MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021289	GC	3	6	440845	440850	0 %	0 %	50 %	50 %	507518712
11002	NC_021289	ATC	2	6	440852	440857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518712
11003	NC_021289	AGC	2	6	440915	440920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518712
11004	NC_021289	CGA	3	9	441141	441149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518712
11005	NC_021289	GCC	2	6	441178	441183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518712
11006	NC_021289	CCG	2	6	441252	441257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518712
11007	NC_021289	TTC	2	6	441260	441265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518712
11008	NC_021289	TCGAT	2	10	441300	441309	20 %	40 %	20 %	20 %	507518712
11009	NC_021289	CGA	2	6	441339	441344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518712
11010	NC_021289	GC	3	6	441381	441386	0 %	0 %	50 %	50 %	507518712
11011	NC_021289	AATGGC	2	12	441427	441438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507518712
11012	NC_021289	CG	3	6	441468	441473	0 %	0 %	50 %	50 %	507518712
11013	NC_021289	CG	3	6	441859	441864	0 %	0 %	50 %	50 %	507518713
11014	NC_021289	TCG	2	6	442104	442109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518713
11015	NC_021289	GCC	2	6	442112	442117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518713
11016	NC_021289	TGG	2	6	442158	442163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518713
11017	NC_021289	CGT	2	6	442208	442213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518713
11018	NC_021289	TGC	2	6	442215	442220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518713
11019	NC_021289	GATC	2	8	442276	442283	25 %	25 %	25 %	25 %	507518713
11020	NC_021289	TGT	2	6	442359	442364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518713
11021	NC_021289	GCC	2	6	442411	442416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518713
11022	NC_021289	CG	4	8	442480	442487	0 %	0 %	50 %	50 %	507518713
11023	NC_021289	CTTG	2	8	442560	442567	0 %	50 %	25 %	25 %	507518713
11024	NC_021289	CG	4	8	442593	442600	0 %	0 %	50 %	50 %	507518713
11025	NC_021289	GC	3	6	442671	442676	0 %	0 %	50 %	50 %	507518713
11026	NC_021289	CG	3	6	442715	442720	0 %	0 %	50 %	50 %	507518713
11027	NC_021289	TGC	3	9	442734	442742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518713
11028	NC_021289	ACC	2	6	442784	442789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518713
11029	NC_021289	GTC	2	6	442832	442837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518713
11030	NC_021289	GC	4	8	442890	442897	0 %	0 %	50 %	50 %	507518713
11031	NC_021289	TCGGCA	2	12	442905	442916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518713
11032	NC_021289	CGT	2	6	442969	442974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518713
11033	NC_021289	GC	4	8	442975	442982	0 %	0 %	50 %	50 %	507518713
11034	NC_021289	CAT	2	6	442999	443004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518713
11035	NC_021289	CG	3	6	443071	443076	0 %	0 %	50 %	50 %	507518713
11036	NC_021289	GT	3	6	443118	443123	0 %	50 %	50 %	0 %	507518713
11037	NC_021289	GC	4	8	443151	443158	0 %	0 %	50 %	50 %	507518713
11038	NC_021289	TCG	2	6	443220	443225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518713
11039	NC_021289	TGC	2	6	443374	443379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518714
11040	NC_021289	GCA	2	6	443403	443408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518714
11041	NC_021289	GC	3	6	443470	443475	0 %	0 %	50 %	50 %	507518714
11042	NC_021289	GGC	2	6	443502	443507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518714
11043	NC_021289	GTC	3	9	443537	443545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518714
11044	NC_021289	CGT	2	6	443591	443596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518714
11045	NC_021289	CTGC	2	8	443604	443611	0 %	25 %	25 %	50 %	507518714
11046	NC_021289	CGA	3	9	443671	443679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518714
11047	NC_021289	CTT	3	9	443771	443779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518714
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11050	NC_021289	GCC	2	6	443859	443864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518714
11051	NC_021289	GA	3	6	443898	443903	50 %	0 %	50 %	0 %	507518714
11052	NC_021289	CGA	2	6	443927	443932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518714
11053	NC_021289	TGGC	2	8	443933	443940	0 %	25 %	50 %	25 %	507518714
11054	NC_021289	TCG	2	6	443985	443990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518714
11055	NC_021289	CGG	2	6	444002	444007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518714
11056	NC_021289	GCA	2	6	444051	444056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518714
11057	NC_021289	CGC	2	6	444068	444073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518714
11058	NC_021289	TCG	2	6	444152	444157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518714
11059	NC_021289	CGC	2	6	444413	444418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518715
11060	NC_021289	GC	3	6	444421	444426	0 %	0 %	50 %	50 %	507518715
11061	NC_021289	CGC	3	9	444424	444432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518715
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11063	NC_021289	CGG	2	6	444491	444496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518715
11064	NC_021289	GT	3	6	444541	444546	0 %	50 %	50 %	0 %	507518715
11065	NC_021289	TCG	2	6	444588	444593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518715
11066	NC_021289	CGT	2	6	444610	444615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518715
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11068	NC_021289	GGC	2	6	444720	444725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518715
11069	NC_021289	TCT	2	6	444727	444732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518715
11070	NC_021289	CCAT	2	8	444738	444745	25 %	25 %	0 %	50 %	507518715
11071	NC_021289	ATCG	2	8	444787	444794	25 %	25 %	25 %	25 %	507518715
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11074	NC_021289	GC	3	6	445024	445029	0 %	0 %	50 %	50 %	507518715
11075	NC_021289	CGGCAC	2	12	445100	445111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507518715
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11077	NC_021289	GTCG	2	8	445157	445164	0 %	25 %	50 %	25 %	507518715
11078	NC_021289	TCG	2	6	445189	445194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518715
11079	NC_021289	TGCG	2	8	445246	445253	0 %	25 %	50 %	25 %	507518715
11080	NC_021289	CTGC	2	8	445264	445271	0 %	25 %	25 %	50 %	507518715
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11082	NC_021289	ACGC	2	8	445567	445574	25 %	0 %	25 %	50 %	507518715
11083	NC_021289	ACG	2	6	445575	445580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518715
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11085	NC_021289	TCA	2	6	445636	445641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518715
11086	NC_021289	CGC	2	6	445678	445683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518715
11087	NC_021289	CAGCG	2	10	445823	445832	20 %	0 %	40 %	40 %	507518715
11088	NC_021289	CGA	2	6	445835	445840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518715
11089	NC_021289	TTGA	2	8	445852	445859	25 %	50 %	25 %	0 %	507518715
11090	NC_021289	ATC	2	6	445980	445985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518716
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11093	NC_021289	GCT	2	6	446132	446137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518716
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11099	NC_021289	CAT	2	6	446607	446612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518716
11100	NC_021289	CG	3	6	446633	446638	0 %	0 %	50 %	50 %	507518716
11101	NC_021289	TCGA	2	8	446649	446656	25 %	25 %	25 %	25 %	507518716
11102	NC_021289	TGGA	2	8	446673	446680	25 %	25 %	50 %	0 %	507518716
11103	NC_021289	AC	3	6	446729	446734	50 %	0 %	0 %	50 %	507518716
11104	NC_021289	AGC	2	6	446785	446790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518716
11105	NC_021289	CG	3	6	446820	446825	0 %	0 %	50 %	50 %	507518716
11106	NC_021289	GCGG	2	8	446838	446845	0 %	0 %	75 %	25 %	507518716
11107	NC_021289	TCGCT	2	10	446875	446884	0 %	40 %	20 %	40 %	507518716
11108	NC_021289	GTCC	2	8	446911	446918	0 %	25 %	25 %	50 %	507518716
11109	NC_021289	GCG	2	6	446943	446948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518716
11110	NC_021289	AGG	2	6	447007	447012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518716
11111	NC_021289	CATG	2	8	447030	447037	25 %	25 %	25 %	25 %	507518716
11112	NC_021289	ATG	2	6	447054	447059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518716
11113	NC_021289	CGA	2	6	447095	447100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518716
11114	NC_021289	CG	3	6	447146	447151	0 %	0 %	50 %	50 %	507518716
11115	NC_021289	TGC	2	6	447256	447261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518717
11116	NC_021289	GCG	2	6	447294	447299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518717
11117	NC_021289	TAC	2	6	447303	447308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518717
11118	NC_021289	CTT	2	6	447311	447316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518717
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11120	NC_021289	CGC	2	6	447392	447397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518717
11121	NC_021289	TCG	2	6	447421	447426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518717
11122	NC_021289	CG	3	6	447425	447430	0 %	0 %	50 %	50 %	507518717
11123	NC_021289	CGG	2	6	447437	447442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518717
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11226	NC_021289	GC	4	8	451091	451098	0 %	0 %	50 %	50 %	507518719
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11240	NC_021289	AGA	2	6	451704	451709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518720
11241	NC_021289	CGA	2	6	451750	451755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518720
11242	NC_021289	ATG	2	6	451766	451771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518720
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11475	NC_021289	CCG	2	6	462646	462651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518732
11476	NC_021289	TCG	2	6	462667	462672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518732
11477	NC_021289	GTCG	2	8	462761	462768	0 %	25 %	50 %	25 %	507518732
11478	NC_021289	GCC	2	6	462853	462858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518733
11479	NC_021289	TCA	2	6	462897	462902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518733
11480	NC_021289	CGC	2	6	462936	462941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518733
11481	NC_021289	CG	3	6	462958	462963	0 %	0 %	50 %	50 %	507518733
11482	NC_021289	CGG	2	6	462990	462995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518733
11483	NC_021289	GCG	2	6	463032	463037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518733
11484	NC_021289	CGC	2	6	463083	463088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518733
11485	NC_021289	TCG	3	9	463121	463129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518733
11486	NC_021289	GC	3	6	463138	463143	0 %	0 %	50 %	50 %	507518733
11487	NC_021289	ACGCA	2	10	463225	463234	40 %	0 %	20 %	40 %	507518733
11488	NC_021289	CG	4	8	463259	463266	0 %	0 %	50 %	50 %	507518733
11489	NC_021289	CGA	2	6	463305	463310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518733
11490	NC_021289	CAT	2	6	463312	463317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518733
11491	NC_021289	GTC	2	6	463331	463336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518733
11492	NC_021289	GAGC	2	8	463378	463385	25 %	0 %	50 %	25 %	507518733
11493	NC_021289	CGA	2	6	463428	463433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518733
11494	NC_021289	CGC	2	6	463456	463461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518733
11495	NC_021289	GAC	2	6	463492	463497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518733
11496	NC_021289	GCG	3	9	463512	463520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518733
11497	NC_021289	TGA	2	6	463530	463535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518733
11498	NC_021289	CG	3	6	463551	463556	0 %	0 %	50 %	50 %	507518733
11499	NC_021289	AGC	2	6	463559	463564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518733
11500	NC_021289	TCCG	2	8	463573	463580	0 %	25 %	25 %	50 %	507518733

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