MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1046T

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187139	T	6	6	172	177	0 %	100 %	0 %	0 %	426202336
2	NT_187139	T	6	6	180	185	0 %	100 %	0 %	0 %	426202336
3	NT_187139	GTTT	2	8	244	251	0 %	75 %	25 %	0 %	426202336
4	NT_187139	TGTT	2	8	320	327	0 %	75 %	25 %	0 %	426202336
5	NT_187139	A	9	9	347	355	100 %	0 %	0 %	0 %	426202336
6	NT_187139	ATT	2	6	365	370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202336
7	NT_187139	TTA	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202336
8	NT_187139	TTC	2	6	388	393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202336
9	NT_187139	TTA	2	6	396	401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202336
10	NT_187139	T	6	6	467	472	0 %	100 %	0 %	0 %	426202336
11	NT_187139	T	6	6	514	519	0 %	100 %	0 %	0 %	426202336
12	NT_187139	TGT	2	6	558	563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202336
13	NT_187139	TCT	2	6	569	574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202336
14	NT_187139	ATTT	2	8	580	587	25 %	75 %	0 %	0 %	426202336
15	NT_187139	T	7	7	638	644	0 %	100 %	0 %	0 %	426202336
16	NT_187139	GA	3	6	646	651	50 %	0 %	50 %	0 %	426202336
17	NT_187139	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202336
18	NT_187139	TTTA	2	8	673	680	25 %	75 %	0 %	0 %	426202336
19	NT_187139	T	6	6	738	743	0 %	100 %	0 %	0 %	426202337
20	NT_187139	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	426202337
21	NT_187139	TTTA	2	8	809	816	25 %	75 %	0 %	0 %	426202337
22	NT_187139	CT	6	12	821	832	0 %	50 %	0 %	50 %	426202337
23	NT_187139	ATTT	2	8	880	887	25 %	75 %	0 %	0 %	426202337
24	NT_187139	AT	3	6	920	925	50 %	50 %	0 %	0 %	426202337
25	NT_187139	AATCA	2	10	1013	1022	60 %	20 %	0 %	20 %	426202337
26	NT_187139	ACA	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202337
27	NT_187139	ATTA	2	8	1037	1044	50 %	50 %	0 %	0 %	426202337
28	NT_187139	ATT	2	6	1074	1079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202337
29	NT_187139	TAA	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202337
30	NT_187139	T	7	7	1115	1121	0 %	100 %	0 %	0 %	426202337
31	NT_187139	ATT	2	6	1151	1156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202337
32	NT_187139	A	6	6	1157	1162	100 %	0 %	0 %	0 %	426202337
33	NT_187139	AT	4	8	1253	1260	50 %	50 %	0 %	0 %	426202337
34	NT_187139	CTTG	2	8	1320	1327	0 %	50 %	25 %	25 %	426202337
35	NT_187139	TAG	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202337
36	NT_187139	CCT	2	6	1410	1415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426202337
37	NT_187139	TTA	2	6	1432	1437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202337
38	NT_187139	T	8	8	1444	1451	0 %	100 %	0 %	0 %	426202337
39	NT_187139	ATTT	2	8	1458	1465	25 %	75 %	0 %	0 %	426202337
40	NT_187139	A	7	7	3498	3504	100 %	0 %	0 %	0 %	426202338
41	NT_187139	AAT	3	9	3524	3532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202338
42	NT_187139	TTTA	2	8	3536	3543	25 %	75 %	0 %	0 %	426202338
43	NT_187139	CAG	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
44	NT_187139	GTT	2	6	3810	3815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202338
45	NT_187139	TTG	2	6	3823	3828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202338
46	NT_187139	GCA	2	6	3849	3854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
47	NT_187139	AGC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
48	NT_187139	A	6	6	3977	3982	100 %	0 %	0 %	0 %	426202338
49	NT_187139	TAG	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202338
50	NT_187139	CTG	2	6	4042	4047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202338
51	NT_187139	AAG	2	6	4056	4061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202338
52	NT_187139	AGA	2	6	4103	4108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202338
53	NT_187139	AGC	2	6	4118	4123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
54	NT_187139	AGTG	2	8	4145	4152	25 %	25 %	50 %	0 %	426202338
55	NT_187139	TTC	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202338
56	NT_187139	GCA	2	6	4227	4232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
57	NT_187139	ACT	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202338
58	NT_187139	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
59	NT_187139	A	7	7	4289	4295	100 %	0 %	0 %	0 %	426202338
60	NT_187139	AGC	2	6	4307	4312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
61	NT_187139	CTGAAG	2	12	4381	4392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	426202338
62	NT_187139	AGC	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
63	NT_187139	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202338
64	NT_187139	CAG	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202338
65	NT_187139	CAA	2	6	4552	4557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202338
66	NT_187139	AAT	2	6	4572	4577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202338
67	NT_187139	A	7	7	11412	11418	100 %	0 %	0 %	0 %	426202339
68	NT_187139	AAT	3	9	11438	11446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202339
69	NT_187139	TTTA	2	8	11450	11457	25 %	75 %	0 %	0 %	426202339
70	NT_187139	T	6	6	11543	11548	0 %	100 %	0 %	0 %	426202339
71	NT_187139	CAT	2	6	11560	11565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202339
72	NT_187139	A	6	6	11609	11614	100 %	0 %	0 %	0 %	426202339
73	NT_187139	TAA	2	6	11678	11683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202339
74	NT_187139	AG	3	6	11701	11706	50 %	0 %	50 %	0 %	426202339
75	NT_187139	ATA	2	6	11758	11763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202339
76	NT_187139	GATAA	2	10	11769	11778	60 %	20 %	20 %	0 %	426202339
77	NT_187139	TGC	2	6	11840	11845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202339
78	NT_187139	TGG	2	6	11846	11851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202339
79	NT_187139	TAA	2	6	11896	11901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202339
80	NT_187139	AGT	2	6	11924	11929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202339
81	NT_187139	AAG	2	6	11935	11940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202339

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.