004061	TTGG	2	8	626320	626327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_004061	ATT	2	6	626337	626342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_004061	ATA	3	9	626356	626364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_004061	ATTT	2	8	626365	626372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_004061	ATTA	2	8	626375	626382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_004061	TAA	2	6	626390	626395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_004061	AATT	2	8	626400	626407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_004061	ATT	2	6	626505	626510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_004061	T	6	6	626513	626518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_004061	CCA	2	6	626589	626594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_004061	T	6	6	626606	626611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_004061	ATT	2	6	626612	626617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_004061	T	7	7	626616	626622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_004061	AAT	2	6	626627	626632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_004061	TAAAA	2	10	626710	626719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_004061	TAA	2	6	626742	626747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_004061	T	9	9	626762	626770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_004061	AAATA	2	10	626779	626788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_004061	A	7	7	626788	626794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_004061	TGG	2	6	628069	628074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_004061	T	7	7	628131	628137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_004061	TAA	2	6	628146	628151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_004061	AATTT	2	10	628168	628177	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_004061	T	6	6	628175	628180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_004061	AGTTAA	2	12	628182	628193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_004061	TA	4	8	628199	628206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_004061	TAA	3	9	628559	628567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_004061	A	6	6	628566	628571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_004061	TTAA	2	8	628577	628584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_004061	TAT	2	6	628588	628593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_004061	AAT	2	6	628630	628635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_004061	T	7	7	628658	628664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_004061	T	6	6	628666	628671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_004061	T	8	8	628676	628683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_004061	ATA	2	6	630677	630682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_004061	GATT	2	8	630689	630696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_004061	AATT	2	8	630701	630708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_004061	A	6	6	630722	630727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_004061	AAT	2	6	632247	632252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_004061	TGA	2	6	632281	632286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_004061	ATTTT	2	10	632290	632299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_004061	T	6	6	634177	634182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_004061	ATT	2	6	634183	634188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_004061	T	6	6	634217	634222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_004061	T	8	8	634234	634241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_004061	T	8	8	634243	634250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_004061	TAG	2	6	634253	634258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_004061	TA	3	6	634263	634268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_004061	AT	3	6	634275	634280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_004061	AATT	2	8	634282	634289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_004061	TAAA	2	8	634310	634317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_004061	AAT	2	6	634449	634454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_004061	TTAA	2	8	634462	634469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_004061	TATAT	2	10	634487	634496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_004061	ATTT	2	8	634515	634522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_004061	T	6	6	634536	634541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_004061	TA	3	6	634590	634595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_004061	AAT	2	6	634601	634606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_004061	AT	4	8	635839	635846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_004061	AAG	2	6	635848	635853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_004061	T	7	7	636256	636262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_004061	T	6	6	636317	636322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_004061	AT	3	6	636325	636330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_004061	TTTTA	2	10	640417	640426	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_004061	T	6	6	641044	641049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_004061	AT	3	6	641054	641059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_004061	T	7	7	641089	641095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_004061	A	8	8	641103	641110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_004061	AATG	2	8	641115	641122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_004061	T	8	8	641132	641139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_004061	TTTA	2	8	641150	641157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_004061	ATA	2	6	641170	641175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_004061	A	7	7	641182	641188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_004061	AGTT	3	12	641220	641231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_004061	AAG	2	6	641233	641238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_004061	TAA	3	9	641290	641298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_004061	ATT	2	6	641301	641306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_004061	T	16	16	641313	641328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_004061	T	8	8	641355	641362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_004061	TATTT	2	10	641366	641375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_004061	TAT	2	6	641384	641389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_004061	AAT	2	6	641424	641429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous123456789Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.