MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 chromosome 2

Total Repeats: 90543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022658	CGGCAT	2	12	619641	619652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16002	NC_022658	CGA	2	6	619674	619679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16003	NC_022658	AAGCCG	2	12	619718	619729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16004	NC_022658	CGA	2	6	619749	619754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16005	NC_022658	TCG	2	6	619799	619804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16006	NC_022658	CCAC	2	8	619835	619842	25 %	0 %	0 %	75 %	556572532
16007	NC_022658	CGG	2	6	619865	619870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572532
16008	NC_022658	CGC	2	6	619875	619880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16009	NC_022658	CG	3	6	619905	619910	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16010	NC_022658	TCGT	2	8	619933	619940	0 %	50 %	25 %	25 %	556572532
16011	NC_022658	GAA	2	6	619942	619947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556572532
16012	NC_022658	CG	3	6	619980	619985	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16013	NC_022658	CG	4	8	620016	620023	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16014	NC_022658	GCT	2	6	620025	620030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16015	NC_022658	CG	3	6	620036	620041	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16016	NC_022658	TCGA	2	8	620047	620054	25 %	25 %	25 %	25 %	556572532
16017	NC_022658	CG	3	6	620065	620070	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16018	NC_022658	CG	3	6	620082	620087	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16019	NC_022658	CG	3	6	620105	620110	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16020	NC_022658	GCCGCT	2	12	620148	620159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	556572532
16021	NC_022658	TGG	2	6	620177	620182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556572532
16022	NC_022658	GTC	2	6	620218	620223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16023	NC_022658	CGA	2	6	620258	620263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16024	NC_022658	GCT	2	6	620268	620273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16025	NC_022658	GCC	2	6	620385	620390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16026	NC_022658	TGC	2	6	620453	620458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16027	NC_022658	ACC	2	6	620470	620475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556572532
16028	NC_022658	TCG	2	6	620531	620536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16029	NC_022658	CGC	2	6	620544	620549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16030	NC_022658	CGC	2	6	620591	620596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16031	NC_022658	GCC	2	6	620624	620629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16032	NC_022658	CGA	2	6	620631	620636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16033	NC_022658	TGC	2	6	620663	620668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16034	NC_022658	GAG	2	6	620716	620721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556572532
16035	NC_022658	TCG	2	6	620759	620764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16036	NC_022658	CGGC	2	8	620816	620823	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16037	NC_022658	CG	5	10	620846	620855	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16038	NC_022658	GCA	2	6	620931	620936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16039	NC_022658	CGA	2	6	620985	620990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16040	NC_022658	CG	3	6	620995	621000	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16041	NC_022658	TTC	2	6	621001	621006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556572532
16042	NC_022658	CG	3	6	621010	621015	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16043	NC_022658	CTG	2	6	621016	621021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16044	NC_022658	CCG	2	6	621035	621040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16045	NC_022658	GTC	2	6	621073	621078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16046	NC_022658	ACG	2	6	621095	621100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16047	NC_022658	ACG	2	6	621118	621123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16048	NC_022658	GCC	2	6	621125	621130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16049	NC_022658	TGC	2	6	621164	621169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16050	NC_022658	CCG	2	6	621194	621199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16051	NC_022658	GTC	2	6	621253	621258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16052	NC_022658	CGA	2	6	621285	621290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16053	NC_022658	CGA	2	6	621303	621308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16054	NC_022658	CGC	2	6	621322	621327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16055	NC_022658	CGC	2	6	621333	621338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572532
16056	NC_022658	CG	3	6	621366	621371	0 %	0 %	50 %	50 %	556572532
16057	NC_022658	ACG	2	6	621377	621382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16058	NC_022658	CGCC	2	8	621383	621390	0 %	0 %	25 %	75 %	556572532
16059	NC_022658	GAC	2	6	621462	621467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572532
16060	NC_022658	GCG	2	6	621468	621473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572532
16061	NC_022658	CCGTC	2	10	621696	621705	0 %	20 %	20 %	60 %	556573824
16062	NC_022658	GC	3	6	621706	621711	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16063	NC_022658	GCC	3	9	621725	621733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573824
16064	NC_022658	ATC	2	6	621782	621787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556573824
16065	NC_022658	TTC	3	9	621797	621805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556573824
16066	NC_022658	TCG	2	6	621888	621893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16067	NC_022658	CTT	2	6	621904	621909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556573824
16068	NC_022658	CGGCG	2	10	621922	621931	0 %	0 %	60 %	40 %	556573824
16069	NC_022658	GCT	2	6	621940	621945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16070	NC_022658	CGGC	2	8	621958	621965	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16071	NC_022658	GCG	2	6	622001	622006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573824
16072	NC_022658	TGC	2	6	622059	622064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16073	NC_022658	TCGGCA	2	12	622065	622076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16074	NC_022658	GCT	2	6	622105	622110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16075	NC_022658	GTTC	2	8	622117	622124	0 %	50 %	25 %	25 %	556573824
16076	NC_022658	CCG	2	6	622125	622130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573824
16077	NC_022658	CGGC	2	8	622138	622145	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16078	NC_022658	TCA	2	6	622182	622187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556573824
16079	NC_022658	CCG	2	6	622188	622193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573824
16080	NC_022658	CGT	2	6	622195	622200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16081	NC_022658	TGC	2	6	622212	622217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
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16083	NC_022658	CCG	2	6	622260	622265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573824
16084	NC_022658	TCG	2	6	622275	622280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16085	NC_022658	CGC	2	6	622302	622307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573824
16086	NC_022658	CGGC	2	8	622324	622331	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16087	NC_022658	CG	4	8	622384	622391	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16088	NC_022658	GC	3	6	622434	622439	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16089	NC_022658	GCC	2	6	622472	622477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573824
16090	NC_022658	CCG	3	9	622480	622488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573824
16091	NC_022658	ACG	2	6	622490	622495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16092	NC_022658	GCT	2	6	622504	622509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16093	NC_022658	GCT	2	6	622522	622527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16094	NC_022658	CGT	2	6	622545	622550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16095	NC_022658	GC	3	6	622557	622562	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16096	NC_022658	GCA	2	6	622567	622572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573824
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16098	NC_022658	GCG	2	6	622649	622654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573824
16099	NC_022658	TCG	2	6	622659	622664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16100	NC_022658	TCG	2	6	622701	622706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16101	NC_022658	GC	3	6	622740	622745	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16102	NC_022658	CGG	2	6	622750	622755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573824
16103	NC_022658	GCT	2	6	622765	622770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16104	NC_022658	TTC	2	6	622796	622801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556573824
16105	NC_022658	TACACG	2	12	622826	622837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556573824
16106	NC_022658	GC	5	10	622857	622866	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16107	NC_022658	CGGG	2	8	622894	622901	0 %	0 %	75 %	25 %	556573824
16108	NC_022658	TGC	2	6	622938	622943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16109	NC_022658	GC	3	6	622977	622982	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16110	NC_022658	TCGT	2	8	622985	622992	0 %	50 %	25 %	25 %	556573824
16111	NC_022658	GCC	2	6	623069	623074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573824
16112	NC_022658	GAC	2	6	623075	623080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573824
16113	NC_022658	GC	3	6	623084	623089	0 %	0 %	50 %	50 %	556573824
16114	NC_022658	GCG	3	9	623102	623110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573824
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16116	NC_022658	CCGG	2	8	623269	623276	0 %	0 %	50 %	50 %	556573800
16117	NC_022658	CGC	2	6	623298	623303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573800
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16119	NC_022658	CG	3	6	623314	623319	0 %	0 %	50 %	50 %	556573800
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16229	NC_022658	GCC	2	6	626653	626658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572506
16230	NC_022658	CGA	2	6	626660	626665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572506
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16233	NC_022658	CATAA	2	10	626679	626688	60 %	20 %	0 %	20 %	556572506
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16236	NC_022658	CG	5	10	626828	626837	0 %	0 %	50 %	50 %	556572506
16237	NC_022658	TCG	2	6	626915	626920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572506
16238	NC_022658	TGC	2	6	626932	626937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572506
16239	NC_022658	AGC	2	6	626947	626952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572506
16240	NC_022658	GCT	3	9	626972	626980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572506
16241	NC_022658	GCC	2	6	627043	627048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572506
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16243	NC_022658	GCCAGC	2	12	627118	627129	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556572506
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16341	NC_022658	TCG	2	6	633262	633267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572735
16342	NC_022658	CGAGCG	2	12	633287	633298	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	556572735
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16345	NC_022658	ACG	2	6	633335	633340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572735
16346	NC_022658	CG	3	6	633346	633351	0 %	0 %	50 %	50 %	556572735
16347	NC_022658	CGC	2	6	633380	633385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572735
16348	NC_022658	CG	3	6	633418	633423	0 %	0 %	50 %	50 %	556572735
16349	NC_022658	ACG	2	6	633430	633435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572735
16350	NC_022658	GCG	2	6	633440	633445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572735
16351	NC_022658	GC	3	6	633474	633479	0 %	0 %	50 %	50 %	556572735
16352	NC_022658	CGA	2	6	633497	633502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572735
16353	NC_022658	CCCGCG	2	12	633513	633524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572735
16354	NC_022658	GC	3	6	633528	633533	0 %	0 %	50 %	50 %	556572735
16355	NC_022658	TCA	2	6	633569	633574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556572735
16356	NC_022658	GCG	2	6	633580	633585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556572502
16357	NC_022658	CGC	2	6	633587	633592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556572502
16358	NC_022658	ATG	2	6	633600	633605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556572502
16359	NC_022658	ACG	2	6	633636	633641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572502
16360	NC_022658	TCG	2	6	633654	633659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556572502
16361	NC_022658	GC	3	6	633703	633708	0 %	0 %	50 %	50 %	556572502
16362	NC_022658	CG	3	6	633727	633732	0 %	0 %	50 %	50 %	556572502
16363	NC_022658	CG	4	8	633754	633761	0 %	0 %	50 %	50 %	556572502
16364	NC_022658	CG	7	14	633769	633782	0 %	0 %	50 %	50 %	556572502
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16474	NC_022658	GC	3	6	637056	637061	0 %	0 %	50 %	50 %	556572313
16475	NC_022658	AGC	2	6	637084	637089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556572313
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16477	NC_022658	GCG	2	6	637230	637235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573071
16478	NC_022658	CGA	2	6	637291	637296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556573071
16479	NC_022658	GCG	2	6	637301	637306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573071
16480	NC_022658	CG	3	6	637345	637350	0 %	0 %	50 %	50 %	556573071
16481	NC_022658	GC	3	6	637415	637420	0 %	0 %	50 %	50 %	556573071
16482	NC_022658	CGC	3	9	637432	637440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556573071
16483	NC_022658	ATTCGG	2	12	637447	637458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556573071
16484	NC_022658	CG	3	6	637459	637464	0 %	0 %	50 %	50 %	556573071
16485	NC_022658	CAC	2	6	637470	637475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556573071
16486	NC_022658	GTTC	2	8	637765	637772	0 %	50 %	25 %	25 %	556573017
16487	NC_022658	CGG	2	6	637782	637787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556573017
16488	NC_022658	TCG	2	6	637799	637804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573017
16489	NC_022658	TCG	2	6	637862	637867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573017
16490	NC_022658	CG	4	8	637866	637873	0 %	0 %	50 %	50 %	556573017
16491	NC_022658	AGCCCG	2	12	637893	637904	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	556573017
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16493	NC_022658	TGA	2	6	637971	637976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556573017
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16500	NC_022658	CGT	3	9	638293	638301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556573017

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