MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. RPE64 plasmid p1 DNA

Total Repeats: 31438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021289	CGC	2	6	194815	194820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518491
5002	NC_021289	CG	4	8	194889	194896	0 %	0 %	50 %	50 %	507518491
5003	NC_021289	TGCCGC	2	12	194934	194945	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	507518491
5004	NC_021289	CTTC	2	8	194995	195002	0 %	50 %	0 %	50 %	507518492
5005	NC_021289	GC	3	6	195011	195016	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5006	NC_021289	GC	3	6	195033	195038	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5007	NC_021289	GC	3	6	195055	195060	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5008	NC_021289	GC	3	6	195183	195188	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5009	NC_021289	CGC	2	6	195213	195218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518492
5010	NC_021289	GAT	2	6	195219	195224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518492
5011	NC_021289	TCG	2	6	195266	195271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5012	NC_021289	GCC	2	6	195388	195393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518492
5013	NC_021289	TCG	2	6	195421	195426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5014	NC_021289	GTG	2	6	195430	195435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518492
5015	NC_021289	CG	3	6	195498	195503	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5016	NC_021289	CGAG	2	8	195545	195552	25 %	0 %	50 %	25 %	507518492
5017	NC_021289	CCG	2	6	195553	195558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518492
5018	NC_021289	CGA	2	6	195571	195576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5019	NC_021289	GCG	2	6	195584	195589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518492
5020	NC_021289	AAAG	2	8	195590	195597	75 %	0 %	25 %	0 %	507518492
5021	NC_021289	GC	3	6	195670	195675	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5022	NC_021289	CG	3	6	195719	195724	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5023	NC_021289	CTG	2	6	195750	195755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5024	NC_021289	CG	3	6	195821	195826	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5025	NC_021289	CGA	2	6	195896	195901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5026	NC_021289	GC	3	6	195960	195965	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5027	NC_021289	GCG	2	6	195968	195973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518492
5028	NC_021289	GCG	2	6	196003	196008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518492
5029	NC_021289	GC	5	10	196018	196027	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5030	NC_021289	CGG	2	6	196067	196072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518492
5031	NC_021289	GAC	2	6	196092	196097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5032	NC_021289	TTC	2	6	196105	196110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518492
5033	NC_021289	CGG	2	6	196146	196151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518492
5034	NC_021289	CG	3	6	196185	196190	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5035	NC_021289	GC	3	6	196350	196355	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5036	NC_021289	GCA	2	6	196370	196375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5037	NC_021289	CG	3	6	196391	196396	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5038	NC_021289	GC	3	6	196409	196414	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5039	NC_021289	GAC	2	6	196545	196550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5040	NC_021289	TCG	2	6	196570	196575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5041	NC_021289	ACG	2	6	196603	196608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5042	NC_021289	CG	3	6	196607	196612	0 %	0 %	50 %	50 %	507518492
5043	NC_021289	TTC	2	6	196716	196721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518492
5044	NC_021289	CGA	2	6	196772	196777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5045	NC_021289	TGT	2	6	196790	196795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	507518492
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5047	NC_021289	GAT	2	6	196977	196982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518492
5048	NC_021289	TCG	2	6	197002	197007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518492
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5051	NC_021289	CGA	2	6	197112	197117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5052	NC_021289	CGG	2	6	197201	197206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518492
5053	NC_021289	GAC	2	6	197238	197243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5054	NC_021289	CGA	2	6	197279	197284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518492
5055	NC_021289	GGC	2	6	197306	197311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518492
5056	NC_021289	TCA	2	6	197315	197320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518492
5057	NC_021289	GCC	3	9	197346	197354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518492
5058	NC_021289	GTC	2	6	197683	197688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518493
5059	NC_021289	CG	3	6	197710	197715	0 %	0 %	50 %	50 %	507518493
5060	NC_021289	GGC	2	6	197741	197746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518493
5061	NC_021289	CGT	2	6	197781	197786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518493
5062	NC_021289	CGC	2	6	197795	197800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518493
5063	NC_021289	GCG	2	6	197896	197901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518493
5064	NC_021289	TCG	2	6	197912	197917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518493
5065	NC_021289	GCGTG	2	10	197919	197928	0 %	20 %	60 %	20 %	507518493
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5069	NC_021289	GC	3	6	198010	198015	0 %	0 %	50 %	50 %	507518493
5070	NC_021289	GTTC	2	8	198026	198033	0 %	50 %	25 %	25 %	507518493
5071	NC_021289	CG	3	6	198084	198089	0 %	0 %	50 %	50 %	507518493
5072	NC_021289	CGT	2	6	198116	198121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518493
5073	NC_021289	CAT	2	6	198125	198130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507518493
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5075	NC_021289	TGG	2	6	198255	198260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	507518493
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5077	NC_021289	CCGA	2	8	198368	198375	25 %	0 %	25 %	50 %	507518494
5078	NC_021289	CG	4	8	198435	198442	0 %	0 %	50 %	50 %	507518494
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5082	NC_021289	GC	3	6	198521	198526	0 %	0 %	50 %	50 %	507518494
5083	NC_021289	GAT	2	6	198542	198547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518494
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5086	NC_021289	GCCGC	2	10	198602	198611	0 %	0 %	40 %	60 %	507518494
5087	NC_021289	CGC	2	6	198713	198718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518494
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5090	NC_021289	GCC	3	9	198783	198791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518494
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5092	NC_021289	GC	3	6	198822	198827	0 %	0 %	50 %	50 %	507518494
5093	NC_021289	GC	3	6	198870	198875	0 %	0 %	50 %	50 %	507518494
5094	NC_021289	CAC	2	6	198921	198926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	507518494
5095	NC_021289	GC	3	6	198930	198935	0 %	0 %	50 %	50 %	507518494
5096	NC_021289	GC	3	6	199022	199027	0 %	0 %	50 %	50 %	507518494
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5102	NC_021289	CGA	2	6	199220	199225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518494
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5106	NC_021289	GCG	2	6	199355	199360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518494
5107	NC_021289	CG	3	6	199462	199467	0 %	0 %	50 %	50 %	507518494
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5120	NC_021289	CG	3	6	199797	199802	0 %	0 %	50 %	50 %	507518494
5121	NC_021289	CAG	2	6	199806	199811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518494
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5123	NC_021289	CTG	2	6	199890	199895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518494
5124	NC_021289	TTC	2	6	199923	199928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	507518494
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5127	NC_021289	CGT	2	6	199989	199994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518494
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5233	NC_021289	CG	3	6	204304	204309	0 %	0 %	50 %	50 %	507518500
5234	NC_021289	GCCGAT	2	12	204324	204335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518500
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5237	NC_021289	AGGA	2	8	204472	204479	50 %	0 %	50 %	0 %	507518500
5238	NC_021289	CGAA	2	8	204487	204494	50 %	0 %	25 %	25 %	507518500
5239	NC_021289	GC	3	6	204522	204527	0 %	0 %	50 %	50 %	507518500
5240	NC_021289	ACGC	2	8	204649	204656	25 %	0 %	25 %	50 %	507518500
5241	NC_021289	CCGGC	2	10	204770	204779	0 %	0 %	40 %	60 %	507518500
5242	NC_021289	GTC	2	6	204843	204848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518501
5243	NC_021289	GC	4	8	204876	204883	0 %	0 %	50 %	50 %	507518501
5244	NC_021289	CAG	2	6	204900	204905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518501
5245	NC_021289	AC	3	6	204918	204923	50 %	0 %	0 %	50 %	507518501
5246	NC_021289	GTC	2	6	204946	204951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518501
5247	NC_021289	GAT	2	6	204957	204962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518501
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5349	NC_021289	GCGCG	2	10	208690	208699	0 %	0 %	60 %	40 %	507518504
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5360	NC_021289	GC	4	8	209288	209295	0 %	0 %	50 %	50 %	507518505
5361	NC_021289	CGA	2	6	209310	209315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518505
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5478	NC_021289	CGGC	2	8	213024	213031	0 %	0 %	50 %	50 %	507518507
5479	NC_021289	CGA	2	6	213055	213060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518507
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5482	NC_021289	GGC	2	6	213264	213269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518507
5483	NC_021289	CGA	2	6	213283	213288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518507
5484	NC_021289	CG	3	6	213303	213308	0 %	0 %	50 %	50 %	507518507
5485	NC_021289	GC	3	6	213318	213323	0 %	0 %	50 %	50 %	507518507
5486	NC_021289	CGG	2	6	213358	213363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	507518507
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5488	NC_021289	CGC	2	6	213467	213472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	507518508
5489	NC_021289	CG	3	6	213491	213496	0 %	0 %	50 %	50 %	507518508
5490	NC_021289	TCG	2	6	213546	213551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518508
5491	NC_021289	TGA	3	9	213552	213560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507518508
5492	NC_021289	CGATGC	2	12	213571	213582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	507518508
5493	NC_021289	CGCGAG	2	12	213653	213664	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	507518508
5494	NC_021289	TCG	2	6	213699	213704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	507518508
5495	NC_021289	CG	3	6	213714	213719	0 %	0 %	50 %	50 %	507518508
5496	NC_021289	AGC	2	6	213771	213776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518508
5497	NC_021289	TCGAGA	2	12	213825	213836	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	507518508
5498	NC_021289	AGC	2	6	213840	213845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	507518508
5499	NC_021289	GC	3	6	213851	213856	0 %	0 %	50 %	50 %	507518508
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