MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) plasmid pLeu

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002253	ATT	2	6	6	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002253	T	7	7	10	16	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002253	A	7	7	17	23	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002253	A	6	6	43	48	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002253	T	9	9	57	65	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002253	TATT	2	8	85	92	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002253	T	7	7	91	97	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002253	ATTT	2	8	125	132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002253	AAG	2	6	137	142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002253	A	8	8	151	158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002253	ATTT	3	12	167	178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002253	T	6	6	176	181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002253	A	7	7	186	192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002253	T	9	9	206	214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002253	A	6	6	219	224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002253	A	9	9	246	254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002253	G	7	7	255	261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002253	A	6	6	290	295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002253	AAGA	2	8	319	326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002253	TAAA	2	8	334	341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002253	T	6	6	1229	1234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002253	AT	3	6	1235	1240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002253	AT	3	6	1246	1251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002253	ATTTT	2	10	1255	1264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002253	AAT	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002253	T	7	7	1284	1290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002253	AT	3	6	1301	1306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002253	ACTTT	2	10	1307	1316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_002253	T	9	9	1319	1327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002253	AATA	2	8	1331	1338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002253	A	6	6	1347	1352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002253	AT	3	6	1356	1361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002253	ACAT	2	8	1367	1374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_002253	ATT	2	6	1379	1384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002253	TTAAA	2	10	1430	1439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002253	AT	3	6	1444	1449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002253	T	6	6	1480	1485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002253	A	8	8	2027	2034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002253	T	9	9	2039	2047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002253	A	7	7	2048	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002253	AT	3	6	2078	2083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002253	CTT	2	6	2099	2104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002253	A	7	7	2107	2113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002253	TTAA	2	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002253	A	6	6	2149	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002253	TA	5	10	2156	2165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002253	T	6	6	2177	2182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002253	GAAA	2	8	2198	2205	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002253	A	7	7	2203	2209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002253	ATTT	2	8	2215	2222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002253	A	6	6	2234	2239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002253	ATT	2	6	2281	2286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002253	TAAA	2	8	2334	2341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002253	CAT	2	6	2925	2930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002253	ATT	2	6	2938	2943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002253	ATG	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002253	ATTT	2	8	2980	2987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002253	ATA	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002253	T	6	6	4617	4622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002253	TTA	2	6	4631	4636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.