MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_002929	CG	3	6	3009341	3009346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14502	NC_002929	AGCGC	2	10	3009419	3009428	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14503	NC_002929	GCT	2	6	3009459	3009464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14504	NC_002929	CCG	2	6	3009500	3009505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14505	NC_002929	ATG	2	6	3009506	3009511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_002929	GCC	2	6	3009517	3009522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14507	NC_002929	GC	3	6	3009553	3009558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14508	NC_002929	CTG	2	6	3009583	3009588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_002929	TCG	2	6	3009623	3009628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_002929	C	7	7	3009806	3009812	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14511	NC_002929	CCGG	2	8	3009829	3009836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14512	NC_002929	TG	3	6	3009915	3009920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_002929	GC	3	6	3010104	3010109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14514	NC_002929	CAGC	2	8	3010132	3010139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14515	NC_002929	GCCG	2	8	3010193	3010200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14516	NC_002929	GGT	2	6	3010205	3010210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_002929	CTG	2	6	3010239	3010244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_002929	AAG	2	6	3010257	3010262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_002929	CTTCGT	2	12	3010337	3010348	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_002929	CGA	2	6	3010394	3010399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_002929	CTA	2	6	3010442	3010447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_002929	CGC	2	6	3010517	3010522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14523	NC_002929	CCA	2	6	3010709	3010714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14524	NC_002929	GC	3	6	3010724	3010729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14525	NC_002929	CTA	2	6	3010856	3010861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_002929	GTC	2	6	3010911	3010916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_002929	CG	3	6	3010920	3010925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14528	NC_002929	CAG	2	6	3010928	3010933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_002929	CCT	2	6	3010951	3010956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14530	NC_002929	TCG	2	6	3011103	3011108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_002929	GC	3	6	3013158	3013163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14532	NC_002929	GC	3	6	3013209	3013214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14533	NC_002929	ATCGC	2	10	3013230	3013239	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14534	NC_002929	CGGC	2	8	3013241	3013248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14535	NC_002929	GC	4	8	3013266	3013273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14536	NC_002929	GCG	2	6	3013288	3013293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14537	NC_002929	TCGGC	2	10	3013309	3013318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14538	NC_002929	GGCT	2	8	3013328	3013335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14539	NC_002929	CGGG	2	8	3013343	3013350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14540	NC_002929	GGC	2	6	3013392	3013397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_002929	GCG	2	6	3013398	3013403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14542	NC_002929	TGC	2	6	3013406	3013411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_002929	CCGG	2	8	3013436	3013443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14544	NC_002929	GTG	2	6	3013462	3013467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_002929	CGA	2	6	3013517	3013522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14546	NC_002929	AGCT	2	8	3013545	3013552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14547	NC_002929	GGCGCG	2	12	3013600	3013611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_002929	CAGGA	2	10	3014123	3014132	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14549	NC_002929	GGCAA	2	10	3014928	3014937	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14550	NC_002929	TA	3	6	3017748	3017753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_002929	GCA	2	6	3018630	3018635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14553	NC_002929	CCA	2	6	3018712	3018717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14554	NC_002929	TAG	2	6	3018740	3018745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_002929	GC	3	6	3018895	3018900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14556	NC_002929	ATT	2	6	3018912	3018917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_002929	AAG	2	6	3019009	3019014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_002929	GGCGA	2	10	3019020	3019029	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14559	NC_002929	CG	3	6	3019041	3019046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14560	NC_002929	A	6	6	3019049	3019054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_002929	CTG	2	6	3019064	3019069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14564	NC_002929	TCA	2	6	3019258	3019263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_002929	CGC	2	6	3019264	3019269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14566	NC_002929	GCA	2	6	3019277	3019282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14567	NC_002929	CCA	2	6	3019355	3019360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14568	NC_002929	CGT	2	6	3019370	3019375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14569	NC_002929	CCG	2	6	3019400	3019405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14570	NC_002929	CGC	2	6	3019586	3019591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14571	NC_002929	CGT	2	6	3019610	3019615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_002929	GCC	2	6	3019632	3019637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14573	NC_002929	TCG	2	6	3019690	3019695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14574	NC_002929	GC	5	10	3019745	3019754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14575	NC_002929	T	6	6	3019764	3019769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_002929	CCG	2	6	3019787	3019792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14577	NC_002929	GTG	3	9	3019820	3019828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_002929	CG	3	6	3019847	3019852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14579	NC_002929	TGA	2	6	3019925	3019930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14582	NC_002929	GGCT	2	8	3020006	3020013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14583	NC_002929	CG	3	6	3020037	3020042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14584	NC_002929	TCG	2	6	3020195	3020200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14586	NC_002929	TGCC	2	8	3020253	3020260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14587	NC_002929	GCC	2	6	3020344	3020349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14588	NC_002929	CCTGC	2	10	3020401	3020410	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14589	NC_002929	GCCG	2	8	3020427	3020434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14590	NC_002929	CCG	2	6	3020594	3020599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14598	NC_002929	CGA	2	6	3021016	3021021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14599	NC_002929	CGG	2	6	3021046	3021051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14603	NC_002929	GAT	2	6	3021187	3021192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14605	NC_002929	AC	3	6	3021202	3021207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14606	NC_002929	GCG	2	6	3021209	3021214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14607	NC_002929	CG	3	6	3021238	3021243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14608	NC_002929	CCA	2	6	3021260	3021265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14609	NC_002929	CG	3	6	3021281	3021286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14610	NC_002929	CCG	2	6	3021353	3021358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14611	NC_002929	GCC	2	6	3021393	3021398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14612	NC_002929	GCGG	2	8	3021399	3021406	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14613	NC_002929	CGG	2	6	3021416	3021421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14614	NC_002929	CCGG	2	8	3022391	3022398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14615	NC_002929	G	6	6	3022415	3022420	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_002929	GGC	2	6	3022532	3022537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14618	NC_002929	TCA	2	6	3022559	3022564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14619	NC_002929	CGA	2	6	3022620	3022625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14622	NC_002929	GCT	2	6	3022748	3022753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14623	NC_002929	AGGC	2	8	3022769	3022776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14624	NC_002929	ATTGCC	2	12	3022803	3022814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14627	NC_002929	AGGT	2	8	3023023	3023030	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14629	NC_002929	GTT	2	6	3023226	3023231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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