MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp25

Total Repeats: 582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001850	TTA	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001850	AAG	2	6	110	115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001850	TCAAAT	2	12	200	211	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_001850	T	7	7	267	273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001850	T	6	6	282	287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001850	ATTTT	2	10	296	305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001850	T	6	6	302	307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001850	T	8	8	309	316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001850	TTAT	2	8	323	330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001850	A	6	6	334	339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001850	TAT	2	6	343	348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001850	AAT	2	6	355	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001850	AGA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001850	TCT	2	6	393	398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_001850	T	9	9	401	409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001850	CAAG	2	8	433	440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_001850	TAA	2	6	481	486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001850	ATT	2	6	488	493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001850	TTTTCT	2	12	498	509	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_001850	A	6	6	512	517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001850	TCT	2	6	522	527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_001850	TTA	2	6	546	551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001850	AAGTA	2	10	582	591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001850	T	6	6	639	644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001850	TTTCTT	2	12	676	687	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_001850	CAA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_001850	TCT	2	6	746	751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_001850	ATA	2	6	789	794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001850	AAT	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001850	T	6	6	800	805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001850	TCA	2	6	828	833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_001850	TA	4	8	836	843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001850	CA	3	6	851	856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_001850	TTGC	2	8	906	913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_001850	TATC	2	8	985	992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_001850	CTTT	2	8	1008	1015	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_001850	A	6	6	1031	1036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001850	TGA	2	6	1050	1055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001850	TAT	2	6	1090	1095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001850	TAA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001850	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001850	AT	3	6	1158	1163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001850	TAA	2	6	1201	1206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001850	TTC	2	6	1214	1219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_001850	TAT	2	6	1235	1240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001850	CTT	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_001850	AATTC	2	10	1284	1293	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_001850	ACT	2	6	1355	1360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_001850	T	7	7	1459	1465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001850	AT	3	6	1507	1512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001850	ATTC	2	8	1537	1544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_001850	TTA	2	6	1588	1593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001850	TAAAT	2	10	1598	1607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001850	CCA	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_001850	ATT	2	6	1676	1681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001850	T	7	7	1698	1704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001850	GAT	2	6	1729	1734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001850	A	7	7	1813	1819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001850	GGA	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001850	CTT	2	6	1879	1884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_001850	AATTC	2	10	1896	1905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_001850	A	6	6	1913	1918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001850	TAG	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001850	T	6	6	1945	1950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001850	T	6	6	1954	1959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001850	TTAA	2	8	2073	2080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001850	ATT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001850	TTC	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_001850	TCT	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_001850	TAG	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001850	T	6	6	2188	2193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001850	TCT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_001850	T	7	7	2233	2239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001850	T	6	6	2268	2273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001850	ATG	2	6	2330	2335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001850	GTG	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001850	CAT	2	6	2490	2495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_001850	AAT	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001850	TTC	2	6	2527	2532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_001850	T	7	7	2542	2548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001850	A	6	6	2612	2617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001850	GCT	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_001850	TGA	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001850	AGTCA	2	10	2710	2719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_001850	TTTC	2	8	2743	2750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_001850	CTT	2	6	2829	2834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_001850	AAT	2	6	2863	2868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001850	T	7	7	2984	2990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001850	TTC	2	6	3019	3024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_001850	ATT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001850	TCT	2	6	3074	3079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_001850	TTA	2	6	3150	3155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001850	T	7	7	3156	3162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001850	T	6	6	3176	3181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001850	TCA	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_001850	A	8	8	3195	3202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001850	AGA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001850	AT	3	6	3275	3280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001850	A	6	6	3286	3291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001850	TAAAA	2	10	3298	3307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001850	TTC	2	6	3316	3321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_001850	GCTA	2	8	3328	3335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_001850	AT	4	8	3382	3389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001850	T	6	6	3389	3394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001850	GTC	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_001850	TC	3	6	3424	3429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_001850	T	6	6	3450	3455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001850	ATTAC	2	10	3500	3509	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_001850	TCTT	2	8	3523	3530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_001850	AAAC	2	8	3552	3559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_001850	TTC	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_001850	TTC	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_001850	AT	3	6	3613	3618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001850	T	6	6	3620	3625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001850	TA	3	6	3716	3721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001850	TCT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_001850	ATT	2	6	3822	3827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001850	T	8	8	3826	3833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001850	CTT	2	6	3836	3841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_001850	TAT	2	6	3848	3853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001850	CTTTGT	2	12	3863	3874	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_001850	ACTCC	2	10	3905	3914	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_001850	TGT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001850	AAT	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001850	TTC	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_001850	AT	3	6	3965	3970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001850	ATC	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_001850	A	6	6	4019	4024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001850	T	6	6	4030	4035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001850	A	6	6	4044	4049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001850	TTA	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001850	T	6	6	4075	4080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001850	AT	3	6	4112	4117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001850	ATT	2	6	4122	4127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001850	TAT	2	6	4180	4185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001850	AT	3	6	4201	4206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001850	TATTAA	2	12	4207	4218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001850	AT	3	6	4221	4226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001850	A	7	7	4230	4236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001850	TTAA	2	8	4245	4252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001850	CAA	2	6	4308	4313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_001850	TAA	2	6	4370	4375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001850	A	7	7	4379	4385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001850	A	7	7	4406	4412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001850	ATT	2	6	4463	4468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001850	TCT	2	6	4470	4475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_001850	GAT	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_001850	ATC	2	6	4501	4506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_001850	ACAAA	2	10	4524	4533	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_001850	TATT	2	8	4536	4543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001850	CCA	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_001850	T	6	6	4601	4606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_001850	ATT	2	6	4612	4617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_001850	TAA	2	6	4618	4623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_001850	ATT	2	6	4631	4636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_001850	TAT	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_001850	ATT	3	9	4661	4669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_001850	TATT	2	8	4684	4691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_001850	CAAAT	2	10	4728	4737	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_001850	ATT	2	6	4753	4758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_001850	T	6	6	4883	4888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_001850	TAA	2	6	4945	4950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_001850	TAT	2	6	5002	5007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_001850	CAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_001850	ATA	2	6	5674	5679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_001850	T	7	7	11102	11108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_001850	TAT	3	9	11116	11124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_001850	A	6	6	14555	14560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_001850	ATTA	2	8	19612	19619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_001850	AAT	2	6	19634	19639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_001850	ATA	2	6	19644	19649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_001850	AGAT	2	8	19655	19662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
461	NC_001850	AGA	2	6	19666	19671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_001850	ATT	2	6	19673	19678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_001850	TAA	2	6	19683	19688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_001850	T	6	6	19709	19714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_001850	GTA	2	6	19826	19831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
466	NC_001850	A	7	7	19884	19890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_001850	TTAAA	2	10	19891	19900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_001850	TAA	2	6	19945	19950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_001850	AAG	2	6	20020	20025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
470	NC_001850	GAAA	2	8	20120	20127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
471	NC_001850	AAT	2	6	20147	20152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_001850	GAA	2	6	20248	20253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
473	NC_001850	TCC	2	6	20307	20312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
474	NC_001850	A	6	6	20328	20333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_001850	TAA	2	6	20334	20339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_001850	AT	4	8	20343	20350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_001850	A	7	7	20371	20377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_001850	A	7	7	20399	20405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_001850	ATG	2	6	20420	20425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
480	NC_001850	TTA	2	6	20438	20443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_001850	AACA	2	8	20496	20503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_001850	TGA	2	6	20561	20566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
483	NC_001850	TA	3	6	20571	20576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_001850	AAGA	2	8	20597	20604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
485	NC_001850	A	7	7	20604	20610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_001850	TGA	2	6	20612	20617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
487	NC_001850	A	7	7	20695	20701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_001850	A	8	8	20747	20754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_001850	A	6	6	20769	20774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_001850	ATT	2	6	20822	20827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_001850	T	7	7	20826	20832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_001850	AAT	2	6	20895	20900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_001850	A	6	6	21105	21110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_001850	GCA	2	6	21129	21134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
498	NC_001850	ATTT	2	8	21136	21143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_001850	GTA	2	6	21167	21172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_001850	A	7	7	21185	21191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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