MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021289	ACC	2	6	572383	572388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518839
14002	NC_021289	CGA	2	6	572477	572482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518839
14003	NC_021289	CAC	2	6	572484	572489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518839
14004	NC_021289	GCG	2	6	572516	572521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518839
14005	NC_021289	TGAT	2	8	572536	572543	25 %	50 %	25 %	0 %	507518839
14006	NC_021289	CCG	2	6	572602	572607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518839
14007	NC_021289	GTC	2	6	572617	572622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518839
14008	NC_021289	GGC	2	6	572631	572636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518839
14009	NC_021289	CGG	2	6	572681	572686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518839
14010	NC_021289	CG	3	6	572750	572755	0 %	0 %	50 %	50 %	507518840
14011	NC_021289	CGC	2	6	572841	572846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518840
14012	NC_021289	CCG	2	6	572913	572918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518840
14013	NC_021289	TCATCG	2	12	572990	573001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507518841
14014	NC_021289	CGG	2	6	573009	573014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518841
14015	NC_021289	CG	3	6	573066	573071	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14016	NC_021289	CGGC	2	8	573155	573162	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14017	NC_021289	CGGCG	2	10	573228	573237	0 %	0 %	60 %	40 %	507518841
14018	NC_021289	CTG	2	6	573238	573243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14019	NC_021289	CG	3	6	573258	573263	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14020	NC_021289	ACG	2	6	573325	573330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14021	NC_021289	CGC	2	6	573331	573336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518841
14022	NC_021289	CGGCG	2	10	573357	573366	0 %	0 %	60 %	40 %	507518841
14023	NC_021289	TCT	2	6	573372	573377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518841
14024	NC_021289	GCG	2	6	573424	573429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518841
14025	NC_021289	CGG	3	9	573452	573460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518841
14026	NC_021289	TGC	2	6	573465	573470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14027	NC_021289	GCG	2	6	573484	573489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518841
14028	NC_021289	GC	3	6	573522	573527	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14029	NC_021289	CG	3	6	573574	573579	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14030	NC_021289	GTT	2	6	573594	573599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518841
14031	NC_021289	GCT	2	6	573636	573641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14032	NC_021289	GC	3	6	573656	573661	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14033	NC_021289	TCG	2	6	573686	573691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14034	NC_021289	CGAA	2	8	573700	573707	50 %	0 %	25 %	25 %	507518841
14035	NC_021289	GCAT	2	8	573708	573715	25 %	25 %	25 %	25 %	507518841
14036	NC_021289	GC	4	8	573734	573741	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14037	NC_021289	CGA	2	6	573755	573760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14038	NC_021289	CGA	2	6	573806	573811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14039	NC_021289	CCG	2	6	573836	573841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518841
14040	NC_021289	GGTCGT	2	12	573858	573869	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	507518841
14041	NC_021289	ACG	2	6	573947	573952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14042	NC_021289	GC	4	8	574017	574024	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14043	NC_021289	CGAT	2	8	574055	574062	25 %	25 %	25 %	25 %	507518841
14044	NC_021289	GC	3	6	574080	574085	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14045	NC_021289	CAAT	2	8	574092	574099	50 %	25 %	0 %	25 %	507518841
14046	NC_021289	TCG	2	6	574118	574123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14047	NC_021289	CAC	2	6	574147	574152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518841
14048	NC_021289	AGG	2	6	574161	574166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518841
14049	NC_021289	TTGC	2	8	574198	574205	0 %	50 %	25 %	25 %	507518841
14050	NC_021289	GAC	2	6	574218	574223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14051	NC_021289	GCG	2	6	574253	574258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518841
14052	NC_021289	GCA	2	6	574264	574269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14053	NC_021289	CGG	2	6	574277	574282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518841
14054	NC_021289	ATCGG	2	10	574285	574294	20 %	20 %	40 %	20 %	507518841
14055	NC_021289	CGC	2	6	574337	574342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518841
14056	NC_021289	GCA	2	6	574362	574367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14057	NC_021289	CGG	2	6	574431	574436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518841
14058	NC_021289	CTG	2	6	574451	574456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518841
14059	NC_021289	GC	3	6	574489	574494	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14060	NC_021289	CGAT	2	8	574553	574560	25 %	25 %	25 %	25 %	507518841
14061	NC_021289	CGC	2	6	574596	574601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518841
14062	NC_021289	GC	3	6	574625	574630	0 %	0 %	50 %	50 %	507518841
14063	NC_021289	GCG	2	6	574655	574660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518841
14064	NC_021289	CGC	2	6	574800	574805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518842
14065	NC_021289	GCG	2	6	574827	574832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518842
14066	NC_021289	CG	3	6	574846	574851	0 %	0 %	50 %	50 %	507518842
14067	NC_021289	CGG	3	9	574859	574867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518842
14068	NC_021289	TGC	2	6	574888	574893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518842
14069	NC_021289	CAT	2	6	574904	574909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518842
14070	NC_021289	GC	3	6	574978	574983	0 %	0 %	50 %	50 %	507518842
14071	NC_021289	CGG	3	9	574996	575004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518842
14072	NC_021289	CGG	2	6	575017	575022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518842
14073	NC_021289	TGA	2	6	575023	575028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518842
14074	NC_021289	CGA	2	6	575053	575058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518842
14075	NC_021289	CG	3	6	575099	575104	0 %	0 %	50 %	50 %	507518842
14076	NC_021289	GCG	2	6	575119	575124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518842
14077	NC_021289	CG	3	6	575177	575182	0 %	0 %	50 %	50 %	507518842
14078	NC_021289	GAC	2	6	575198	575203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518842
14079	NC_021289	TCG	2	6	575283	575288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518843
14080	NC_021289	CGG	2	6	575332	575337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518843
14081	NC_021289	CGA	2	6	575365	575370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518843
14082	NC_021289	CAC	2	6	575387	575392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518843
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14084	NC_021289	CGG	2	6	575548	575553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518843
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14086	NC_021289	CG	3	6	575585	575590	0 %	0 %	50 %	50 %	507518843
14087	NC_021289	CG	3	6	575622	575627	0 %	0 %	50 %	50 %	507518843
14088	NC_021289	ACG	2	6	575706	575711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518843
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14090	NC_021289	CTT	2	6	575743	575748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518843
14091	NC_021289	CTGA	2	8	575783	575790	25 %	25 %	25 %	25 %	507518843
14092	NC_021289	ATC	2	6	575856	575861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518843
14093	NC_021289	GCG	2	6	575884	575889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518843
14094	NC_021289	GAG	2	6	575926	575931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518843
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14099	NC_021289	TCG	2	6	576232	576237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518844
14100	NC_021289	CGA	2	6	576284	576289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518844
14101	NC_021289	TGC	2	6	576295	576300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518844
14102	NC_021289	TCG	3	9	576325	576333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518844
14103	NC_021289	GC	3	6	576374	576379	0 %	0 %	50 %	50 %	507518844
14104	NC_021289	GAA	2	6	576440	576445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518844
14105	NC_021289	TCA	2	6	576457	576462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518844
14106	NC_021289	GC	3	6	576508	576513	0 %	0 %	50 %	50 %	507518844
14107	NC_021289	GTC	2	6	576516	576521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518844
14108	NC_021289	CGG	2	6	576530	576535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518844
14109	NC_021289	TTC	2	6	576573	576578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518844
14110	NC_021289	TCG	2	6	576649	576654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518844
14111	NC_021289	GC	3	6	576660	576665	0 %	0 %	50 %	50 %	507518844
14112	NC_021289	GCG	2	6	576709	576714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518844
14113	NC_021289	CGA	2	6	576842	576847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518844
14114	NC_021289	TCA	2	6	576940	576945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518844
14115	NC_021289	CGA	2	6	576946	576951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518844
14116	NC_021289	CCG	2	6	576962	576967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518844
14117	NC_021289	GATC	2	8	576982	576989	25 %	25 %	25 %	25 %	507518844
14118	NC_021289	TGC	2	6	576994	576999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518844
14119	NC_021289	ATC	2	6	577006	577011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518844
14120	NC_021289	ACT	2	6	577012	577017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518844
14121	NC_021289	GC	3	6	577028	577033	0 %	0 %	50 %	50 %	507518844
14122	NC_021289	CG	3	6	577046	577051	0 %	0 %	50 %	50 %	507518844
14123	NC_021289	AGGAAG	2	12	577186	577197	50 %	0 %	50 %	0 %	507518844
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14127	NC_021289	CGA	2	6	577246	577251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518844
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14132	NC_021289	TGC	2	6	577511	577516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518845
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14142	NC_021289	GGCAA	2	10	577876	577885	40 %	0 %	40 %	20 %	507518845
14143	NC_021289	CGGG	2	8	577940	577947	0 %	0 %	75 %	25 %	507518845
14144	NC_021289	GCAT	2	8	577970	577977	25 %	25 %	25 %	25 %	507518845
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14147	NC_021289	CG	3	6	578060	578065	0 %	0 %	50 %	50 %	507518845
14148	NC_021289	CG	3	6	578081	578086	0 %	0 %	50 %	50 %	507518845
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14240	NC_021289	GC	3	6	581742	581747	0 %	0 %	50 %	50 %	507518851
14241	NC_021289	TTCG	2	8	581752	581759	0 %	50 %	25 %	25 %	507518851
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14361	NC_021289	GCC	2	6	586912	586917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518859
14362	NC_021289	TCG	2	6	586949	586954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518859
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14364	NC_021289	ATC	2	6	587047	587052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518859
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14392	NC_021289	GCG	2	6	588273	588278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518860
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14481	NC_021289	CGT	2	6	591642	591647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518863
14482	NC_021289	CG	3	6	591682	591687	0 %	0 %	50 %	50 %	507518863
14483	NC_021289	GGC	2	6	591745	591750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518863
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