MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_002929	GC	3	6	3126844	3126849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15002	NC_002929	GCCGC	2	10	3126855	3126864	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15003	NC_002929	CG	3	6	3126881	3126886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15004	NC_002929	GGCGAA	2	12	3126927	3126938	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15005	NC_002929	TGC	2	6	3127022	3127027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_002929	CGG	2	6	3127106	3127111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_002929	GC	3	6	3127125	3127130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15008	NC_002929	CG	3	6	3127136	3127141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15009	NC_002929	GCC	3	9	3127146	3127154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_002929	ATG	2	6	3127204	3127209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_002929	CG	3	6	3127224	3127229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15012	NC_002929	GCCC	2	8	3127230	3127237	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15013	NC_002929	CGGC	2	8	3127257	3127264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15014	NC_002929	AT	4	8	3127287	3127294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_002929	CCGG	2	8	3127298	3127305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15016	NC_002929	GCG	2	6	3127316	3127321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15017	NC_002929	CGG	2	6	3128171	3128176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_002929	TTCC	2	8	3130754	3130761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15019	NC_002929	GGC	2	6	3133202	3133207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_002929	CTC	2	6	3133211	3133216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15021	NC_002929	CGA	2	6	3133250	3133255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_002929	ATC	2	6	3133264	3133269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_002929	CGC	2	6	3133322	3133327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15024	NC_002929	GCA	2	6	3133340	3133345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_002929	GCT	2	6	3133349	3133354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_002929	CAC	2	6	3133377	3133382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15027	NC_002929	CGC	2	6	3133421	3133426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15028	NC_002929	CAT	2	6	3133458	3133463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_002929	CAGC	2	8	3133524	3133531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15030	NC_002929	TCC	2	6	3133558	3133563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15031	NC_002929	AGT	2	6	3133595	3133600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_002929	GGC	2	6	3133706	3133711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_002929	CGCGG	2	10	3133794	3133803	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15034	NC_002929	GC	3	6	3133804	3133809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15035	NC_002929	CGC	3	9	3133807	3133815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15036	NC_002929	CG	4	8	3133831	3133838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15037	NC_002929	GC	5	10	3134599	3134608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15038	NC_002929	CCGG	2	8	3134707	3134714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15039	NC_002929	AAC	2	6	3135706	3135711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15040	NC_002929	CG	3	6	3135724	3135729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15041	NC_002929	ATG	2	6	3135795	3135800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_002929	GC	3	6	3136996	3137001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15043	NC_002929	GCGCG	2	10	3137705	3137714	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15044	NC_002929	GTG	2	6	3137735	3137740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_002929	CTG	2	6	3137756	3137761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_002929	CCG	2	6	3137775	3137780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15047	NC_002929	CAA	2	6	3137797	3137802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15048	NC_002929	TGG	3	9	3137925	3137933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_002929	CGC	2	6	3137950	3137955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15050	NC_002929	CCGC	2	8	3137968	3137975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15051	NC_002929	GC	3	6	3137980	3137985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15052	NC_002929	GTG	2	6	3137987	3137992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_002929	CTGG	2	8	3137995	3138002	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15054	NC_002929	CG	3	6	3138011	3138016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15055	NC_002929	GC	3	6	3138051	3138056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15056	NC_002929	CGC	3	9	3138061	3138069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15057	NC_002929	CCA	3	9	3138103	3138111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15058	NC_002929	TGCC	2	8	3138113	3138120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15059	NC_002929	CG	3	6	3138145	3138150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15060	NC_002929	GGA	2	6	3138175	3138180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_002929	CCG	2	6	3138210	3138215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15062	NC_002929	CG	3	6	3138245	3138250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15063	NC_002929	CG	3	6	3138258	3138263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15064	NC_002929	CG	3	6	3138271	3138276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15065	NC_002929	GC	3	6	3138291	3138296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15066	NC_002929	TGG	2	6	3138301	3138306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_002929	GCGCC	2	10	3138314	3138323	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15068	NC_002929	CTGG	2	8	3138347	3138354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15069	NC_002929	CGG	2	6	3138418	3138423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_002929	CGC	2	6	3138430	3138435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15071	NC_002929	GGC	2	6	3138443	3138448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15072	NC_002929	GC	4	8	3138463	3138470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15073	NC_002929	GCC	2	6	3138478	3138483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15074	NC_002929	GCTGGC	2	12	3138536	3138547	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15075	NC_002929	GC	3	6	3138546	3138551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15076	NC_002929	GC	3	6	3138596	3138601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15077	NC_002929	TCGGC	2	10	3138607	3138616	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15078	NC_002929	CCA	2	6	3138617	3138622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15079	NC_002929	GCG	2	6	3138626	3138631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15080	NC_002929	GCC	2	6	3138640	3138645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15081	NC_002929	GCC	2	6	3138666	3138671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15082	NC_002929	CGC	2	6	3138687	3138692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15083	NC_002929	GC	3	6	3139182	3139187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15084	NC_002929	GAT	2	6	3139198	3139203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_002929	TAA	2	6	3139214	3139219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_002929	CG	3	6	3139220	3139225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15087	NC_002929	GC	3	6	3139237	3139242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15088	NC_002929	A	6	6	3139278	3139283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_002929	CGG	3	9	3139310	3139318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_002929	GTAG	2	8	3140603	3140610	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_002929	TGC	2	6	3140632	3140637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15092	NC_002929	ACAGCG	2	12	3140652	3140663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15093	NC_002929	C	13	13	3140664	3140676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15094	NC_002929	CAAG	2	8	3140785	3140792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15095	NC_002929	A	6	6	3142759	3142764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_002929	ACT	2	6	3142774	3142779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15097	NC_002929	GTTT	2	8	3142875	3142882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_002929	C	7	7	3142965	3142971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15099	NC_002929	CCGG	2	8	3142988	3142995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15100	NC_002929	GC	3	6	3143983	3143988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15101	NC_002929	T	6	6	3144028	3144033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_002929	CG	3	6	3146655	3146660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15103	NC_002929	CGGCC	2	10	3147891	3147900	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15104	NC_002929	A	6	6	3149010	3149015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_002929	CGC	2	6	3149042	3149047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15106	NC_002929	GAC	2	6	3149065	3149070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_002929	CGC	2	6	3149086	3149091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15108	NC_002929	TTTGC	2	10	3150012	3150021	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15109	NC_002929	T	6	6	3150039	3150044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_002929	TTA	2	6	3150131	3150136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_002929	CCCG	2	8	3150137	3150144	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15112	NC_002929	CAAA	2	8	3150155	3150162	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15113	NC_002929	GCT	2	6	3150187	3150192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15114	NC_002929	GC	3	6	3150207	3150212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15115	NC_002929	CAG	2	6	3150232	3150237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_002929	GCC	2	6	3150240	3150245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15117	NC_002929	GGC	2	6	3150252	3150257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_002929	CGG	2	6	3150275	3150280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15119	NC_002929	CTC	2	6	3151391	3151396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15120	NC_002929	GCC	2	6	3151494	3151499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15121	NC_002929	TGC	2	6	3151513	3151518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_002929	TC	3	6	3151533	3151538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15123	NC_002929	CGGG	2	8	3151542	3151549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15124	NC_002929	CCGG	2	8	3151632	3151639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15125	NC_002929	GCCGGC	2	12	3151703	3151714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15126	NC_002929	GGA	2	6	3151716	3151721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_002929	GCC	2	6	3153700	3153705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15128	NC_002929	GA	3	6	3154432	3154437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_002929	AGG	2	6	3154615	3154620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15131	NC_002929	GCT	2	6	3154661	3154666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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