MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_002929	CACGA	2	10	3237682	3237691	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15503	NC_002929	GAC	2	6	3237695	3237700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_002929	GCA	2	6	3237707	3237712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_002929	GGTA	2	8	3237774	3237781	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_002929	CAT	2	6	3237812	3237817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_002929	AGG	2	6	3238022	3238027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_002929	TCC	2	6	3238047	3238052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15509	NC_002929	CCTC	2	8	3238091	3238098	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15510	NC_002929	AC	3	6	3238101	3238106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15511	NC_002929	TCTT	2	8	3238160	3238167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15512	NC_002929	GCT	2	6	3238237	3238242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_002929	TTTC	2	8	3238309	3238316	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15514	NC_002929	CTG	2	6	3238405	3238410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_002929	GTC	2	6	3238455	3238460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_002929	TCG	2	6	3238480	3238485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15517	NC_002929	CCA	2	6	3238504	3238509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15518	NC_002929	CCA	2	6	3238664	3238669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15519	NC_002929	TGC	2	6	3238682	3238687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_002929	TG	4	8	3238762	3238769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_002929	A	6	6	3238822	3238827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_002929	TTCA	2	8	3238834	3238841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15523	NC_002929	TGCTT	2	10	3238857	3238866	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15524	NC_002929	GAC	2	6	3238872	3238877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_002929	GCC	2	6	3238882	3238887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15526	NC_002929	GTT	2	6	3238922	3238927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15529	NC_002929	T	6	6	3239011	3239016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_002929	CGT	2	6	3239221	3239226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_002929	CAA	2	6	3239228	3239233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_002929	CCCG	2	8	3239273	3239280	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15533	NC_002929	TGC	2	6	3239292	3239297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15534	NC_002929	CCT	2	6	3239303	3239308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15535	NC_002929	TCG	2	6	3239376	3239381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15536	NC_002929	GCG	2	6	3239397	3239402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_002929	AAG	2	6	3239403	3239408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_002929	A	6	6	3239425	3239430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_002929	ATTA	2	8	3239469	3239476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_002929	C	6	6	3239516	3239521	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15541	NC_002929	GCCG	2	8	3239534	3239541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15542	NC_002929	CG	3	6	3239550	3239555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15543	NC_002929	TA	4	8	3239573	3239580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_002929	GC	3	6	3239594	3239599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15545	NC_002929	TA	4	8	3239614	3239621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_002929	ATT	2	6	3240139	3240144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_002929	ATA	2	6	3240149	3240154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_002929	ATTG	2	8	3240228	3240235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15550	NC_002929	CCTG	2	8	3241375	3241382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15551	NC_002929	GCG	3	9	3241428	3241436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_002929	GCCA	2	8	3244062	3244069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15553	NC_002929	AAC	2	6	3244097	3244102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_002929	TTA	2	6	3244114	3244119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_002929	TCT	2	6	3244127	3244132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_002929	CGCC	2	8	3244958	3244965	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15557	NC_002929	GC	3	6	3244988	3244993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15558	NC_002929	CGC	3	9	3244991	3244999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15559	NC_002929	CAT	3	9	3245013	3245021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15561	NC_002929	CG	4	8	3245034	3245041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15562	NC_002929	CGC	2	6	3245054	3245059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15563	NC_002929	GCC	2	6	3245061	3245066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15564	NC_002929	GC	4	8	3245123	3245130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15565	NC_002929	GGC	2	6	3245145	3245150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15569	NC_002929	GC	3	6	3245188	3245193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15570	NC_002929	CAGC	2	8	3245243	3245250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15571	NC_002929	GCC	2	6	3245257	3245262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15574	NC_002929	CG	5	10	3245384	3245393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15595	NC_002929	CCGG	2	8	3248035	3248042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15598	NC_002929	GCAG	2	8	3249236	3249243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15599	NC_002929	CCAA	2	8	3249273	3249280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15602	NC_002929	T	9	9	3251323	3251331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15609	NC_002929	CGGC	2	8	3254120	3254127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15610	NC_002929	GCC	3	9	3254142	3254150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15612	NC_002929	GGC	2	6	3254216	3254221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15613	NC_002929	ACGTC	2	10	3254257	3254266	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15614	NC_002929	GTC	2	6	3254315	3254320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_002929	GCC	2	6	3254339	3254344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15619	NC_002929	G	7	7	3255505	3255511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15620	NC_002929	CTGCA	2	10	3256375	3256384	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15621	NC_002929	CTTTC	2	10	3256490	3256499	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15622	NC_002929	TCGG	2	8	3256543	3256550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15623	NC_002929	GGC	2	6	3263552	3263557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15625	NC_002929	C	6	6	3263592	3263597	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15626	NC_002929	GCCG	2	8	3263607	3263614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15627	NC_002929	CGG	2	6	3263636	3263641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15629	NC_002929	CGG	2	6	3263705	3263710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15763	NC_002929	GCA	2	6	3301203	3301208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15764	NC_002929	CGGC	2	8	3301217	3301224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15765	NC_002929	CGATGT	2	12	3301230	3301241	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15766	NC_002929	CTGGCC	2	12	3301249	3301260	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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15768	NC_002929	CGC	2	6	3301302	3301307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15769	NC_002929	GC	4	8	3301324	3301331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15770	NC_002929	CTGCAG	2	12	3301381	3301392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15771	NC_002929	GC	5	10	3301438	3301447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15780	NC_002929	CG	3	6	3303215	3303220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15781	NC_002929	CGA	3	9	3303222	3303230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15782	NC_002929	CCGG	2	8	3303232	3303239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15783	NC_002929	GC	3	6	3303262	3303267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15784	NC_002929	GCC	2	6	3303300	3303305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15886	NC_002929	A	6	6	3324451	3324456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15887	NC_002929	TATT	2	8	3324481	3324488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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