MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Nauphoeta cinerea) plasmid

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022551	T	6	6	98	103	0 %	100 %	0 %	0 %	549734476
2	NC_022551	TAA	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734476
3	NC_022551	TTA	2	6	127	132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
4	NC_022551	ATT	2	6	135	140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
5	NC_022551	TAT	2	6	143	148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
6	NC_022551	ATG	2	6	153	158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734476
7	NC_022551	ATT	2	6	159	164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
8	NC_022551	TTCT	2	8	165	172	0 %	75 %	0 %	25 %	549734476
9	NC_022551	TAA	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734476
10	NC_022551	TCT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549734476
11	NC_022551	TTC	2	6	215	220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549734476
12	NC_022551	TA	3	6	225	230	50 %	50 %	0 %	0 %	549734476
13	NC_022551	AATA	2	8	252	259	75 %	25 %	0 %	0 %	549734476
14	NC_022551	CCAA	2	8	279	286	50 %	0 %	0 %	50 %	549734476
15	NC_022551	ATT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734476
16	NC_022551	T	7	7	324	330	0 %	100 %	0 %	0 %	549734476
17	NC_022551	TAAA	2	8	336	343	75 %	25 %	0 %	0 %	549734476
18	NC_022551	T	7	7	371	377	0 %	100 %	0 %	0 %	549734476
19	NC_022551	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734477
20	NC_022551	ACA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549734477
21	NC_022551	TACA	2	8	1120	1127	50 %	25 %	0 %	25 %	549734477
22	NC_022551	A	7	7	1183	1189	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
23	NC_022551	ATT	2	6	1243	1248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734477
24	NC_022551	TTCCTG	2	12	1273	1284	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	549734477
25	NC_022551	ATG	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
26	NC_022551	CTTATT	2	12	1339	1350	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549734477
27	NC_022551	GAT	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
28	NC_022551	T	6	6	1385	1390	0 %	100 %	0 %	0 %	549734477
29	NC_022551	AGA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549734477
30	NC_022551	AAT	2	6	1403	1408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734477
31	NC_022551	ATA	2	6	1459	1464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734477
32	NC_022551	CTTT	2	8	1545	1552	0 %	75 %	0 %	25 %	549734477
33	NC_022551	CAA	2	6	1584	1589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549734477
34	NC_022551	ATT	2	6	1590	1595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734477
35	NC_022551	T	6	6	1594	1599	0 %	100 %	0 %	0 %	549734477
36	NC_022551	TGA	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
37	NC_022551	A	7	7	1676	1682	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
38	NC_022551	TAG	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
39	NC_022551	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
40	NC_022551	A	6	6	1758	1763	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
41	NC_022551	CTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549734477
42	NC_022551	AGA	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549734477
43	NC_022551	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
44	NC_022551	TA	3	6	1899	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	549734477
45	NC_022551	AAC	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549734477
46	NC_022551	T	7	7	1931	1937	0 %	100 %	0 %	0 %	549734477
47	NC_022551	ATG	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734477
48	NC_022551	TCT	2	6	1998	2003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549734477
49	NC_022551	A	7	7	2004	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	549734477
50	NC_022551	T	6	6	2140	2145	0 %	100 %	0 %	0 %	549734478
51	NC_022551	ATT	2	6	2158	2163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
52	NC_022551	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
53	NC_022551	AT	3	6	2205	2210	50 %	50 %	0 %	0 %	549734478
54	NC_022551	TTA	2	6	2262	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
55	NC_022551	AAT	2	6	2269	2274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734478
56	NC_022551	TTA	2	6	2300	2305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734478
57	NC_022551	A	6	6	2318	2323	100 %	0 %	0 %	0 %	549734478
58	NC_022551	A	6	6	2374	2379	100 %	0 %	0 %	0 %	549734478
59	NC_022551	AT	3	6	2397	2402	50 %	50 %	0 %	0 %	549734478
60	NC_022551	TA	3	6	2459	2464	50 %	50 %	0 %	0 %	549734478
61	NC_022551	T	10	10	2699	2708	0 %	100 %	0 %	0 %	549734479
62	NC_022551	A	6	6	2712	2717	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
63	NC_022551	A	6	6	2731	2736	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
64	NC_022551	ATT	2	6	2760	2765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734479
65	NC_022551	A	9	9	2803	2811	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
66	NC_022551	AAG	2	6	2823	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549734479
67	NC_022551	A	6	6	2874	2879	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
68	NC_022551	A	9	9	2899	2907	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
69	NC_022551	T	7	7	2908	2914	0 %	100 %	0 %	0 %	549734479
70	NC_022551	T	7	7	2926	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	549734479
71	NC_022551	A	6	6	2934	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
72	NC_022551	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	549734479
73	NC_022551	AT	3	6	2958	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	549734479
74	NC_022551	TGA	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549734479
75	NC_022551	A	7	7	2990	2996	100 %	0 %	0 %	0 %	549734479
76	NC_022551	TAATT	2	10	2997	3006	40 %	60 %	0 %	0 %	549734479
77	NC_022551	T	9	9	3008	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480
78	NC_022551	ATTTT	2	10	3039	3048	20 %	80 %	0 %	0 %	549734480
79	NC_022551	T	7	7	3045	3051	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480
80	NC_022551	A	6	6	3058	3063	100 %	0 %	0 %	0 %	549734480
81	NC_022551	T	6	6	3089	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480
82	NC_022551	ATA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734480
83	NC_022551	TAGA	2	8	3111	3118	50 %	25 %	25 %	0 %	549734480
84	NC_022551	ATA	2	6	3123	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549734480
85	NC_022551	ATT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549734480
86	NC_022551	T	6	6	3238	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480
87	NC_022551	AATA	2	8	3253	3260	75 %	25 %	0 %	0 %	549734480
88	NC_022551	TTTC	2	8	3278	3285	0 %	75 %	0 %	25 %	549734480
89	NC_022551	A	6	6	3291	3296	100 %	0 %	0 %	0 %	549734480
90	NC_022551	T	9	9	3305	3313	0 %	100 %	0 %	0 %	549734480

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.