MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_002929	CCAC	2	8	3520909	3520916	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17002	NC_002929	GCC	2	6	3520958	3520963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17003	NC_002929	GC	3	6	3520989	3520994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17004	NC_002929	CGT	2	6	3521086	3521091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17005	NC_002929	CAG	2	6	3521156	3521161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_002929	CTT	2	6	3521162	3521167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17007	NC_002929	CGC	2	6	3521209	3521214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17008	NC_002929	GAA	2	6	3521396	3521401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_002929	CG	4	8	3521467	3521474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17010	NC_002929	CAG	2	6	3521507	3521512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_002929	GTT	2	6	3521672	3521677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_002929	CGA	2	6	3521683	3521688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17013	NC_002929	CGC	2	6	3521710	3521715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17014	NC_002929	CCTT	2	8	3521718	3521725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17015	NC_002929	CGA	2	6	3521752	3521757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17016	NC_002929	AGCG	2	8	3521778	3521785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17017	NC_002929	CGGC	2	8	3521794	3521801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17018	NC_002929	AGC	2	6	3521802	3521807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17019	NC_002929	GCG	2	6	3521812	3521817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17020	NC_002929	TGA	3	9	3521827	3521835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_002929	TGG	2	6	3521875	3521880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_002929	GTT	2	6	3521912	3521917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_002929	CGT	2	6	3521983	3521988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17024	NC_002929	CAGGT	2	10	3522006	3522015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17025	NC_002929	TTC	2	6	3522024	3522029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17026	NC_002929	CGT	2	6	3522109	3522114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17027	NC_002929	CGG	2	6	3522142	3522147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17028	NC_002929	GAC	2	6	3522159	3522164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17029	NC_002929	GCC	2	6	3522207	3522212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17030	NC_002929	GGC	2	6	3522224	3522229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_002929	CAG	2	6	3522230	3522235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17032	NC_002929	GTG	2	6	3522243	3522248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_002929	CGG	2	6	3522361	3522366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17034	NC_002929	GAA	2	6	3522395	3522400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_002929	CGG	2	6	3522434	3522439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17036	NC_002929	CGC	2	6	3522440	3522445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17037	NC_002929	GAGG	2	8	3522446	3522453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17038	NC_002929	CCG	2	6	3522473	3522478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17039	NC_002929	AGGC	2	8	3522483	3522490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17040	NC_002929	CGG	2	6	3522492	3522497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17041	NC_002929	CGG	2	6	3523796	3523801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17042	NC_002929	GCG	2	6	3523802	3523807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17043	NC_002929	GCCGG	2	10	3523836	3523845	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17044	NC_002929	CGTC	2	8	3524699	3524706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17045	NC_002929	CGC	2	6	3524729	3524734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17046	NC_002929	GTT	2	6	3526514	3526519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_002929	TTAC	2	8	3526547	3526554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17048	NC_002929	GTC	2	6	3526557	3526562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17049	NC_002929	TAAT	2	8	3526566	3526573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_002929	TGA	2	6	3526574	3526579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_002929	GC	3	6	3526625	3526630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17052	NC_002929	CGC	2	6	3527276	3527281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17053	NC_002929	GTT	2	6	3528478	3528483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_002929	GC	3	6	3528486	3528491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17055	NC_002929	CAA	2	6	3528498	3528503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17056	NC_002929	AAAAC	2	10	3528511	3528520	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17057	NC_002929	GCC	2	6	3528523	3528528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17058	NC_002929	CTTT	2	8	3528565	3528572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17059	NC_002929	TCA	2	6	3528687	3528692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17060	NC_002929	CGA	2	6	3528715	3528720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17061	NC_002929	CG	3	6	3528723	3528728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17062	NC_002929	GCC	2	6	3528736	3528741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17063	NC_002929	CGGC	2	8	3528756	3528763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17064	NC_002929	ACC	2	6	3528770	3528775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17065	NC_002929	GGC	2	6	3528778	3528783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17067	NC_002929	CAA	2	6	3528805	3528810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17068	NC_002929	CGC	2	6	3528837	3528842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17069	NC_002929	GCA	2	6	3528871	3528876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17070	NC_002929	CGG	2	6	3528907	3528912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17071	NC_002929	GCC	2	6	3529014	3529019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17072	NC_002929	TGA	2	6	3529056	3529061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_002929	CGA	2	6	3529078	3529083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17074	NC_002929	CGG	3	9	3529090	3529098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17075	NC_002929	GGCG	2	8	3529108	3529115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17076	NC_002929	GACC	2	8	3529123	3529130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17077	NC_002929	TGA	2	6	3529131	3529136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17078	NC_002929	GCGCC	2	10	3529283	3529292	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17079	NC_002929	ATT	2	6	3529387	3529392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17081	NC_002929	CCA	2	6	3529438	3529443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17082	NC_002929	CGA	2	6	3529466	3529471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17083	NC_002929	GCT	2	6	3529481	3529486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17084	NC_002929	CTGG	2	8	3529520	3529527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17085	NC_002929	GCCG	2	8	3529550	3529557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17086	NC_002929	GGT	2	6	3529598	3529603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17089	NC_002929	CG	3	6	3529704	3529709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17090	NC_002929	CCG	2	6	3529710	3529715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17091	NC_002929	CTG	2	6	3529716	3529721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17093	NC_002929	CGC	3	9	3529825	3529833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17094	NC_002929	GC	3	6	3529832	3529837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17095	NC_002929	GGCG	2	8	3529844	3529851	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17096	NC_002929	CCA	2	6	3529858	3529863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17097	NC_002929	CAGG	2	8	3529873	3529880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17098	NC_002929	GGCGCC	2	12	3529919	3529930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17099	NC_002929	CGC	2	6	3529954	3529959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17102	NC_002929	CG	3	6	3530016	3530021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17103	NC_002929	GC	3	6	3530096	3530101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17104	NC_002929	CGG	3	9	3530109	3530117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17107	NC_002929	CGT	3	9	3530244	3530252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17108	NC_002929	GCG	3	9	3530270	3530278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17109	NC_002929	CTT	2	6	3530311	3530316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17110	NC_002929	TGA	2	6	3530331	3530336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17111	NC_002929	GGT	2	6	3530338	3530343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_002929	CCG	2	6	3530373	3530378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17113	NC_002929	GGCGC	2	10	3530401	3530410	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17114	NC_002929	GCCG	2	8	3530465	3530472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17115	NC_002929	AGG	2	6	3530505	3530510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17119	NC_002929	C	7	7	3530761	3530767	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17120	NC_002929	CCGG	2	8	3530784	3530791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17121	NC_002929	GGC	2	6	3531745	3531750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17122	NC_002929	CAATC	2	10	3531757	3531766	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17123	NC_002929	TA	3	6	3531819	3531824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17124	NC_002929	GA	3	6	3531838	3531843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17125	NC_002929	GC	3	6	3531972	3531977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17126	NC_002929	GTT	2	6	3532014	3532019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17128	NC_002929	CCGG	2	8	3533124	3533131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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