MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo clone fragment c

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_167352	A	7	7	118	124	100 %	0 %	0 %	0 %	294679246
2	NT_167352	ACT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679247
3	NT_167352	TAA	2	6	301	306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
4	NT_167352	ATT	2	6	309	314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679247
5	NT_167352	TTAC	2	8	321	328	25 %	50 %	0 %	25 %	294679247
6	NT_167352	AAT	3	9	342	350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
7	NT_167352	T	7	7	371	377	0 %	100 %	0 %	0 %	294679247
8	NT_167352	T	6	6	492	497	0 %	100 %	0 %	0 %	294679247
9	NT_167352	ATCT	2	8	503	510	25 %	50 %	0 %	25 %	294679247
10	NT_167352	ATA	2	6	620	625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679247
11	NT_167352	A	7	7	1017	1023	100 %	0 %	0 %	0 %	294679248
12	NT_167352	CTTT	2	8	1560	1567	0 %	75 %	0 %	25 %	294679249
13	NT_167352	GCTTT	2	10	1629	1638	0 %	60 %	20 %	20 %	294679249
14	NT_167352	A	6	6	1649	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	294679249
15	NT_167352	ATC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679249
16	NT_167352	TAT	2	6	1744	1749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679249
17	NT_167352	AAT	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679249
18	NT_167352	T	7	7	1813	1819	0 %	100 %	0 %	0 %	294679249
19	NT_167352	A	6	6	2604	2609	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
20	NT_167352	TAT	2	6	2612	2617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
21	NT_167352	TAATT	2	10	2618	2627	40 %	60 %	0 %	0 %	294679250
22	NT_167352	TAT	2	6	2635	2640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
23	NT_167352	TTC	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679250
24	NT_167352	T	6	6	2656	2661	0 %	100 %	0 %	0 %	294679250
25	NT_167352	TAAAG	2	10	2696	2705	60 %	20 %	20 %	0 %	294679250
26	NT_167352	TAC	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679250
27	NT_167352	AGA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
28	NT_167352	TAG	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679250
29	NT_167352	TAA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
30	NT_167352	AGA	2	6	2853	2858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
31	NT_167352	A	6	6	2868	2873	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
32	NT_167352	CTC	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294679250
33	NT_167352	AAT	2	6	2922	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
34	NT_167352	A	7	7	2942	2948	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
35	NT_167352	ATA	2	6	2980	2985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679250
36	NT_167352	AT	4	8	2988	2995	50 %	50 %	0 %	0 %	294679250
37	NT_167352	A	6	6	3015	3020	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
38	NT_167352	A	6	6	3029	3034	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
39	NT_167352	A	6	6	3039	3044	100 %	0 %	0 %	0 %	294679250
40	NT_167352	ATT	2	6	3047	3052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679250
41	NT_167352	GAG	3	9	3070	3078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679250
42	NT_167352	AGA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
43	NT_167352	AGA	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
44	NT_167352	GAA	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
45	NT_167352	GAA	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
46	NT_167352	AGA	3	9	3191	3199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679250
47	NT_167352	C	10	10	3653	3662	0 %	0 %	0 %	100 %	294679251
48	NT_167352	T	9	9	3692	3700	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
49	NT_167352	T	6	6	3734	3739	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
50	NT_167352	T	8	8	3758	3765	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
51	NT_167352	T	7	7	3769	3775	0 %	100 %	0 %	0 %	294679251
52	NT_167352	TTA	2	6	4255	4260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679252
53	NT_167352	TAT	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679252
54	NT_167352	TTATT	2	10	4292	4301	20 %	80 %	0 %	0 %	294679252
55	NT_167352	TAG	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679252
56	NT_167352	AAAT	2	8	5197	5204	75 %	25 %	0 %	0 %	294679253
57	NT_167352	ATG	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679253
58	NT_167352	AGA	2	6	5293	5298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679253
59	NT_167352	CTTAG	2	10	5318	5327	20 %	40 %	20 %	20 %	294679253
60	NT_167352	A	8	8	5336	5343	100 %	0 %	0 %	0 %	294679253
61	NT_167352	A	7	7	5365	5371	100 %	0 %	0 %	0 %	294679253
62	NT_167352	A	6	6	5382	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	294679253
63	NT_167352	TAA	2	6	5406	5411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679253
64	NT_167352	A	7	7	5410	5416	100 %	0 %	0 %	0 %	294679253
65	NT_167352	AACA	2	8	5504	5511	75 %	0 %	0 %	25 %	294679254
66	NT_167352	TAT	2	6	5519	5524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679254
67	NT_167352	CTTTT	2	10	5530	5539	0 %	80 %	0 %	20 %	294679254
68	NT_167352	ATG	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679254
69	NT_167352	AAT	2	6	5577	5582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679254
70	NT_167352	GAA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679254
71	NT_167352	TAG	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679254
72	NT_167352	A	6	6	6024	6029	100 %	0 %	0 %	0 %	294679255
73	NT_167352	TATT	2	8	6037	6044	25 %	75 %	0 %	0 %	294679255
74	NT_167352	T	6	6	6095	6100	0 %	100 %	0 %	0 %	294679255
75	NT_167352	A	6	6	6110	6115	100 %	0 %	0 %	0 %	294679255
76	NT_167352	TAGA	2	8	6121	6128	50 %	25 %	25 %	0 %	294679255
77	NT_167352	T	6	6	6144	6149	0 %	100 %	0 %	0 %	294679255
78	NT_167352	TTG	2	6	6221	6226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679255
79	NT_167352	ATT	2	6	6245	6250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679255
80	NT_167352	TCA	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679255
81	NT_167352	TCA	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679255
82	NT_167352	AAT	2	6	6527	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679255
83	NT_167352	TAT	2	6	6535	6540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294679255
84	NT_167352	ATA	2	6	6543	6548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679255
85	NT_167352	T	7	7	6557	6563	0 %	100 %	0 %	0 %	294679255
86	NT_167352	ACAA	2	8	6564	6571	75 %	0 %	0 %	25 %	294679255
87	NT_167352	A	7	7	6582	6588	100 %	0 %	0 %	0 %	294679255
88	NT_167352	TAA	3	9	6596	6604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294679255
89	NT_167352	A	6	6	6608	6613	100 %	0 %	0 %	0 %	294679255

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.