MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-4

Total Repeats: 457

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001854	ATA	2	6	53	58	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001854	T	6	6	119	124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001854	AAT	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001854	AT	3	6	651	656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001854	A	7	7	668	674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001854	A	6	6	678	683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001854	TAATA	2	10	711	720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001854	TA	3	6	1139	1144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001854	TAT	2	6	1172	1177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001854	AAT	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001854	AT	3	6	1263	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001854	A	7	7	1296	1302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001854	ATT	2	6	1305	1310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001854	CAAAA	2	10	1319	1328	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_001854	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001854	TAAA	2	8	1496	1503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001854	GAG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001854	ACA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_001854	TAA	2	6	1659	1664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001854	CAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_001854	AAACA	2	10	1710	1719	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_001854	A	6	6	1736	1741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001854	TAT	2	6	1750	1755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001854	TAA	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001854	A	6	6	1773	1778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001854	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001854	CTA	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_001854	AGCC	2	8	1922	1929	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_001854	C	6	6	1928	1933	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_001854	T	6	6	2065	2070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001854	ATC	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_001854	TTTAAT	2	12	2117	2128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001854	A	6	6	2129	2134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001854	TTAA	2	8	2188	2195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001854	ATA	2	6	2299	2304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001854	TA	4	8	2318	2325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001854	T	8	8	2333	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001854	ATT	2	6	2364	2369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001854	ACAA	2	8	2428	2435	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_001854	ATT	2	6	2464	2469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001854	ATA	2	6	2490	2495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001854	TAA	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001854	A	6	6	2510	2515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001854	TTAA	2	8	3353	3360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001854	T	8	8	3381	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001854	T	6	6	3390	3395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001854	TCT	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_001854	TAG	2	6	3430	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001854	TAA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001854	TTA	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001854	TTA	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001854	TTC	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_001854	TAA	2	6	3551	3556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001854	TCT	2	6	3559	3564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_001854	T	7	7	3587	3593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001854	TTA	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001854	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001854	TAA	2	6	3692	3697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001854	TAA	2	6	3780	3785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001854	AAAAG	2	10	3800	3809	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001854	GATT	2	8	3885	3892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001854	TCA	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_001854	GAT	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001854	AGC	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_001854	GTA	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001854	AAT	2	6	4073	4078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001854	TAA	2	6	4089	4094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001854	A	6	6	4105	4110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001854	A	6	6	4139	4144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001854	TGA	2	6	4195	4200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001854	ATAAAA	2	12	4209	4220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001854	AAC	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_001854	TAAAA	2	10	4264	4273	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001854	A	6	6	4270	4275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001854	TGTT	2	8	4294	4301	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001854	T	6	6	4341	4346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001854	A	6	6	4375	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001854	AAAT	2	8	4384	4391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001854	CAG	2	6	4433	4438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_001854	GAA	3	9	4514	4522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001854	A	6	6	4528	4533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001854	GGC	2	6	4609	4614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_001854	A	6	6	4625	4630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001854	TA	3	6	4649	4654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001854	TTAAT	2	10	4655	4664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001854	T	6	6	4664	4669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001854	AATCAT	2	12	4830	4841	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_001854	TAT	2	6	4851	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001854	A	6	6	4861	4866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001854	A	6	6	4899	4904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001854	ATTAAT	2	12	4927	4938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001854	CCA	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_001854	AAT	2	6	4960	4965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001854	AT	3	6	4991	4996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001854	A	6	6	5072	5077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001854	TAA	2	6	5097	5102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001854	AGA	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001854	ATAA	2	8	5372	5379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001854	TA	3	6	5384	5389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001854	CATTG	2	10	5405	5414	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_001854	TC	3	6	5439	5444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_001854	A	6	6	5462	5467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001854	A	6	6	5523	5528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001854	TTTAC	2	10	5543	5552	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_001854	A	6	6	5584	5589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001854	CAAA	2	8	5599	5606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_001854	TA	4	8	5614	5621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001854	A	6	6	5621	5626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001854	A	6	6	5677	5682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001854	T	6	6	5690	5695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001854	AAT	2	6	5703	5708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001854	AAT	2	6	5738	5743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001854	ATA	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001854	TAT	2	6	5777	5782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001854	A	6	6	5784	5789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001854	TTAAA	2	10	5794	5803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001854	ATTAAA	2	12	5821	5832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001854	AGA	2	6	5866	5871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001854	ATT	2	6	5916	5921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001854	A	6	6	5928	5933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001854	A	7	7	5955	5961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001854	A	6	6	6004	6009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001854	AAT	2	6	6013	6018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001854	ATT	2	6	6052	6057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001854	T	6	6	6056	6061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001854	ATT	2	6	6093	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001854	TGT	2	6	6100	6105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001854	TAATA	2	10	6114	6123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001854	TATG	2	8	6178	6185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001854	TG	3	6	6184	6189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001854	T	6	6	6190	6195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001854	ATG	2	6	6223	6228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001854	AGC	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_001854	A	7	7	6242	6248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001854	ATAAA	2	10	6256	6265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001854	A	6	6	6263	6268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001854	AT	3	6	6272	6277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001854	A	6	6	6287	6292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001854	GATA	2	8	6302	6309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001854	ACT	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_001854	ACA	2	6	6370	6375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_001854	AGAT	2	8	6397	6404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001854	T	6	6	6431	6436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001854	GAT	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001854	A	6	6	6463	6468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001854	A	7	7	6566	6572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001854	TTA	2	6	6842	6847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_001854	TAA	2	6	6891	6896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_001854	A	6	6	6895	6900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_001854	ATT	2	6	6905	6910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001854	TAA	2	6	6928	6933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_001854	AAT	2	6	6950	6955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_001854	A	6	6	6959	6964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_001854	ATAA	2	8	6982	6989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_001854	TAA	2	6	7005	7010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_001854	ATCA	2	8	7025	7032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_001854	A	6	6	7055	7060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_001854	ATTT	2	8	7077	7084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_001854	TTAA	2	8	7088	7095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_001854	A	6	6	15321	15326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_001854	TAAA	2	8	15329	15336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_001854	ATA	2	6	15339	15344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_001854	T	6	6	16553	16558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_001854	TTTA	2	8	16691	16698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_001854	CA	3	6	16788	16793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
298	NC_001854	TAA	2	6	16836	16841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_001854	A	6	6	16840	16845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_001854	ATA	2	6	16967	16972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_001854	TAA	2	6	17070	17075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_001854	TTC	2	6	17150	17155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_001854	TTA	2	6	17193	17198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_001854	CTA	2	6	17406	17411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_001854	TAA	2	6	26285	26290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_001854	ATT	2	6	26326	26331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_001854	GTA	2	6	26335	26340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_001854	GTTT	2	8	26984	26991	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
449	NC_001854	T	6	6	27028	27033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_001854	TAAAC	2	10	27142	27151	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
452	NC_001854	T	6	6	27164	27169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_001854	ATT	2	6	27195	27200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_001854	TAT	2	6	27203	27208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_001854	A	6	6	27219	27224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_001854	CAA	2	6	27234	27239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_001854	T	6	6	27260	27265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.