MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021289	ACG	2	6	549940	549945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518816
13502	NC_021289	GCC	2	6	549962	549967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518816
13503	NC_021289	CG	3	6	550027	550032	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
13504	NC_021289	GCCG	2	8	550061	550068	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
13505	NC_021289	GAC	2	6	550135	550140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518817
13506	NC_021289	GCAC	2	8	550235	550242	25 %	0 %	25 %	50 %	507518817
13507	NC_021289	GGC	2	6	550328	550333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518817
13508	NC_021289	AGA	2	6	550412	550417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518817
13509	NC_021289	CTG	2	6	550540	550545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13510	NC_021289	CG	3	6	550605	550610	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13511	NC_021289	CGA	2	6	550629	550634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13512	NC_021289	CG	3	6	550644	550649	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13513	NC_021289	CGA	2	6	550659	550664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13514	NC_021289	TGC	2	6	550677	550682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13515	NC_021289	CTT	2	6	550686	550691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518818
13516	NC_021289	GGC	2	6	550720	550725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
13517	NC_021289	CG	5	10	550831	550840	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13518	NC_021289	GCG	2	6	550918	550923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
13519	NC_021289	TCG	2	6	550947	550952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13520	NC_021289	ACG	2	6	550955	550960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13521	NC_021289	CTG	2	6	550968	550973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13522	NC_021289	CGC	2	6	550974	550979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
13523	NC_021289	CGC	2	6	550987	550992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
13524	NC_021289	CCGATG	2	12	550995	551006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13525	NC_021289	CTG	2	6	551044	551049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13526	NC_021289	CGC	2	6	551077	551082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
13527	NC_021289	CGC	2	6	551098	551103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
13528	NC_021289	GCT	2	6	551131	551136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13529	NC_021289	GCG	2	6	551141	551146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
13530	NC_021289	GC	3	6	551149	551154	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13531	NC_021289	TGCGC	2	10	551179	551188	0 %	20 %	40 %	40 %	507518818
13532	NC_021289	GC	3	6	551234	551239	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13533	NC_021289	GGC	2	6	551244	551249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
13534	NC_021289	CT	3	6	551260	551265	0 %	50 %	0 %	50 %	507518818
13535	NC_021289	CGCC	2	8	551292	551299	0 %	0 %	25 %	75 %	507518818
13536	NC_021289	GC	3	6	551315	551320	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13537	NC_021289	CAT	2	6	551325	551330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518818
13538	NC_021289	CGA	2	6	551376	551381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13539	NC_021289	GCA	2	6	551382	551387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13540	NC_021289	CGA	2	6	551388	551393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13541	NC_021289	TCG	2	6	551450	551455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13542	NC_021289	GCC	2	6	551467	551472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
13543	NC_021289	ATC	2	6	551474	551479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518818
13544	NC_021289	CATTGC	2	12	551480	551491	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507518818
13545	NC_021289	GCC	2	6	551521	551526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518818
13546	NC_021289	CG	3	6	551532	551537	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13547	NC_021289	AGC	2	6	551657	551662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13548	NC_021289	CGA	3	9	551691	551699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13549	NC_021289	GCG	2	6	551750	551755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
13550	NC_021289	GC	3	6	551787	551792	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13551	NC_021289	TTGC	2	8	551842	551849	0 %	50 %	25 %	25 %	507518818
13552	NC_021289	GCG	2	6	551858	551863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518818
13553	NC_021289	CTT	2	6	551953	551958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518818
13554	NC_021289	GTG	2	6	551966	551971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518818
13555	NC_021289	TCG	2	6	551984	551989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13556	NC_021289	GC	3	6	551995	552000	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13557	NC_021289	TCG	2	6	552006	552011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13558	NC_021289	TCG	2	6	552026	552031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13559	NC_021289	GTT	2	6	552058	552063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518818
13560	NC_021289	TCG	2	6	552128	552133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13561	NC_021289	ATC	2	6	552218	552223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518818
13562	NC_021289	ACG	2	6	552320	552325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518818
13563	NC_021289	GC	3	6	552336	552341	0 %	0 %	50 %	50 %	507518818
13564	NC_021289	GCG	2	6	552485	552490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518819
13565	NC_021289	CG	3	6	552511	552516	0 %	0 %	50 %	50 %	507518819
13566	NC_021289	GCG	3	9	552579	552587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518819
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13568	NC_021289	CGG	2	6	552631	552636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518819
13569	NC_021289	GGC	2	6	552640	552645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518819
13570	NC_021289	CGA	2	6	552805	552810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518819
13571	NC_021289	CGG	2	6	552818	552823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518819
13572	NC_021289	GCG	2	6	552832	552837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518819
13573	NC_021289	CGTG	2	8	552838	552845	0 %	25 %	50 %	25 %	507518819
13574	NC_021289	GCC	2	6	552873	552878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518819
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13577	NC_021289	GCGA	2	8	552987	552994	25 %	0 %	50 %	25 %	507518819
13578	NC_021289	CG	3	6	553005	553010	0 %	0 %	50 %	50 %	507518819
13579	NC_021289	AGC	2	6	553056	553061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518819
13580	NC_021289	AGC	2	6	553140	553145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518819
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13585	NC_021289	GCA	2	6	553267	553272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518819
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13587	NC_021289	CGT	2	6	553812	553817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518820
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13589	NC_021289	CTT	2	6	553860	553865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518820
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13592	NC_021289	GCT	2	6	553998	554003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518820
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13598	NC_021289	CG	3	6	554209	554214	0 %	0 %	50 %	50 %	507518820
13599	NC_021289	GC	3	6	554304	554309	0 %	0 %	50 %	50 %	507518820
13600	NC_021289	ATC	2	6	554320	554325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518820
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13602	NC_021289	TTC	2	6	554359	554364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518820
13603	NC_021289	CGAA	2	8	554408	554415	50 %	0 %	25 %	25 %	507518820
13604	NC_021289	CGA	2	6	554418	554423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518820
13605	NC_021289	GCC	2	6	554431	554436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518820
13606	NC_021289	GC	3	6	554459	554464	0 %	0 %	50 %	50 %	507518820
13607	NC_021289	TCA	2	6	554480	554485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518820
13608	NC_021289	TCG	2	6	554510	554515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518820
13609	NC_021289	GTG	2	6	554538	554543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518820
13610	NC_021289	CG	3	6	554582	554587	0 %	0 %	50 %	50 %	507518820
13611	NC_021289	GCA	2	6	554598	554603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518820
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13613	NC_021289	GCA	2	6	554648	554653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518820
13614	NC_021289	CGG	3	9	554655	554663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518820
13615	NC_021289	GCT	2	6	554679	554684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518820
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13617	NC_021289	TGC	2	6	554747	554752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518820
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13739	NC_021289	CTG	2	6	560700	560705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518826
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13743	NC_021289	CG	3	6	560803	560808	0 %	0 %	50 %	50 %	507518826
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13977	NC_021289	TCG	2	6	571477	571482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518838
13978	NC_021289	CGC	2	6	571495	571500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518838
13979	NC_021289	TGA	2	6	571555	571560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518838
13980	NC_021289	TCG	2	6	571573	571578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518838
13981	NC_021289	TCG	2	6	571600	571605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518838
13982	NC_021289	ATC	2	6	571609	571614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518838
13983	NC_021289	TGC	2	6	571648	571653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518838
13984	NC_021289	CTG	2	6	571677	571682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518838
13985	NC_021289	ATC	2	6	571683	571688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518838
13986	NC_021289	GCG	2	6	571689	571694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518838
13987	NC_021289	GGC	2	6	571701	571706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518838
13988	NC_021289	AGA	2	6	571711	571716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518838
13989	NC_021289	GTG	2	6	571752	571757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518838
13990	NC_021289	CGA	2	6	571814	571819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518838
13991	NC_021289	CGC	2	6	571871	571876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518838
13992	NC_021289	GCG	2	6	571908	571913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518838
13993	NC_021289	GTT	2	6	571925	571930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518838
13994	NC_021289	AGGCTG	2	12	572039	572050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	507518838
13995	NC_021289	CTTG	2	8	572126	572133	0 %	50 %	25 %	25 %	507518839
13996	NC_021289	CAAGC	2	10	572139	572148	40 %	0 %	20 %	40 %	507518839
13997	NC_021289	CTT	2	6	572162	572167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518839
13998	NC_021289	GATC	2	8	572222	572229	25 %	25 %	25 %	25 %	507518839
13999	NC_021289	ATTG	2	8	572249	572256	25 %	50 %	25 %	0 %	507518839
14000	NC_021289	GTT	2	6	572337	572342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518839

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