MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_002929	GCC	2	6	2694140	2694145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_002929	ACGGAT	2	12	2694154	2694165	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13003	NC_002929	CCG	2	6	2694169	2694174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13004	NC_002929	ATC	2	6	2696521	2696526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_002929	AATCAA	2	12	2696535	2696546	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13006	NC_002929	TAT	2	6	2696568	2696573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_002929	CGA	2	6	2696591	2696596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_002929	CGC	2	6	2696609	2696614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13009	NC_002929	GCC	2	6	2696625	2696630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13010	NC_002929	GCAA	2	8	2697572	2697579	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13011	NC_002929	CAGG	2	8	2697584	2697591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13012	NC_002929	CG	3	6	2697603	2697608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13013	NC_002929	CCG	2	6	2697609	2697614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_002929	GCG	2	6	2699314	2699319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_002929	GCAG	2	8	2699336	2699343	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13016	NC_002929	AT	3	6	2699435	2699440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_002929	CCG	2	6	2699518	2699523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_002929	CG	3	6	2700233	2700238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13019	NC_002929	AAG	2	6	2700251	2700256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_002929	TGCGC	2	10	2700264	2700273	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13021	NC_002929	CG	3	6	2700281	2700286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_002929	CGC	3	9	2700299	2700307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_002929	GCT	2	6	2700315	2700320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_002929	CG	3	6	2701730	2701735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13025	NC_002929	CGGC	2	8	2701834	2701841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_002929	CAC	2	6	2701865	2701870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_002929	GAG	2	6	2701882	2701887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_002929	CCG	2	6	2703580	2703585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13029	NC_002929	T	10	10	2703634	2703643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_002929	GCC	2	6	2703644	2703649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13031	NC_002929	GCC	2	6	2703652	2703657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13032	NC_002929	A	6	6	2703665	2703670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_002929	CCT	2	6	2703672	2703677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13034	NC_002929	G	6	6	2703679	2703684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_002929	T	7	7	2703720	2703726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_002929	CGGC	2	8	2703782	2703789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13037	NC_002929	GCA	2	6	2703790	2703795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13039	NC_002929	TTC	2	6	2707450	2707455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_002929	GCT	2	6	2711333	2711338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_002929	CAA	2	6	2711369	2711374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_002929	CTC	2	6	2711460	2711465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_002929	ATC	2	6	2711505	2711510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_002929	CG	3	6	2712402	2712407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13045	NC_002929	AAG	2	6	2712421	2712426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_002929	TC	3	6	2712528	2712533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_002929	GTG	2	6	2714211	2714216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_002929	GTGTC	2	10	2714265	2714274	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13049	NC_002929	CGA	2	6	2714283	2714288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13052	NC_002929	GGA	2	6	2716591	2716596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_002929	ATT	2	6	2716621	2716626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13055	NC_002929	T	6	6	2716651	2716656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_002929	TA	3	6	2716660	2716665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_002929	ACGG	2	8	2717560	2717567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13058	NC_002929	GCC	2	6	2717596	2717601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13059	NC_002929	GGC	2	6	2717621	2717626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_002929	GGCT	2	8	2717639	2717646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13061	NC_002929	CGC	2	6	2717648	2717653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13062	NC_002929	CGG	2	6	2717836	2717841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_002929	GCG	2	6	2717872	2717877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_002929	GCA	2	6	2717886	2717891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_002929	TGCG	2	8	2717912	2717919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13066	NC_002929	CGG	2	6	2718714	2718719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_002929	GCCG	2	8	2718726	2718733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_002929	AAG	2	6	2719246	2719251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_002929	GC	3	6	2719266	2719271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13070	NC_002929	CTGCGA	2	12	2719276	2719287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_002929	CGA	2	6	2719378	2719383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_002929	TGA	2	6	2719410	2719415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13074	NC_002929	GCC	3	9	2719505	2719513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_002929	GC	4	8	2719515	2719522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13076	NC_002929	CGC	2	6	2719564	2719569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13077	NC_002929	CG	3	6	2719609	2719614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_002929	CCA	2	6	2719620	2719625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13079	NC_002929	GCC	2	6	2719660	2719665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13080	NC_002929	GGC	2	6	2719674	2719679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_002929	GCCCC	2	10	2719683	2719692	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13082	NC_002929	AGCG	2	8	2719754	2719761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_002929	CCGCG	2	10	2719813	2719822	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13084	NC_002929	CTGT	2	8	2719845	2719852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13085	NC_002929	GTT	2	6	2719887	2719892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13088	NC_002929	T	6	6	2720996	2721001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_002929	CGT	2	6	2721002	2721007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13093	NC_002929	TCA	2	6	2721119	2721124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_002929	C	6	6	2721166	2721171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13095	NC_002929	CG	3	6	2721193	2721198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13096	NC_002929	CG	3	6	2721207	2721212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13097	NC_002929	A	6	6	2721999	2722004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_002929	CAAT	2	8	2723218	2723225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13099	NC_002929	CAGC	2	8	2723265	2723272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13100	NC_002929	GCG	2	6	2723301	2723306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_002929	GTGAT	2	10	2723353	2723362	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_002929	ACT	2	6	2723379	2723384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13107	NC_002929	GGC	2	6	2723591	2723596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_002929	ATGT	2	8	2727962	2727969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_002929	TGC	2	6	2728658	2728663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_002929	GGC	2	6	2728718	2728723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_002929	A	6	6	2728764	2728769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_002929	TCGCT	2	10	2728811	2728820	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13113	NC_002929	CCGG	2	8	2729835	2729842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13114	NC_002929	G	7	7	2729859	2729865	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_002929	CCGG	2	8	2731426	2731433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13116	NC_002929	G	6	6	2731450	2731455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_002929	CGC	2	6	2732987	2732992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13118	NC_002929	GCCC	2	8	2733006	2733013	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13119	NC_002929	GC	3	6	2733051	2733056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13120	NC_002929	AGA	2	6	2733080	2733085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_002929	C	6	6	2733454	2733459	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13122	NC_002929	CCGG	2	8	2733476	2733483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13123	NC_002929	GTT	2	6	2734465	2734470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_002929	GGGC	2	8	2734547	2734554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13125	NC_002929	GC	3	6	2734559	2734564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13126	NC_002929	GC	3	6	2734583	2734588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_002929	GCA	2	6	2734603	2734608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_002929	GAT	2	6	2734612	2734617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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