MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	ACT	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_001855	TA	3	6	12	17	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001855	TTTA	2	8	82	89	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001855	AT	3	6	116	121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001855	AAT	2	6	135	140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001855	TAT	2	6	141	146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001855	TAA	2	6	150	155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001855	AAAT	2	8	1123	1130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001855	TAAAT	2	10	1139	1148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001855	TG	3	6	1161	1166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001855	TCA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_001855	TTC	2	6	1233	1238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_001855	AAT	2	6	1242	1247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001855	TTA	2	6	1260	1265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001855	TCT	2	6	1280	1285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_001855	T	6	6	1288	1293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001855	TCT	2	6	1334	1339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_001855	ATT	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001855	TTTTCT	2	12	1382	1393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_001855	CTT	3	9	1437	1445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_001855	TCT	2	6	1630	1635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_001855	ATA	2	6	1673	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001855	AAT	2	6	1679	1684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001855	T	6	6	1684	1689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001855	TA	4	8	1720	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001855	ATC	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_001855	T	6	6	1864	1869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001855	CTTT	2	8	1892	1899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_001855	A	6	6	1915	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001855	ATT	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001855	CT	3	6	2023	2028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_001855	TTA	2	6	2075	2080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001855	TAT	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001855	TTTGA	2	10	2143	2152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001855	TTTC	2	8	2214	2221	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_001855	TA	4	8	2357	2364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001855	AT	3	6	2385	2390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001855	TAAGT	2	10	2444	2453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001855	GCC	2	6	2455	2460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_001855	C	7	7	2513	2519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_001855	ATT	2	6	2553	2558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001855	GAT	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001855	AGT	2	6	2623	2628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001855	TCA	2	6	2704	2709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_001855	GGA	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001855	CTT	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_001855	A	6	6	2790	2795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001855	TAA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001855	T	7	7	2822	2828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001855	T	6	6	2832	2837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001855	ATTA	2	8	2884	2891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001855	TTAA	2	8	2951	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001855	ATT	2	6	2966	2971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001855	ATT	2	6	2977	2982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001855	ATTTTC	2	12	2986	2997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_001855	TCT	2	6	3035	3040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_001855	TAAT	2	8	3050	3057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001855	T	6	6	3066	3071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001855	TCT	2	6	3080	3085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_001855	T	6	6	3110	3115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001855	A	7	7	3238	3244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001855	AT	3	6	3287	3292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001855	ATATT	2	10	3370	3379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001855	T	6	6	3378	3383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001855	TAA	2	6	3392	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001855	T	9	9	3420	3428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001855	A	6	6	3492	3497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001855	TTC	2	6	3560	3565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_001855	TCT	2	6	3597	3602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_001855	TTTC	2	8	3623	3630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_001855	CTT	2	6	3709	3714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_001855	AATA	2	8	3718	3725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001855	TAG	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001855	TAT	2	6	3785	3790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001855	AAT	2	6	3864	3869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001855	AAAT	2	8	3900	3907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001855	AT	3	6	3912	3917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001855	TAA	2	6	3944	3949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001855	ATT	3	9	3952	3960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001855	CAAA	2	8	3970	3977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_001855	AGA	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001855	T	7	7	4032	4038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001855	TAA	2	6	4053	4058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001855	TCT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_001855	AGA	2	6	4107	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001855	A	6	6	4115	4120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001855	TA	3	6	4127	4132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001855	ATTGA	2	10	4173	4182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001855	TAAAC	2	10	4185	4194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_001855	TAA	3	9	4223	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001855	TATT	2	8	4247	4254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001855	A	6	6	4265	4270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001855	A	8	8	4284	4291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001855	T	6	6	4332	4337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001855	AAT	2	6	4349	4354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001855	AAT	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001855	T	6	6	4423	4428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001855	GATT	2	8	4568	4575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001855	T	7	7	4574	4580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001855	A	7	7	4655	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001855	TAA	2	6	4686	4691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001855	ATA	2	6	4784	4789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001855	TAA	2	6	4792	4797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001855	ATTC	2	8	4818	4825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_001855	T	6	6	4826	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001855	TATT	2	8	4860	4867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001855	TCA	2	6	4874	4879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_001855	ATTTTG	2	12	4906	4917	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001855	TA	3	6	4949	4954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001855	A	11	11	5002	5012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001855	CAAA	2	8	5030	5037	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_001855	AGG	2	6	5067	5072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001855	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001855	AAT	2	6	5120	5125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001855	A	7	7	5171	5177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001855	T	8	8	5198	5205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001855	TTA	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001855	CCT	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_001855	AT	3	6	6072	6077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001855	T	7	7	6151	6157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001855	T	6	6	6181	6186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001855	CTT	2	6	6203	6208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_001855	T	7	7	6212	6218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001855	T	6	6	6223	6228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001855	T	6	6	6243	6248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001855	T	7	7	6264	6270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001855	T	7	7	6272	6278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001855	T	7	7	6666	6672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001855	AAAG	2	8	6725	6732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001855	T	6	6	6748	6753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001855	T	6	6	6755	6760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001855	TAAG	2	8	6777	6784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001855	A	6	6	6806	6811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001855	ATT	2	6	6831	6836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001855	TTCTTT	2	12	6837	6848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_001855	TATT	2	8	6884	6891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001855	TAAA	2	8	6918	6925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001855	CTG	2	6	6993	6998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_001855	TGT	2	6	7064	7069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001855	TAG	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001855	TAT	2	6	7136	7141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001855	TCT	2	6	7245	7250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_001855	TAA	2	6	7369	7374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001855	TGA	2	6	7406	7411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001855	A	6	6	7495	7500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001855	A	6	6	7569	7574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001855	A	7	7	7588	7594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_001855	CTC	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_001855	TCA	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_001855	A	6	6	7666	7671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001855	TAAT	2	8	7693	7700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_001855	GAA	2	6	7739	7744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_001855	A	6	6	7917	7922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_001855	ATG	2	6	7993	7998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_001855	A	6	6	8008	8013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_001855	TAAGC	2	10	8026	8035	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_001855	TA	4	8	8066	8073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_001855	GT	3	6	8090	8095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_001855	A	6	6	8144	8149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_001855	ATTT	2	8	8906	8913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_001855	TTAATA	2	12	8925	8936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_001855	A	6	6	18578	18583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_001855	TGA	2	6	18612	18617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_001855	TCT	2	6	26406	26411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_001855	CTTTT	2	10	26419	26428	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
453	NC_001855	CTT	2	6	26429	26434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_001855	T	6	6	26438	26443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_001855	TAA	2	6	26468	26473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_001855	T	7	7	26481	26487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_001855	GAA	2	6	26560	26565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
458	NC_001855	CTT	2	6	26575	26580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_001855	T	6	6	26579	26584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_001855	CTA	2	6	26865	26870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_001855	AGT	2	6	26885	26890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_001855	TAA	2	6	26900	26905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_001855	A	7	7	26948	26954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_001855	AT	5	10	27029	27038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_001855	AGAA	2	8	27155	27162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
468	NC_001855	GGACG	2	10	27194	27203	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
469	NC_001855	AAT	2	6	27275	27280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_001855	GTT	2	6	27284	27289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
471	NC_001855	A	6	6	27300	27305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_001855	TTAT	2	8	27340	27347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_001855	AAGT	2	8	27348	27355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
474	NC_001855	TCT	2	6	27362	27367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_001855	TAT	2	6	28300	28305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_001855	T	6	6	28352	28357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_001855	TAT	2	6	28385	28390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_001855	TAA	2	6	28392	28397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_001855	TTTA	2	8	28412	28419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_001855	AAG	2	6	28675	28680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_001855	TAT	2	6	28810	28815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_001855	AGA	2	6	28871	28876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
486	NC_001855	ATA	2	6	28890	28895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_001855	TTG	2	6	28934	28939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
488	NC_001855	CTG	2	6	28947	28952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_001855	CTA	2	6	28953	28958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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492	NC_001855	ATT	2	6	29021	29026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_001855	CTT	2	6	29227	29232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_001855	A	6	6	29263	29268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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