MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_002929	GCG	2	6	2281760	2281765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_002929	AC	3	6	2281927	2281932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11504	NC_002929	CCGG	2	8	2282012	2282019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11505	NC_002929	G	7	7	2282036	2282042	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_002929	CGGCTG	2	12	2282115	2282126	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_002929	CCGG	2	8	2282144	2282151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_002929	CTG	2	6	2282172	2282177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_002929	GGC	2	6	2282178	2282183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_002929	TTC	2	6	2282190	2282195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_002929	CTG	2	6	2282196	2282201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_002929	CGG	2	6	2282214	2282219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_002929	GCC	2	6	2282254	2282259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11514	NC_002929	CGG	2	6	2282265	2282270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_002929	CAG	2	6	2282293	2282298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_002929	CGGCGT	2	12	2282346	2282357	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_002929	GC	4	8	2282369	2282376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11518	NC_002929	GCCG	2	8	2282433	2282440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11519	NC_002929	AAG	2	6	2282452	2282457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_002929	GC	3	6	2282481	2282486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11522	NC_002929	GCG	2	6	2282504	2282509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_002929	GCC	2	6	2282533	2282538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_002929	GAT	2	6	2282599	2282604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11526	NC_002929	GCCCA	2	10	2282624	2282633	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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11529	NC_002929	GCC	2	6	2282675	2282680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11531	NC_002929	GCG	3	9	2282698	2282706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_002929	GC	3	6	2282714	2282719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11533	NC_002929	GCCAG	2	10	2282733	2282742	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11534	NC_002929	CCA	2	6	2282745	2282750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11535	NC_002929	CCG	2	6	2282751	2282756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11536	NC_002929	GCC	2	6	2282785	2282790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11541	NC_002929	GC	3	6	2286639	2286644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11542	NC_002929	CGGC	2	8	2286677	2286684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11543	NC_002929	CCGG	2	8	2288933	2288940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11544	NC_002929	G	6	6	2288957	2288962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_002929	GC	3	6	2289039	2289044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11546	NC_002929	GGC	2	6	2289064	2289069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11548	NC_002929	TCCC	2	8	2289091	2289098	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11549	NC_002929	CG	3	6	2290218	2290223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11552	NC_002929	TGA	2	6	2290336	2290341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_002929	GCAA	2	8	2290359	2290366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11554	NC_002929	CAT	2	6	2290406	2290411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_002929	TGTGG	2	10	2290415	2290424	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_002929	TCG	2	6	2290429	2290434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_002929	ATTG	2	8	2290451	2290458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11559	NC_002929	GTG	2	6	2290590	2290595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11561	NC_002929	GGT	2	6	2290661	2290666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_002929	GGC	2	6	2290673	2290678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11565	NC_002929	TTC	2	6	2290785	2290790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11569	NC_002929	CTT	2	6	2290985	2290990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11580	NC_002929	GAT	2	6	2291416	2291421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11585	NC_002929	GTG	2	6	2291525	2291530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11589	NC_002929	TCG	2	6	2291619	2291624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11591	NC_002929	TAC	2	6	2291648	2291653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11594	NC_002929	GCGCG	2	10	2291728	2291737	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11595	NC_002929	CG	4	8	2291734	2291741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11596	NC_002929	CG	3	6	2291777	2291782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_002929	CGG	2	6	2291802	2291807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_002929	GAG	2	6	2291823	2291828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_002929	CG	3	6	2293613	2293618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11600	NC_002929	CGGC	2	8	2293639	2293646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11601	NC_002929	CGG	2	6	2293655	2293660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_002929	CG	3	6	2293667	2293672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_002929	GCCC	2	8	2295240	2295247	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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11607	NC_002929	GGCG	2	8	2296534	2296541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11608	NC_002929	CCG	2	6	2297058	2297063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11609	NC_002929	GC	3	6	2297099	2297104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11610	NC_002929	TCC	2	6	2297138	2297143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11611	NC_002929	GC	4	8	2298840	2298847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11612	NC_002929	GC	3	6	2299967	2299972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_002929	GC	3	6	2300003	2300008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11614	NC_002929	CGGC	2	8	2300025	2300032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11615	NC_002929	CCGG	2	8	2300129	2300136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11616	NC_002929	GAA	3	9	2301498	2301506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_002929	TCG	2	6	2301544	2301549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_002929	CTT	2	6	2301576	2301581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_002929	GCC	2	6	2301682	2301687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11621	NC_002929	GA	3	6	2301730	2301735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_002929	CGC	2	6	2302058	2302063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11624	NC_002929	C	7	7	2302143	2302149	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11625	NC_002929	CAC	2	6	2302314	2302319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11626	NC_002929	CAAAA	2	10	2302320	2302329	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11627	NC_002929	C	6	6	2302373	2302378	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11628	NC_002929	GCT	2	6	2302414	2302419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11630	NC_002929	ACG	2	6	2304849	2304854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11631	NC_002929	CGCTG	2	10	2304855	2304864	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11632	NC_002929	GCCCG	2	10	2304873	2304882	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11633	NC_002929	CG	3	6	2304968	2304973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11634	NC_002929	GCT	2	6	2305025	2305030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11639	NC_002929	CCGGC	2	10	2305171	2305180	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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11642	NC_002929	CATTC	2	10	2305289	2305298	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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11646	NC_002929	CTGG	2	8	2307933	2307940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11656	NC_002929	TTTG	2	8	2314960	2314967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11664	NC_002929	TTGC	2	8	2324374	2324381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11673	NC_002929	CGG	2	6	2328236	2328241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11755	NC_002929	GC	3	6	2332794	2332799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11756	NC_002929	CGC	2	6	2332850	2332855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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