MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp26

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001903	TA	3	6	758	763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001903	TTA	2	6	769	774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001903	AT	3	6	801	806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001903	A	7	7	824	830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001903	A	6	6	2227	2232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001903	A	7	7	2244	2250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001903	TA	3	6	2257	2262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001903	TTAAA	2	10	2263	2272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001903	TA	3	6	2274	2279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001903	ATA	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001903	TTA	2	6	2339	2344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001903	ATA	2	6	2359	2364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001903	TAAA	2	8	2377	2384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001903	A	7	7	2399	2405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001903	CT	3	6	2423	2428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_001903	A	7	7	2465	2471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001903	TCC	2	6	3807	3812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_001903	TAAT	2	8	3835	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001903	TAT	2	6	3856	3861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001903	TC	3	6	3873	3878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_001903	TAAT	2	8	3901	3908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001903	TAA	2	6	3924	3929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001903	TAAT	2	8	3937	3944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001903	ATA	2	6	3952	3957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001903	AT	3	6	3971	3976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001903	TAA	2	6	3980	3985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001903	ATT	2	6	3987	3992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001903	AT	3	6	4001	4006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001903	TATAA	2	10	4009	4018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001903	AT	3	6	4029	4034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001903	ATA	2	6	4038	4043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001903	ATT	2	6	4047	4052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001903	TAAA	2	8	4059	4066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001903	TAC	2	6	4447	4452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_001903	TAA	2	6	5873	5878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001903	ATA	3	9	5921	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001903	CT	3	6	5945	5950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_001903	AT	3	6	5981	5986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001903	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001903	ATT	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001903	GTC	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_001903	ATA	2	6	6075	6080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001903	T	7	7	6127	6133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001903	AATTTA	2	12	6192	6203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001903	A	8	8	6209	6216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001903	TAA	2	6	6233	6238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001903	T	6	6	6245	6250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001903	ATT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001903	TAAAA	2	10	6296	6305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001903	A	7	7	6302	6308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001903	AAT	2	6	6313	6318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001903	TTA	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001903	TAA	2	6	6436	6441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001903	GAA	2	6	6447	6452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001903	A	7	7	6474	6480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001903	TAA	2	6	6481	6486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001903	AAAAT	2	10	6492	6501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001903	T	8	8	6507	6514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001903	AT	3	6	6545	6550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001903	TAA	2	6	6594	6599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001903	ATT	2	6	6620	6625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001903	AAATT	2	10	6632	6641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001903	TA	3	6	6650	6655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001903	CAA	2	6	7750	7755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_001903	ACTTT	2	10	7757	7766	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_001903	T	6	6	7764	7769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001903	ATA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001903	A	9	9	8798	8806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001903	T	6	6	8807	8812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001903	CAA	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_001903	ATT	2	6	8841	8846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001903	CA	3	6	8850	8855	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_001903	ATAA	2	8	8871	8878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001903	A	6	6	8895	8900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001903	AT	3	6	8926	8931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001903	TAA	3	9	8933	8941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001903	A	6	6	8940	8945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001903	ATTT	2	8	8959	8966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001903	T	6	6	8998	9003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001903	ATT	2	6	9040	9045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001903	A	8	8	9059	9066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001903	A	8	8	9077	9084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001903	A	6	6	9108	9113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001903	T	6	6	9121	9126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001903	AAG	2	6	9134	9139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001903	A	6	6	9161	9166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001903	T	6	6	9178	9183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001903	AGAA	2	8	9197	9204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001903	GAA	3	9	9216	9224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001903	A	6	6	9243	9248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001903	TAA	2	6	9257	9262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001903	A	6	6	10684	10689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001903	A	7	7	10709	10715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001903	TA	3	6	10724	10729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001903	TA	3	6	10736	10741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001903	TTG	2	6	10765	10770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001903	AAT	2	6	10780	10785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001903	AAT	2	6	10839	10844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001903	ATTT	2	8	10879	10886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001903	AAAT	2	8	10895	10902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001903	A	6	6	10914	10919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001903	A	7	7	11434	11440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001903	ATA	3	9	11457	11465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001903	T	6	6	11468	11473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001903	T	6	6	11508	11513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001903	ATT	2	6	11527	11532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001903	AT	3	6	11581	11586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001903	TTTAG	2	10	11681	11690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001903	T	6	6	11704	11709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001903	ATTT	2	8	11724	11731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001903	T	7	7	11729	11735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001903	A	6	6	11739	11744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001903	TAA	2	6	11745	11750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001903	TAAA	2	8	11754	11761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001903	ATAA	2	8	11778	11785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001903	ATT	2	6	11797	11802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001903	T	6	6	11801	11806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001903	TAA	2	6	11814	11819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001903	AGCA	2	8	11829	11836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_001903	ATT	2	6	11870	11875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001903	ATTTT	2	10	11900	11909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001903	AAT	2	6	11912	11917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001903	TAA	2	6	11929	11934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001903	AT	3	6	11957	11962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001903	AAATTT	2	12	11978	11989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001903	ATT	2	6	13703	13708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001903	ATT	3	9	13714	13722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001903	AT	3	6	13743	13748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001903	TATT	2	8	13785	13792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001903	GTT	2	6	13810	13815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001903	AAG	2	6	13826	13831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001903	GTTA	2	8	13859	13866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001903	T	6	6	13883	13888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001903	TA	3	6	16668	16673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001903	TAAA	2	8	16680	16687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001903	T	7	7	16695	16701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001903	TTC	2	6	16786	16791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_001903	GAA	2	6	16811	16816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001903	A	6	6	16821	16826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001903	T	6	6	16830	16835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001903	A	6	6	16841	16846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001903	TTG	2	6	16860	16865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001903	TAA	2	6	16869	16874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001903	ATAA	2	8	16878	16885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001903	AGG	2	6	16888	16893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001903	A	6	6	17568	17573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001903	AAGA	2	8	17604	17611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_001903	T	7	7	17626	17632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_001903	A	6	6	17641	17646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_001903	CTCTT	2	10	17674	17683	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_001903	TTA	2	6	17697	17702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_001903	TAA	2	6	17713	17718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_001903	ATA	2	6	17817	17822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_001903	GTT	2	6	17857	17862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_001903	A	6	6	17881	17886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_001903	T	6	6	17896	17901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_001903	T	8	8	17942	17949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_001903	ATAA	2	8	17950	17957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_001903	CTC	2	6	19331	19336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_001903	ATTTT	2	10	19339	19348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_001903	TATT	2	8	19371	19378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_001903	TAA	3	9	19390	19398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_001903	AT	3	6	19400	19405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_001903	AAT	3	9	20821	20829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_001903	TTATA	2	10	21859	21868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_001903	TAAAG	2	10	23185	23194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_001903	TAAA	2	8	23195	23202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_001903	TGA	2	6	24515	24520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_001903	ATTT	2	8	24559	24566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_001903	AAT	2	6	24582	24587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_001903	T	6	6	24664	24669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_001903	ATTA	2	8	24776	24783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_001903	TAAT	3	12	24787	24798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_001903	TAA	2	6	24806	24811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_001903	ATATA	2	10	26464	26473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.