MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3 plasmid pBamNAU-B3a

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022531	T	7	7	603	609	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
2	NC_022531	GTA	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700064
3	NC_022531	T	7	7	818	824	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
4	NC_022531	AT	3	6	832	837	50 %	50 %	0 %	0 %	549700064
5	NC_022531	T	7	7	863	869	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
6	NC_022531	TGC	2	6	888	893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
7	NC_022531	T	6	6	921	926	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
8	NC_022531	TTCTG	2	10	975	984	0 %	60 %	20 %	20 %	549700064
9	NC_022531	ATTT	2	8	986	993	25 %	75 %	0 %	0 %	549700064
10	NC_022531	TTC	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
11	NC_022531	CAA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549700064
12	NC_022531	TTG	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
13	NC_022531	CTT	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
14	NC_022531	AG	4	8	1269	1276	50 %	0 %	50 %	0 %	549700064
15	NC_022531	T	6	6	1296	1301	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
16	NC_022531	T	6	6	1307	1312	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
17	NC_022531	TTG	2	6	1314	1319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
18	NC_022531	AATAG	2	10	1347	1356	60 %	20 %	20 %	0 %	549700064
19	NC_022531	TGT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
20	NC_022531	T	7	7	1418	1424	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
21	NC_022531	GTC	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
22	NC_022531	CGT	2	6	1487	1492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
23	NC_022531	AGT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700064
24	NC_022531	ACA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549700064
25	NC_022531	TTC	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
26	NC_022531	CTG	2	6	1574	1579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700064
27	NC_022531	TTATT	2	10	1586	1595	20 %	80 %	0 %	0 %	549700064
28	NC_022531	CTT	3	9	1598	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
29	NC_022531	T	7	7	1638	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
30	NC_022531	TGT	2	6	1649	1654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
31	NC_022531	TA	3	6	1729	1734	50 %	50 %	0 %	0 %	549700064
32	NC_022531	TGTA	2	8	1757	1764	25 %	50 %	25 %	0 %	549700064
33	NC_022531	CAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549700064
34	NC_022531	T	6	6	1834	1839	0 %	100 %	0 %	0 %	549700064
35	NC_022531	TGT	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700064
36	NC_022531	TCT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700064
37	NC_022531	GTAT	2	8	2808	2815	25 %	50 %	25 %	0 %	549700065
38	NC_022531	G	7	7	2817	2823	0 %	0 %	100 %	0 %	549700065
39	NC_022531	AAGA	2	8	2865	2872	75 %	0 %	25 %	0 %	549700065
40	NC_022531	A	6	6	2914	2919	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
41	NC_022531	A	6	6	3010	3015	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
42	NC_022531	AGC	2	6	3118	3123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
43	NC_022531	ATC	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549700065
44	NC_022531	TGT	2	6	3181	3186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700065
45	NC_022531	CATG	2	8	3221	3228	25 %	25 %	25 %	25 %	549700065
46	NC_022531	CGGC	2	8	3254	3261	0 %	0 %	50 %	50 %	549700065
47	NC_022531	GAT	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700065
48	NC_022531	AAG	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
49	NC_022531	ATCA	2	8	3405	3412	50 %	25 %	0 %	25 %	549700065
50	NC_022531	CAG	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
51	NC_022531	A	6	6	3519	3524	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
52	NC_022531	A	6	6	3594	3599	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
53	NC_022531	GCA	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549700065
54	NC_022531	GGC	2	6	3668	3673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549700065
55	NC_022531	GAA	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
56	NC_022531	AAGAT	2	10	3763	3772	60 %	20 %	20 %	0 %	549700065
57	NC_022531	GAG	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549700065
58	NC_022531	GCG	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549700065
59	NC_022531	GAA	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
60	NC_022531	AGA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700065
61	NC_022531	CGAAA	2	10	4010	4019	60 %	0 %	20 %	20 %	549700065
62	NC_022531	A	7	7	4017	4023	100 %	0 %	0 %	0 %	549700065
63	NC_022531	AGGT	2	8	4040	4047	25 %	25 %	50 %	0 %	549700065
64	NC_022531	GCT	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700065
65	NC_022531	AATA	2	8	4248	4255	75 %	25 %	0 %	0 %	549700065
66	NC_022531	TTC	2	6	4300	4305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
67	NC_022531	CCA	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549700066
68	NC_022531	T	7	7	4321	4327	0 %	100 %	0 %	0 %	549700066
69	NC_022531	AGTG	2	8	4380	4387	25 %	25 %	50 %	0 %	549700066
70	NC_022531	T	6	6	4409	4414	0 %	100 %	0 %	0 %	549700066
71	NC_022531	TTC	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
72	NC_022531	TCG	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549700066
73	NC_022531	AGTG	2	8	4567	4574	25 %	25 %	50 %	0 %	549700066
74	NC_022531	TTC	2	6	4677	4682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700066
75	NC_022531	GATT	2	8	5066	5073	25 %	50 %	25 %	0 %	549700067
76	NC_022531	AGA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700067
77	NC_022531	AGA	3	9	5180	5188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700067
78	NC_022531	TA	3	6	5860	5865	50 %	50 %	0 %	0 %	549700068
79	NC_022531	A	6	6	5880	5885	100 %	0 %	0 %	0 %	549700068
80	NC_022531	A	6	6	5912	5917	100 %	0 %	0 %	0 %	549700068
81	NC_022531	TTA	2	6	5947	5952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
82	NC_022531	TAT	2	6	5956	5961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
83	NC_022531	TGA	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
84	NC_022531	TTC	2	6	6015	6020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549700068
85	NC_022531	TGA	2	6	6198	6203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
86	NC_022531	ATTTT	2	10	6219	6228	20 %	80 %	0 %	0 %	549700068
87	NC_022531	T	6	6	6242	6247	0 %	100 %	0 %	0 %	549700068
88	NC_022531	TAT	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
89	NC_022531	AAG	2	6	6307	6312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
90	NC_022531	GAT	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549700068
91	NC_022531	A	6	6	6388	6393	100 %	0 %	0 %	0 %	549700068
92	NC_022531	GAA	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
93	NC_022531	A	6	6	6546	6551	100 %	0 %	0 %	0 %	549700068
94	NC_022531	TTA	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
95	NC_022531	GAGGG	2	10	6625	6634	20 %	0 %	80 %	0 %	549700068
96	NC_022531	T	6	6	6637	6642	0 %	100 %	0 %	0 %	549700068
97	NC_022531	TTG	2	6	6694	6699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549700068
98	NC_022531	ATT	2	6	6714	6719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549700068
99	NC_022531	A	6	6	6747	6752	100 %	0 %	0 %	0 %	549700068
100	NC_022531	AGCT	2	8	6800	6807	25 %	25 %	25 %	25 %	549700068
101	NC_022531	AAG	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549700068
102	NC_022531	TA	3	6	6855	6860	50 %	50 %	0 %	0 %	549700068

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.