MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021289	CAG	2	6	1256781	1256786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519506
31002	NC_021289	CGC	2	6	1256804	1256809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519506
31003	NC_021289	CGT	2	6	1256810	1256815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519506
31004	NC_021289	CGC	2	6	1256828	1256833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519506
31005	NC_021289	CCG	2	6	1256834	1256839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519506
31006	NC_021289	GCC	2	6	1256876	1256881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519506
31007	NC_021289	CGGCG	2	10	1256921	1256930	0 %	0 %	60 %	40 %	507519506
31008	NC_021289	GC	3	6	1256931	1256936	0 %	0 %	50 %	50 %	507519506
31009	NC_021289	GCG	2	6	1256983	1256988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519506
31010	NC_021289	CG	3	6	1257000	1257005	0 %	0 %	50 %	50 %	507519506
31011	NC_021289	GC	4	8	1257074	1257081	0 %	0 %	50 %	50 %	507519506
31012	NC_021289	TGC	2	6	1257097	1257102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519506
31013	NC_021289	GC	4	8	1257101	1257108	0 %	0 %	50 %	50 %	507519506
31014	NC_021289	CGG	2	6	1257113	1257118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519506
31015	NC_021289	GAC	2	6	1257146	1257151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519506
31016	NC_021289	CGT	2	6	1257158	1257163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519506
31017	NC_021289	TTGC	2	8	1257263	1257270	0 %	50 %	25 %	25 %	507519506
31018	NC_021289	GC	3	6	1257309	1257314	0 %	0 %	50 %	50 %	507519506
31019	NC_021289	TTG	2	6	1257315	1257320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507519506
31020	NC_021289	CGA	2	6	1257365	1257370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519506
31021	NC_021289	CG	3	6	1257384	1257389	0 %	0 %	50 %	50 %	507519506
31022	NC_021289	CGC	2	6	1257393	1257398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519506
31023	NC_021289	CGT	2	6	1257518	1257523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519506
31024	NC_021289	AGC	2	6	1257535	1257540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519506
31025	NC_021289	CG	4	8	1257551	1257558	0 %	0 %	50 %	50 %	507519506
31026	NC_021289	CGG	2	6	1257568	1257573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519506
31027	NC_021289	TCG	2	6	1257592	1257597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519506
31028	NC_021289	TTG	2	6	1257604	1257609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507519506
31029	NC_021289	CGCGCC	2	12	1257618	1257629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519506
31030	NC_021289	CCG	2	6	1257650	1257655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519506
31031	NC_021289	GTG	2	6	1257657	1257662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507519506
31032	NC_021289	TCGC	2	8	1257673	1257680	0 %	25 %	25 %	50 %	507519506
31033	NC_021289	GAT	2	6	1257750	1257755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519506
31034	NC_021289	GC	3	6	1257789	1257794	0 %	0 %	50 %	50 %	507519506
31035	NC_021289	TCGG	2	8	1257823	1257830	0 %	25 %	50 %	25 %	507519506
31036	NC_021289	GCA	2	6	1257834	1257839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519506
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31038	NC_021289	CGG	2	6	1257882	1257887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519506
31039	NC_021289	CGA	2	6	1258238	1258243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519507
31040	NC_021289	GAA	3	9	1258254	1258262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507519507
31041	NC_021289	TCG	2	6	1258295	1258300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
31042	NC_021289	GTG	2	6	1258363	1258368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507519507
31043	NC_021289	AAG	2	6	1258369	1258374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507519507
31044	NC_021289	ATC	2	6	1258411	1258416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519507
31045	NC_021289	CTG	3	9	1258454	1258462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
31046	NC_021289	CTG	2	6	1258466	1258471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
31047	NC_021289	CTG	3	9	1258475	1258483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
31048	NC_021289	CGC	2	6	1258491	1258496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519507
31049	NC_021289	CGC	3	9	1258515	1258523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519507
31050	NC_021289	CTCCCG	3	18	1258529	1258546	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	507519507
31051	NC_021289	TGATCG	2	12	1258580	1258591	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507519507
31052	NC_021289	CGG	2	6	1258602	1258607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
31053	NC_021289	CGC	2	6	1258614	1258619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519507
31054	NC_021289	CGGC	2	8	1258676	1258683	0 %	0 %	50 %	50 %	507519507
31055	NC_021289	CGG	2	6	1258695	1258700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
31056	NC_021289	GCT	2	6	1258737	1258742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
31057	NC_021289	CGT	2	6	1258745	1258750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
31058	NC_021289	CGGCAT	2	12	1258791	1258802	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507519507
31059	NC_021289	TCG	2	6	1258853	1258858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519507
31060	NC_021289	AGA	2	6	1258859	1258864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507519507
31061	NC_021289	GCG	2	6	1258871	1258876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
31062	NC_021289	CGG	2	6	1258944	1258949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
31063	NC_021289	GCG	2	6	1258970	1258975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
31064	NC_021289	ATC	2	6	1259011	1259016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519507
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31066	NC_021289	GC	3	6	1259087	1259092	0 %	0 %	50 %	50 %	507519507
31067	NC_021289	GAA	2	6	1259112	1259117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507519507
31068	NC_021289	CGAC	2	8	1259225	1259232	25 %	0 %	25 %	50 %	507519507
31069	NC_021289	AAGGAC	2	12	1259347	1259358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	507519507
31070	NC_021289	GGA	2	6	1259562	1259567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507519507
31071	NC_021289	TGG	2	6	1259579	1259584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507519507
31072	NC_021289	ATC	2	6	1259590	1259595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519507
31073	NC_021289	GGCC	2	8	1259715	1259722	0 %	0 %	50 %	50 %	507519507
31074	NC_021289	CG	3	6	1259746	1259751	0 %	0 %	50 %	50 %	507519507
31075	NC_021289	ATGGGC	2	12	1259752	1259763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	507519507
31076	NC_021289	GACG	2	8	1259766	1259773	25 %	0 %	50 %	25 %	507519507
31077	NC_021289	TCA	2	6	1259777	1259782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519507
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31079	NC_021289	CAT	2	6	1259826	1259831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519507
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31081	NC_021289	GGA	2	6	1259895	1259900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507519507
31082	NC_021289	CATCCG	2	12	1259917	1259928	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	507519507
31083	NC_021289	GGC	2	6	1259952	1259957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519507
31084	NC_021289	GC	3	6	1259973	1259978	0 %	0 %	50 %	50 %	507519507
31085	NC_021289	GTCGAT	2	12	1260033	1260044	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507519508
31086	NC_021289	TCGC	2	8	1260061	1260068	0 %	25 %	25 %	50 %	507519508
31087	NC_021289	CGC	2	6	1260072	1260077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519508
31088	NC_021289	GC	3	6	1260144	1260149	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
31089	NC_021289	GTCC	2	8	1260179	1260186	0 %	25 %	25 %	50 %	507519508
31090	NC_021289	CAT	2	6	1260195	1260200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507519508
31091	NC_021289	CGATGT	2	12	1260215	1260226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	507519508
31092	NC_021289	GTC	2	6	1260333	1260338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31093	NC_021289	AGC	2	6	1260346	1260351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31094	NC_021289	CGG	2	6	1260355	1260360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519508
31095	NC_021289	GC	3	6	1260382	1260387	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
31096	NC_021289	GCA	2	6	1260395	1260400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31097	NC_021289	CGG	2	6	1260413	1260418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519508
31098	NC_021289	GC	4	8	1260480	1260487	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
31099	NC_021289	TGA	3	9	1260491	1260499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519508
31100	NC_021289	CGG	2	6	1260570	1260575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519508
31101	NC_021289	CGC	2	6	1260617	1260622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507519508
31102	NC_021289	GAT	2	6	1260648	1260653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519508
31103	NC_021289	TCG	2	6	1260668	1260673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31104	NC_021289	CGA	2	6	1260746	1260751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31105	NC_021289	GC	3	6	1260765	1260770	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
31106	NC_021289	GTC	2	6	1260771	1260776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31107	NC_021289	CCA	2	6	1260779	1260784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507519508
31108	NC_021289	GCA	2	6	1260785	1260790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31109	NC_021289	TCT	2	6	1260800	1260805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519508
31110	NC_021289	GCT	2	6	1260807	1260812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31111	NC_021289	TTC	2	6	1260816	1260821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519508
31112	NC_021289	CG	3	6	1260851	1260856	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
31113	NC_021289	TGC	2	6	1260897	1260902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31114	NC_021289	CGACA	2	10	1260921	1260930	40 %	0 %	20 %	40 %	507519508
31115	NC_021289	GCA	3	9	1260974	1260982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507519508
31116	NC_021289	GC	3	6	1261031	1261036	0 %	0 %	50 %	50 %	507519508
31117	NC_021289	CTCG	2	8	1261059	1261066	0 %	25 %	25 %	50 %	507519508
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31219	NC_021289	TTC	2	6	1265385	1265390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519512
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31222	NC_021289	TCT	2	6	1265465	1265470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507519512
31223	NC_021289	TGC	2	6	1265554	1265559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519512
31224	NC_021289	CG	3	6	1265592	1265597	0 %	0 %	50 %	50 %	507519512
31225	NC_021289	CGTTG	2	10	1265643	1265652	0 %	40 %	40 %	20 %	507519512
31226	NC_021289	CGT	2	6	1265687	1265692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519512
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31344	NC_021289	GC	3	6	1271048	1271053	0 %	0 %	50 %	50 %	507519515
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31346	NC_021289	TCG	2	6	1271165	1271170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519515
31347	NC_021289	GTC	2	6	1271196	1271201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507519515
31348	NC_021289	GTA	2	6	1271205	1271210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507519515
31349	NC_021289	GCG	2	6	1271239	1271244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507519515
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