MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 chromosome

Total Repeats: 2696

< Previous123456Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_001318	CTG	2	6	888306	888311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_001318	TTA	2	6	896573	896578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_001318	T	6	6	899326	899331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_001318	T	6	6	899342	899347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_001318	T	6	6	899351	899356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_001318	TATAT	2	10	899362	899371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_001318	ATT	2	6	899379	899384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_001318	T	6	6	899399	899404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_001318	AT	3	6	899426	899431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_001318	GAA	3	9	899461	899469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_001318	AATA	2	8	899481	899488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_001318	TGG	2	6	900749	900754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_001318	AGT	2	6	901808	901813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_001318	AAT	2	6	901819	901824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_001318	A	6	6	903260	903265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_001318	A	7	7	903279	903285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_001318	AT	3	6	903315	903320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_001318	TAAA	2	8	903361	903368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_001318	T	6	6	903380	903385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_001318	ATT	2	6	903395	903400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_001318	TTA	2	6	903447	903452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_001318	TTTA	2	8	903487	903494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_001318	GTTT	2	8	903502	903509	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_001318	TATTG	2	10	903532	903541	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_001318	AGC	2	6	903548	903553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_001318	AATA	2	8	903594	903601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_001318	A	7	7	903601	903607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_001318	T	6	6	903693	903698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_001318	TAA	2	6	903772	903777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_001318	A	6	6	903776	903781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_001318	T	6	6	903784	903789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_001318	TAAA	2	8	903812	903819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_001318	A	6	6	903825	903830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_001318	AGA	2	6	903844	903849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_001318	TTA	2	6	903863	903868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_001318	AT	3	6	903878	903883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_001318	T	7	7	903883	903889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_001318	A	6	6	903904	903909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_001318	AT	3	6	904909	904914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_001318	TTCTAT	2	12	904915	904926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2541	NC_001318	T	6	6	904953	904958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_001318	T	6	6	904966	904971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_001318	TAA	2	6	905013	905018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_001318	TAA	2	6	905023	905028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_001318	ATTTTT	2	12	905032	905043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_001318	TAG	2	6	905054	905059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_001318	TA	3	6	905088	905093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_001318	TTG	2	6	905127	905132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_001318	TAA	2	6	905218	905223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_001318	T	6	6	905227	905232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_001318	T	6	6	905278	905283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_001318	TGAT	2	8	905300	905307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_001318	TTGA	2	8	905311	905318	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_001318	TAAA	2	8	905337	905344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_001318	A	7	7	905348	905354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_001318	TAA	2	6	905355	905360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_001318	TTA	2	6	905392	905397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_001318	TAT	2	6	905454	905459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_001318	TAT	2	6	905465	905470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_001318	TAA	2	6	905477	905482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_001318	TTA	2	6	905499	905504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_001318	TAA	2	6	905508	905513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_001318	TAATTT	2	12	905523	905534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_001318	TATT	2	8	905536	905543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_001318	TAA	2	6	905545	905550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_001318	T	7	7	905558	905564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_001318	A	6	6	905569	905574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_001318	TAG	2	6	905592	905597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_001318	TTA	2	6	905608	905613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_001318	CATTTT	2	12	905632	905643	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2571	NC_001318	AAT	2	6	905663	905668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_001318	TTA	2	6	905696	905701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_001318	TTG	2	6	905725	905730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_001318	ATA	2	6	905749	905754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_001318	G	6	6	905789	905794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_001318	ATT	2	6	905823	905828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_001318	A	7	7	905842	905848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_001318	GTT	2	6	905860	905865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_001318	TAT	2	6	905898	905903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_001318	TTG	2	6	905915	905920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_001318	T	7	7	905934	905940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_001318	TTTTA	2	10	905959	905968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_001318	T	7	7	905970	905976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_001318	TAAAT	2	10	906002	906011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_001318	ATA	2	6	906012	906017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_001318	TAA	2	6	906044	906049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_001318	AT	3	6	906066	906071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_001318	T	7	7	906088	906094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_001318	AGA	2	6	906145	906150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_001318	ATT	2	6	906152	906157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_001318	A	7	7	906169	906175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_001318	AAGT	2	8	906191	906198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_001318	AAAT	2	8	906203	906210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_001318	TAT	2	6	906314	906319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_001318	TCT	2	6	906325	906330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_001318	TCT	3	9	906342	906350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_001318	T	7	7	906397	906403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_001318	TTTAA	2	10	906413	906422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_001318	T	8	8	906430	906437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_001318	AAT	2	6	906440	906445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_001318	TAC	2	6	906477	906482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_001318	GTT	2	6	906498	906503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_001318	GTA	2	6	906605	906610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_001318	TGT	2	6	906611	906616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_001318	TA	3	6	906620	906625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_001318	TTG	2	6	906690	906695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_001318	T	6	6	906710	906715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_001318	A	6	6	906719	906724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_001318	A	6	6	906736	906741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_001318	ATA	2	6	906757	906762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_001318	TA	3	6	906822	906827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_001318	TAAA	2	8	906948	906955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_001318	TTATAA	2	12	906965	906976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_001318	GTT	2	6	907031	907036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_001318	ACT	2	6	907074	907079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_001318	AT	3	6	907145	907150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_001318	ACTTA	2	10	907164	907173	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2618	NC_001318	A	7	7	907191	907197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_001318	GTA	2	6	907243	907248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_001318	AGT	2	6	907292	907297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_001318	ATA	2	6	907299	907304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_001318	TTA	2	6	907305	907310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_001318	GAATT	2	10	907358	907367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_001318	AGA	2	6	907420	907425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_001318	A	6	6	907436	907441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_001318	TTA	2	6	907475	907480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_001318	ATA	2	6	907488	907493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_001318	AATTT	2	10	907536	907545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_001318	T	6	6	907550	907555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_001318	AAG	2	6	907572	907577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_001318	GGATA	2	10	907593	907602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_001318	AGA	2	6	907606	907611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_001318	A	6	6	907617	907622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_001318	GAT	2	6	907634	907639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_001318	AGA	2	6	907667	907672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_001318	GCAA	2	8	907676	907683	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2637	NC_001318	ATT	3	9	907725	907733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_001318	A	6	6	907786	907791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_001318	TAT	2	6	907797	907802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2640	NC_001318	AGA	2	6	907839	907844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2641	NC_001318	AGA	2	6	907908	907913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_001318	A	6	6	907947	907952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2643	NC_001318	TTTA	2	8	908003	908010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2644	NC_001318	AAAAT	2	10	908034	908043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2645	NC_001318	TAT	2	6	908049	908054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_001318	AGA	2	6	908080	908085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2647	NC_001318	TTA	2	6	908088	908093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2648	NC_001318	A	6	6	908119	908124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2649	NC_001318	A	6	6	908126	908131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2650	NC_001318	TAA	2	6	908153	908158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2651	NC_001318	ATT	2	6	908171	908176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2652	NC_001318	TAAGG	2	10	908205	908214	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_001318	A	6	6	908215	908220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2654	NC_001318	TAA	2	6	908221	908226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2655	NC_001318	A	6	6	908231	908236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2656	NC_001318	A	6	6	908251	908256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2657	NC_001318	A	6	6	908265	908270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2658	NC_001318	ACA	2	6	908303	908308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2659	NC_001318	ATTT	2	8	908317	908324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2660	NC_001318	ATT	2	6	908330	908335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2661	NC_001318	TAA	3	9	909635	909643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2662	NC_001318	AATAA	2	10	909646	909655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2663	NC_001318	TAA	3	9	909653	909661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_001318	A	6	6	909665	909670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_001318	AAG	2	6	909687	909692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2666	NC_001318	TAA	2	6	909700	909705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2667	NC_001318	ATT	2	6	909776	909781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2668	NC_001318	TAG	2	6	909820	909825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2669	NC_001318	TAAT	2	8	909859	909866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2670	NC_001318	AT	3	6	909885	909890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2671	NC_001318	T	7	7	909890	909896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2672	NC_001318	TATT	2	8	909905	909912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2673	NC_001318	TAA	2	6	909958	909963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2674	NC_001318	TAT	2	6	909981	909986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2675	NC_001318	TAT	2	6	910037	910042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2676	NC_001318	ATT	2	6	910089	910094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2677	NC_001318	T	6	6	910134	910139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2678	NC_001318	AAT	2	6	910141	910146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2679	NC_001318	TAT	2	6	910175	910180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2680	NC_001318	AT	4	8	910194	910201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2681	NC_001318	ATTTAT	2	12	910209	910220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2682	NC_001318	TTGT	2	8	910245	910252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2683	NC_001318	TGT	2	6	910274	910279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2684	NC_001318	TAG	2	6	910333	910338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2685	NC_001318	T	7	7	910344	910350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2686	NC_001318	GTT	2	6	910360	910365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2687	NC_001318	ATCT	2	8	910369	910376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2688	NC_001318	TGAT	2	8	910382	910389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2689	NC_001318	AGT	2	6	910390	910395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2690	NC_001318	AATT	2	8	910431	910438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2691	NC_001318	ATA	2	6	910441	910446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2692	NC_001318	GAT	2	6	910476	910481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2693	NC_001318	TGC	2	6	910524	910529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2694	NC_001318	A	6	6	910533	910538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2695	NC_001318	CTA	2	6	910556	910561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2696	NC_001318	T	6	6	910603	910608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous123456Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.