MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_002929	GCA	2	6	3432844	3432849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_002929	CCG	2	6	3432852	3432857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16504	NC_002929	CGC	2	6	3432883	3432888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16505	NC_002929	TGC	2	6	3432901	3432906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16506	NC_002929	ACG	2	6	3432927	3432932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_002929	GGA	2	6	3433016	3433021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_002929	GTC	2	6	3433085	3433090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16509	NC_002929	AGT	2	6	3433108	3433113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16510	NC_002929	TCGGC	2	10	3433114	3433123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16511	NC_002929	CGG	2	6	3433124	3433129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16512	NC_002929	GGCG	2	8	3433169	3433176	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16513	NC_002929	GGC	2	6	3433197	3433202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16514	NC_002929	ACGGC	2	10	3433204	3433213	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16515	NC_002929	CCG	2	6	3433270	3433275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16516	NC_002929	GCA	2	6	3433276	3433281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16517	NC_002929	GC	3	6	3433302	3433307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16518	NC_002929	GCA	2	6	3433312	3433317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16519	NC_002929	CGT	2	6	3433381	3433386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16520	NC_002929	CG	4	8	3433391	3433398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16521	NC_002929	GCCC	2	8	3433404	3433411	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16522	NC_002929	CCG	2	6	3433426	3433431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16523	NC_002929	CGGG	2	8	3433435	3433442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16524	NC_002929	GTG	2	6	3433443	3433448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_002929	GGCC	2	8	3433468	3433475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16527	NC_002929	CGG	2	6	3433505	3433510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16529	NC_002929	CG	3	6	3433570	3433575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16535	NC_002929	GCCG	2	8	3435932	3435939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16539	NC_002929	CG	3	6	3440235	3440240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16540	NC_002929	GCCG	2	8	3440278	3440285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16541	NC_002929	CGG	2	6	3440301	3440306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16542	NC_002929	TTCCA	2	10	3440314	3440323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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16545	NC_002929	TACA	2	8	3443508	3443515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16549	NC_002929	GGA	2	6	3443655	3443660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16550	NC_002929	GCCG	2	8	3443723	3443730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16551	NC_002929	CAG	2	6	3444077	3444082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16553	NC_002929	CCCG	2	8	3444201	3444208	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16554	NC_002929	GCAG	2	8	3444212	3444219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16555	NC_002929	GTT	2	6	3444220	3444225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16557	NC_002929	TCCA	2	8	3444289	3444296	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16559	NC_002929	CGGCGC	2	12	3444329	3444340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16561	NC_002929	CGGC	2	8	3444371	3444378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16563	NC_002929	CG	3	6	3444418	3444423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16564	NC_002929	GCG	2	6	3444472	3444477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16565	NC_002929	GC	3	6	3444497	3444502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16605	NC_002929	CTTC	2	8	3445542	3445549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16613	NC_002929	C	7	7	3445802	3445808	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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16626	NC_002929	GGCC	2	8	3446386	3446393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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