MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021289	CG	4	8	527043	527050	0 %	0 %	50 %	50 %	507518793
13002	NC_021289	TCG	2	6	527072	527077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13003	NC_021289	TTC	2	6	527095	527100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518793
13004	NC_021289	GCT	2	6	527149	527154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13005	NC_021289	GCC	2	6	527167	527172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518793
13006	NC_021289	CAT	2	6	527173	527178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518793
13007	NC_021289	GCC	2	6	527218	527223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518793
13008	NC_021289	GCGAC	2	10	527227	527236	20 %	0 %	40 %	40 %	507518793
13009	NC_021289	GCGCAC	2	12	527323	527334	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507518793
13010	NC_021289	ACG	2	6	527343	527348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13011	NC_021289	ACG	2	6	527381	527386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13012	NC_021289	GAC	2	6	527396	527401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13013	NC_021289	TGA	2	6	527430	527435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518793
13014	NC_021289	GATCGA	2	12	527487	527498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507518793
13015	NC_021289	ACG	2	6	527540	527545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13016	NC_021289	TTC	2	6	527551	527556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518793
13017	NC_021289	AAT	2	6	527619	527624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507518793
13018	NC_021289	CGG	2	6	527661	527666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518793
13019	NC_021289	GCA	2	6	527727	527732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13020	NC_021289	ACG	2	6	527787	527792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13021	NC_021289	CGC	2	6	527806	527811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518793
13022	NC_021289	GCGTC	2	10	527941	527950	0 %	20 %	40 %	40 %	507518793
13023	NC_021289	GGC	2	6	528031	528036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518793
13024	NC_021289	TCG	2	6	528041	528046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13025	NC_021289	GGAT	2	8	528047	528054	25 %	25 %	50 %	0 %	507518793
13026	NC_021289	CGA	2	6	528090	528095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13027	NC_021289	CGG	2	6	528192	528197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518793
13028	NC_021289	AGC	2	6	528200	528205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13029	NC_021289	CG	4	8	528213	528220	0 %	0 %	50 %	50 %	507518793
13030	NC_021289	T	6	6	528241	528246	0 %	100 %	0 %	0 %	507518793
13031	NC_021289	ACG	2	6	528330	528335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13032	NC_021289	CGG	2	6	528369	528374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518793
13033	NC_021289	AGG	2	6	528428	528433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518793
13034	NC_021289	GAT	2	6	528466	528471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518793
13035	NC_021289	CTCG	2	8	528472	528479	0 %	25 %	25 %	50 %	507518793
13036	NC_021289	CGCC	2	8	528501	528508	0 %	0 %	25 %	75 %	507518793
13037	NC_021289	TGA	2	6	528546	528551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518793
13038	NC_021289	GATT	2	8	528555	528562	25 %	50 %	25 %	0 %	507518793
13039	NC_021289	CGT	2	6	528583	528588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13040	NC_021289	TGCGCG	2	12	528618	528629	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	507518793
13041	NC_021289	AAC	2	6	528659	528664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507518793
13042	NC_021289	CCA	2	6	528718	528723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518793
13043	NC_021289	GAT	2	6	528730	528735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518793
13044	NC_021289	TCG	2	6	528737	528742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13045	NC_021289	CG	3	6	528741	528746	0 %	0 %	50 %	50 %	507518793
13046	NC_021289	GCC	2	6	528752	528757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518793
13047	NC_021289	CGA	2	6	528759	528764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
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13049	NC_021289	CGT	3	9	528826	528834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13050	NC_021289	CGA	2	6	528900	528905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13051	NC_021289	ACGG	2	8	528918	528925	25 %	0 %	50 %	25 %	507518793
13052	NC_021289	CGCC	2	8	528966	528973	0 %	0 %	25 %	75 %	507518793
13053	NC_021289	GTT	2	6	529183	529188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518793
13054	NC_021289	AGCG	2	8	529292	529299	25 %	0 %	50 %	25 %	507518793
13055	NC_021289	CG	4	8	529305	529312	0 %	0 %	50 %	50 %	507518793
13056	NC_021289	CCA	2	6	529350	529355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518793
13057	NC_021289	CGT	2	6	529366	529371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518793
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13059	NC_021289	CG	5	10	529411	529420	0 %	0 %	50 %	50 %	507518793
13060	NC_021289	CGC	2	6	529429	529434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518793
13061	NC_021289	CGT	2	6	529435	529440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518793
13062	NC_021289	GAG	2	6	529498	529503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518793
13063	NC_021289	GAT	2	6	529516	529521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518793
13064	NC_021289	TTG	2	6	530083	530088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518794
13065	NC_021289	ATCTG	2	10	530093	530102	20 %	40 %	20 %	20 %	507518794
13066	NC_021289	CTG	3	9	530113	530121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518794
13067	NC_021289	TC	3	6	530154	530159	0 %	50 %	0 %	50 %	507518794
13068	NC_021289	ACG	2	6	530187	530192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518794
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13070	NC_021289	GAT	2	6	530254	530259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518795
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13073	NC_021289	GC	3	6	530431	530436	0 %	0 %	50 %	50 %	507518795
13074	NC_021289	GCG	2	6	530456	530461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518795
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13078	NC_021289	GC	3	6	530622	530627	0 %	0 %	50 %	50 %	507518795
13079	NC_021289	GCG	2	6	530663	530668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518795
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13084	NC_021289	GCG	2	6	530889	530894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518795
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13087	NC_021289	CG	3	6	531028	531033	0 %	0 %	50 %	50 %	507518795
13088	NC_021289	ACGC	2	8	531044	531051	25 %	0 %	25 %	50 %	507518795
13089	NC_021289	CG	3	6	531085	531090	0 %	0 %	50 %	50 %	507518796
13090	NC_021289	GC	3	6	531094	531099	0 %	0 %	50 %	50 %	507518796
13091	NC_021289	CG	4	8	531123	531130	0 %	0 %	50 %	50 %	507518796
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13095	NC_021289	GC	3	6	531294	531299	0 %	0 %	50 %	50 %	507518796
13096	NC_021289	GC	3	6	531337	531342	0 %	0 %	50 %	50 %	507518796
13097	NC_021289	CG	3	6	531355	531360	0 %	0 %	50 %	50 %	507518796
13098	NC_021289	GC	4	8	531369	531376	0 %	0 %	50 %	50 %	507518796
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13104	NC_021289	GC	3	6	531557	531562	0 %	0 %	50 %	50 %	507518796
13105	NC_021289	GCG	3	9	531586	531594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518796
13106	NC_021289	AAGC	2	8	531649	531656	50 %	0 %	25 %	25 %	507518796
13107	NC_021289	GGC	2	6	531674	531679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518796
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13109	NC_021289	GCG	2	6	531742	531747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518796
13110	NC_021289	GCC	2	6	531957	531962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518797
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13112	NC_021289	GCT	2	6	532062	532067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518797
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13115	NC_021289	CGG	2	6	532187	532192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518797
13116	NC_021289	CATG	2	8	532211	532218	25 %	25 %	25 %	25 %	507518797
13117	NC_021289	GC	3	6	532219	532224	0 %	0 %	50 %	50 %	507518797
13118	NC_021289	TCTT	2	8	532243	532250	0 %	75 %	0 %	25 %	507518797
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13120	NC_021289	GCG	2	6	532442	532447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518798
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13241	NC_021289	TCA	2	6	537840	537845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518804
13242	NC_021289	GAT	2	6	537856	537861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518804
13243	NC_021289	GCC	2	6	537877	537882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518804
13244	NC_021289	GCAT	2	8	537956	537963	25 %	25 %	25 %	25 %	507518804
13245	NC_021289	CG	3	6	537996	538001	0 %	0 %	50 %	50 %	507518804
13246	NC_021289	TCTT	2	8	538055	538062	0 %	75 %	0 %	25 %	507518804
13247	NC_021289	GCG	2	6	538097	538102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518804
13248	NC_021289	ATCG	2	8	538114	538121	25 %	25 %	25 %	25 %	507518804
13249	NC_021289	CG	5	10	538120	538129	0 %	0 %	50 %	50 %	507518804
13250	NC_021289	ACG	2	6	538164	538169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518804
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13252	NC_021289	GC	3	6	538275	538280	0 %	0 %	50 %	50 %	507518804
13253	NC_021289	GCTTCG	2	12	538340	538351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518804
13254	NC_021289	ATC	3	9	538382	538390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518804
13255	NC_021289	GCC	2	6	538400	538405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518804
13256	NC_021289	TGCATC	2	12	538421	538432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507518804
13257	NC_021289	GCCG	2	8	538443	538450	0 %	0 %	50 %	50 %	507518804
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13260	NC_021289	GCAA	2	8	538625	538632	50 %	0 %	25 %	25 %	507518804
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13264	NC_021289	CGC	2	6	538729	538734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518804
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13331	NC_021289	CGA	2	6	541918	541923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518807
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13342	NC_021289	TCT	2	6	542486	542491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518808
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13347	NC_021289	TCG	2	6	542853	542858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518808
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13350	NC_021289	GCC	2	6	542985	542990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518808
13351	NC_021289	CGA	2	6	543008	543013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518808
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13353	NC_021289	GC	3	6	543029	543034	0 %	0 %	50 %	50 %	507518808
13354	NC_021289	CGAAG	2	10	543083	543092	40 %	0 %	40 %	20 %	507518808
13355	NC_021289	CG	3	6	543140	543145	0 %	0 %	50 %	50 %	507518808
13356	NC_021289	AGC	2	6	543213	543218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518808
13357	NC_021289	CG	4	8	543223	543230	0 %	0 %	50 %	50 %	507518808
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13479	NC_021289	AGCGA	2	10	549163	549172	40 %	0 %	40 %	20 %	507518816
13480	NC_021289	GC	4	8	549174	549181	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
13481	NC_021289	CGC	2	6	549206	549211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518816
13482	NC_021289	TCT	2	6	549281	549286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518816
13483	NC_021289	GC	3	6	549292	549297	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
13484	NC_021289	CGG	2	6	549310	549315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518816
13485	NC_021289	GGCAC	2	10	549337	549346	20 %	0 %	40 %	40 %	507518816
13486	NC_021289	CGT	2	6	549391	549396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518816
13487	NC_021289	CGA	2	6	549415	549420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518816
13488	NC_021289	TCA	2	6	549443	549448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518816
13489	NC_021289	TCG	2	6	549460	549465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518816
13490	NC_021289	CCGA	2	8	549498	549505	25 %	0 %	25 %	50 %	507518816
13491	NC_021289	CGG	2	6	549547	549552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518816
13492	NC_021289	GAAGA	2	10	549600	549609	60 %	0 %	40 %	0 %	507518816
13493	NC_021289	GC	3	6	549651	549656	0 %	0 %	50 %	50 %	507518816
13494	NC_021289	CGC	2	6	549686	549691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518816
13495	NC_021289	CATTC	2	10	549705	549714	20 %	40 %	0 %	40 %	507518816
13496	NC_021289	GCT	2	6	549719	549724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518816
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13498	NC_021289	ATC	2	6	549814	549819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518816
13499	NC_021289	TGA	3	9	549838	549846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518816
13500	NC_021289	CTTT	2	8	549860	549867	0 %	75 %	0 %	25 %	507518816

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