MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187145	GA	3	6	31	36	50 %	0 %	50 %	0 %	426202380
2	NT_187145	AG	3	6	37	42	50 %	0 %	50 %	0 %	426202380
3	NT_187145	AAAAG	2	10	55	64	80 %	0 %	20 %	0 %	426202380
4	NT_187145	AGA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202380
5	NT_187145	TAA	2	6	94	99	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202380
6	NT_187145	AT	3	6	212	217	50 %	50 %	0 %	0 %	426202380
7	NT_187145	AGTT	2	8	228	235	25 %	50 %	25 %	0 %	426202380
8	NT_187145	GATT	2	8	256	263	25 %	50 %	25 %	0 %	426202380
9	NT_187145	TGATT	2	10	265	274	20 %	60 %	20 %	0 %	426202380
10	NT_187145	GAT	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202380
11	NT_187145	AG	3	6	382	387	50 %	0 %	50 %	0 %	426202380
12	NT_187145	T	7	7	460	466	0 %	100 %	0 %	0 %	426202380
13	NT_187145	GATA	2	8	479	486	50 %	25 %	25 %	0 %	426202380
14	NT_187145	ATT	2	6	1069	1074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202381
15	NT_187145	TTTG	2	8	1087	1094	0 %	75 %	25 %	0 %	426202381
16	NT_187145	TA	3	6	1219	1224	50 %	50 %	0 %	0 %	426202381
17	NT_187145	AGG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202381
18	NT_187145	GTA	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202381
19	NT_187145	GTTT	2	8	1374	1381	0 %	75 %	25 %	0 %	426202381
20	NT_187145	TA	3	6	1408	1413	50 %	50 %	0 %	0 %	426202381
21	NT_187145	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202381
22	NT_187145	AT	3	6	1484	1489	50 %	50 %	0 %	0 %	426202381
23	NT_187145	GAA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202381
24	NT_187145	TGC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202381
25	NT_187145	GAAA	2	8	1586	1593	75 %	0 %	25 %	0 %	426202381
26	NT_187145	GAA	3	9	2371	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
27	NT_187145	TGA	2	6	2397	2402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
28	NT_187145	TTTATT	2	12	2404	2415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	426202382
29	NT_187145	TAA	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202382
30	NT_187145	A	6	6	2512	2517	100 %	0 %	0 %	0 %	426202382
31	NT_187145	TGC	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
32	NT_187145	AAG	2	6	2544	2549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
33	NT_187145	TGA	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
34	NT_187145	CTG	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
35	NT_187145	GTT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202382
36	NT_187145	GCT	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
37	NT_187145	AAG	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
38	NT_187145	TGA	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
39	NT_187145	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202382
40	NT_187145	TAA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202382
41	NT_187145	AAAG	2	8	2839	2846	75 %	0 %	25 %	0 %	426202382
42	NT_187145	GAA	2	6	2873	2878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
43	NT_187145	GTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202382
44	NT_187145	GCT	2	6	2918	2923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
45	NT_187145	GCT	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
46	NT_187145	A	7	7	3376	3382	100 %	0 %	0 %	0 %	426202383
47	NT_187145	GTAT	2	8	3394	3401	25 %	50 %	25 %	0 %	426202383
48	NT_187145	ATT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
49	NT_187145	AAGCA	2	10	3456	3465	60 %	0 %	20 %	20 %	426202383
50	NT_187145	AGA	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
51	NT_187145	AGA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
52	NT_187145	TGT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202383
53	NT_187145	GAA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
54	NT_187145	AGT	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
55	NT_187145	TGA	2	6	3606	3611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
56	NT_187145	CAA	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202383
57	NT_187145	AGA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
58	NT_187145	AGA	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
59	NT_187145	AAG	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
60	NT_187145	AATT	2	8	3755	3762	50 %	50 %	0 %	0 %	426202383
61	NT_187145	A	6	6	3935	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	426202383
62	NT_187145	TGA	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
63	NT_187145	AAG	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
64	NT_187145	T	6	6	4009	4014	0 %	100 %	0 %	0 %	426202383
65	NT_187145	GAA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
66	NT_187145	A	6	6	4025	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	426202383
67	NT_187145	AAG	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
68	NT_187145	A	6	6	4059	4064	100 %	0 %	0 %	0 %	426202383
69	NT_187145	AGA	2	6	4084	4089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
70	NT_187145	ATT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
71	NT_187145	ACG	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202383
72	NT_187145	TTA	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
73	NT_187145	TCT	3	9	4165	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202383
74	NT_187145	AAG	2	6	4226	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
75	NT_187145	TATC	2	8	4240	4247	25 %	50 %	0 %	25 %	426202383
76	NT_187145	AGC	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202384
77	NT_187145	ATT	2	6	4689	4694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202384
78	NT_187145	AGT	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202384
79	NT_187145	ATGA	2	8	4802	4809	50 %	25 %	25 %	0 %	426202384
80	NT_187145	TGA	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202384
81	NT_187145	AGA	3	9	4858	4866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202384
82	NT_187145	ATA	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384
83	NT_187145	TA	3	6	5046	5051	50 %	50 %	0 %	0 %	426202384
84	NT_187145	GATT	2	8	5068	5075	25 %	50 %	25 %	0 %	426202384
85	NT_187145	AAT	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384
86	NT_187145	TCA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202384
87	NT_187145	ATT	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202384
88	NT_187145	CTA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202384
89	NT_187145	TAA	2	6	5357	5362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.