MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021289	ACG	2	6	312919	312924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518591
8002	NC_021289	GCC	2	6	312973	312978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518591
8003	NC_021289	CG	3	6	313008	313013	0 %	0 %	50 %	50 %	507518591
8004	NC_021289	GCT	2	6	313026	313031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518591
8005	NC_021289	CGA	2	6	313073	313078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518591
8006	NC_021289	ACG	2	6	313133	313138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518591
8007	NC_021289	CCG	2	6	313157	313162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518591
8008	NC_021289	ATC	2	6	313165	313170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518591
8009	NC_021289	ATCTCG	2	12	313175	313186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507518591
8010	NC_021289	GGCG	2	8	313218	313225	0 %	0 %	75 %	25 %	507518591
8011	NC_021289	TGT	2	6	313247	313252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518591
8012	NC_021289	CGA	2	6	313290	313295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518591
8013	NC_021289	GC	3	6	313363	313368	0 %	0 %	50 %	50 %	507518591
8014	NC_021289	TCG	2	6	313391	313396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518591
8015	NC_021289	CGCC	2	8	313397	313404	0 %	0 %	25 %	75 %	507518591
8016	NC_021289	GC	3	6	313441	313446	0 %	0 %	50 %	50 %	507518591
8017	NC_021289	AAG	2	6	313447	313452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518591
8018	NC_021289	GGC	2	6	313461	313466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518591
8019	NC_021289	GC	3	6	313564	313569	0 %	0 %	50 %	50 %	507518592
8020	NC_021289	CAACAG	2	12	313579	313590	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	507518592
8021	NC_021289	CAC	2	6	313594	313599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518592
8022	NC_021289	CGA	2	6	313611	313616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8023	NC_021289	ATC	2	6	313646	313651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518592
8024	NC_021289	TGC	2	6	313658	313663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8025	NC_021289	CCGC	2	8	313703	313710	0 %	0 %	25 %	75 %	507518592
8026	NC_021289	GCG	2	6	313751	313756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518592
8027	NC_021289	TCA	2	6	313788	313793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518592
8028	NC_021289	CTG	2	6	313820	313825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8029	NC_021289	GC	3	6	313865	313870	0 %	0 %	50 %	50 %	507518592
8030	NC_021289	CAT	2	6	313993	313998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518592
8031	NC_021289	AGC	2	6	314036	314041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8032	NC_021289	GGCG	2	8	314046	314053	0 %	0 %	75 %	25 %	507518592
8033	NC_021289	CAG	2	6	314065	314070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8034	NC_021289	CGC	2	6	314106	314111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518592
8035	NC_021289	CGGTG	2	10	314113	314122	0 %	20 %	60 %	20 %	507518592
8036	NC_021289	CGT	2	6	314131	314136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8037	NC_021289	TCA	2	6	314151	314156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518592
8038	NC_021289	CGG	2	6	314170	314175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518592
8039	NC_021289	GC	4	8	314181	314188	0 %	0 %	50 %	50 %	507518592
8040	NC_021289	GAA	2	6	314269	314274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518592
8041	NC_021289	AGC	2	6	314333	314338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8042	NC_021289	GTT	2	6	314376	314381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518592
8043	NC_021289	CGC	2	6	314382	314387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518592
8044	NC_021289	CG	3	6	314458	314463	0 %	0 %	50 %	50 %	507518592
8045	NC_021289	CG	3	6	314465	314470	0 %	0 %	50 %	50 %	507518592
8046	NC_021289	TGA	2	6	314529	314534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518592
8047	NC_021289	AGCC	2	8	314567	314574	25 %	0 %	25 %	50 %	507518592
8048	NC_021289	CG	3	6	314649	314654	0 %	0 %	50 %	50 %	507518592
8049	NC_021289	CGCGA	2	10	314723	314732	20 %	0 %	40 %	40 %	507518592
8050	NC_021289	CAG	2	6	314803	314808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8051	NC_021289	CAGC	2	8	314833	314840	25 %	0 %	25 %	50 %	507518592
8052	NC_021289	CGA	2	6	314868	314873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8053	NC_021289	ACG	2	6	314877	314882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518592
8054	NC_021289	CGA	2	6	315278	315283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518593
8055	NC_021289	GTC	2	6	315293	315298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518593
8056	NC_021289	CG	4	8	315310	315317	0 %	0 %	50 %	50 %	507518593
8057	NC_021289	TC	3	6	315338	315343	0 %	50 %	0 %	50 %	507518593
8058	NC_021289	GCT	2	6	315380	315385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518593
8059	NC_021289	CCG	2	6	315403	315408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518593
8060	NC_021289	GGA	2	6	315428	315433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	507518593
8061	NC_021289	GGC	2	6	315435	315440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518593
8062	NC_021289	GCC	2	6	315451	315456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518593
8063	NC_021289	CGA	2	6	315464	315469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518593
8064	NC_021289	CCG	2	6	315470	315475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518593
8065	NC_021289	CG	4	8	315522	315529	0 %	0 %	50 %	50 %	507518593
8066	NC_021289	CGA	2	6	315539	315544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518593
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8069	NC_021289	TGC	2	6	315604	315609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518593
8070	NC_021289	CGCAC	2	10	315802	315811	20 %	0 %	20 %	60 %	507518594
8071	NC_021289	CGCAGG	2	12	315863	315874	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507518594
8072	NC_021289	GCC	3	9	315880	315888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518594
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8075	NC_021289	AAG	2	6	315946	315951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507518594
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8081	NC_021289	CG	4	8	316350	316357	0 %	0 %	50 %	50 %	507518595
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8085	NC_021289	ACG	2	6	316733	316738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518595
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8088	NC_021289	TCG	2	6	316844	316849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518595
8089	NC_021289	GC	3	6	316885	316890	0 %	0 %	50 %	50 %	507518595
8090	NC_021289	CAG	2	6	316897	316902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518595
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8092	NC_021289	ACG	2	6	316959	316964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518595
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8094	NC_021289	TCG	2	6	317075	317080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518595
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8102	NC_021289	CGCC	2	8	317394	317401	0 %	0 %	25 %	75 %	507518595
8103	NC_021289	ACG	2	6	317411	317416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518595
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8105	NC_021289	ACG	2	6	317453	317458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518595
8106	NC_021289	CGAACG	2	12	317484	317495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518595
8107	NC_021289	GCC	2	6	317540	317545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518595
8108	NC_021289	CGA	2	6	317577	317582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518595
8109	NC_021289	GCGG	2	8	317593	317600	0 %	0 %	75 %	25 %	507518595
8110	NC_021289	TCGATC	2	12	317633	317644	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	507518595
8111	NC_021289	CGTGA	2	10	317653	317662	20 %	20 %	40 %	20 %	507518595
8112	NC_021289	AGC	2	6	317669	317674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518595
8113	NC_021289	GCGG	2	8	317690	317697	0 %	0 %	75 %	25 %	507518595
8114	NC_021289	GCG	2	6	317727	317732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518595
8115	NC_021289	GCC	2	6	317764	317769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518595
8116	NC_021289	CG	3	6	317776	317781	0 %	0 %	50 %	50 %	507518595
8117	NC_021289	GCG	2	6	317831	317836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518595
8118	NC_021289	CGC	2	6	318049	318054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518596
8119	NC_021289	GC	3	6	318053	318058	0 %	0 %	50 %	50 %	507518596
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8121	NC_021289	CGA	2	6	318074	318079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518596
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8233	NC_021289	CGACGC	2	12	322249	322260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	507518602
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8485	NC_021289	GCGCG	2	10	330077	330086	0 %	0 %	60 %	40 %	507518610
8486	NC_021289	TCG	2	6	330112	330117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518610
8487	NC_021289	GCG	2	6	330126	330131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518610
8488	NC_021289	CG	3	6	330164	330169	0 %	0 %	50 %	50 %	507518610
8489	NC_021289	GCG	2	6	330198	330203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518610
8490	NC_021289	GC	3	6	330211	330216	0 %	0 %	50 %	50 %	507518610
8491	NC_021289	GC	4	8	330235	330242	0 %	0 %	50 %	50 %	507518610
8492	NC_021289	TCGC	2	8	330243	330250	0 %	25 %	25 %	50 %	507518610
8493	NC_021289	CGC	3	9	330248	330256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518610
8494	NC_021289	TCCG	2	8	330287	330294	0 %	25 %	25 %	50 %	507518610
8495	NC_021289	TCGC	2	8	330306	330313	0 %	25 %	25 %	50 %	507518610
8496	NC_021289	CGC	2	6	330347	330352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518610
8497	NC_021289	CGA	2	6	330367	330372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518610
8498	NC_021289	GCC	2	6	330405	330410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518610
8499	NC_021289	GACG	2	8	330476	330483	25 %	0 %	50 %	25 %	507518610
8500	NC_021289	ACG	2	6	330504	330509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518610

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