MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_021008	TCA	2	6	2282826	2282831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136539
37002	NC_021008	GAT	2	6	2282908	2282913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136539
37003	NC_021008	CGA	2	6	2282929	2282934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136539
37004	NC_021008	CAC	2	6	2282961	2282966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136539
37005	NC_021008	CAT	2	6	2283006	2283011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136539
37006	NC_021008	CG	3	6	2283022	2283027	0 %	0 %	50 %	50 %	479136539
37007	NC_021008	TGG	2	6	2283030	2283035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136539
37008	NC_021008	CCA	2	6	2283117	2283122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136539
37009	NC_021008	GTT	2	6	2283268	2283273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136540
37010	NC_021008	TCG	2	6	2283314	2283319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136540
37011	NC_021008	CTG	2	6	2283331	2283336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136540
37012	NC_021008	GTC	2	6	2283365	2283370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136540
37013	NC_021008	CGG	2	6	2283399	2283404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136540
37014	NC_021008	CCT	2	6	2283411	2283416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136540
37015	NC_021008	GTC	2	6	2283448	2283453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136540
37016	NC_021008	CCAT	2	8	2283455	2283462	25 %	25 %	0 %	50 %	479136540
37017	NC_021008	TCG	2	6	2283494	2283499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136540
37018	NC_021008	CGG	2	6	2283507	2283512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136540
37019	NC_021008	TTG	2	6	2283608	2283613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136540
37020	NC_021008	TCG	2	6	2283635	2283640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136540
37021	NC_021008	CCG	2	6	2283657	2283662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136540
37022	NC_021008	CGGC	2	8	2283698	2283705	0 %	0 %	50 %	50 %	479136540
37023	NC_021008	AGC	2	6	2283719	2283724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136540
37024	NC_021008	GTG	3	9	2283815	2283823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136540
37025	NC_021008	GAC	2	6	2283895	2283900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136540
37026	NC_021008	TTC	2	6	2283949	2283954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136540
37027	NC_021008	ACGC	2	8	2283968	2283975	25 %	0 %	25 %	50 %	479136540
37028	NC_021008	CAG	2	6	2284168	2284173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136540
37029	NC_021008	TGG	2	6	2284223	2284228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136540
37030	NC_021008	TG	3	6	2284389	2284394	0 %	50 %	50 %	0 %	479136540
37031	NC_021008	TTGCT	2	10	2285135	2285144	0 %	60 %	20 %	20 %	479136541
37032	NC_021008	TGC	2	6	2285192	2285197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136541
37033	NC_021008	GCAT	2	8	2285222	2285229	25 %	25 %	25 %	25 %	479136541
37034	NC_021008	CGCC	2	8	2285246	2285253	0 %	0 %	25 %	75 %	479136541
37035	NC_021008	CTGA	2	8	2285395	2285402	25 %	25 %	25 %	25 %	479136541
37036	NC_021008	GGT	2	6	2285431	2285436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136541
37037	NC_021008	GAA	2	6	2285437	2285442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136541
37038	NC_021008	GC	3	6	2285520	2285525	0 %	0 %	50 %	50 %	479136541
37039	NC_021008	GAA	2	6	2285619	2285624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136541
37040	NC_021008	CGG	2	6	2285647	2285652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136541
37041	NC_021008	GAA	2	6	2285785	2285790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136541
37042	NC_021008	GCC	2	6	2285812	2285817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136541
37043	NC_021008	TTCG	2	8	2285926	2285933	0 %	50 %	25 %	25 %	479136541
37044	NC_021008	GACGT	2	10	2285945	2285954	20 %	20 %	40 %	20 %	479136541
37045	NC_021008	CGGCCA	2	12	2286078	2286089	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479136541
37046	NC_021008	TCT	2	6	2286183	2286188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136541
37047	NC_021008	GACC	2	8	2286192	2286199	25 %	0 %	25 %	50 %	479136541
37048	NC_021008	GCC	2	6	2286326	2286331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136541
37049	NC_021008	GTT	2	6	2286457	2286462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136541
37050	NC_021008	CA	4	8	2286466	2286473	50 %	0 %	0 %	50 %	479136541
37051	NC_021008	AAC	2	6	2286505	2286510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136541
37052	NC_021008	GGC	2	6	2286589	2286594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136541
37053	NC_021008	TGG	2	6	2286627	2286632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136541
37054	NC_021008	AAC	2	6	2286967	2286972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136542
37055	NC_021008	CGT	2	6	2286973	2286978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136542
37056	NC_021008	TGCGCA	2	12	2287004	2287015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479136542
37057	NC_021008	CTT	2	6	2287890	2287895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136543
37058	NC_021008	ATC	2	6	2287945	2287950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136543
37059	NC_021008	CTGGTG	2	12	2287951	2287962	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479136543
37060	NC_021008	GGCT	2	8	2288142	2288149	0 %	25 %	50 %	25 %	479136543
37061	NC_021008	GGT	2	6	2288349	2288354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136543
37062	NC_021008	CGC	2	6	2288430	2288435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136543
37063	NC_021008	AACA	2	8	2288443	2288450	75 %	0 %	0 %	25 %	479136543
37064	NC_021008	TCT	2	6	2288501	2288506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136543
37065	NC_021008	CCA	2	6	2288513	2288518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136543
37066	NC_021008	CAA	2	6	2288550	2288555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136543
37067	NC_021008	GCG	2	6	2288620	2288625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136543
37068	NC_021008	ATC	2	6	2288642	2288647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136543
37069	NC_021008	CGC	2	6	2288662	2288667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136543
37070	NC_021008	GGCC	2	8	2288673	2288680	0 %	0 %	50 %	50 %	479136543
37071	NC_021008	CT	3	6	2288685	2288690	0 %	50 %	0 %	50 %	479136543
37072	NC_021008	GAA	3	9	2288692	2288700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136543
37073	NC_021008	GGCCAA	2	12	2288706	2288717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136543
37074	NC_021008	GAC	2	6	2288789	2288794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136543
37075	NC_021008	TCGA	2	8	2288935	2288942	25 %	25 %	25 %	25 %	479136544
37076	NC_021008	CGC	2	6	2288967	2288972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136544
37077	NC_021008	GCGT	2	8	2289029	2289036	0 %	25 %	50 %	25 %	479136544
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37080	NC_021008	CAG	2	6	2289151	2289156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136544
37081	NC_021008	TCGC	2	8	2289351	2289358	0 %	25 %	25 %	50 %	479136544
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37083	NC_021008	GAC	2	6	2289424	2289429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136544
37084	NC_021008	GTG	3	9	2289831	2289839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136545
37085	NC_021008	TGG	2	6	2289852	2289857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136545
37086	NC_021008	GCG	2	6	2289907	2289912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136545
37087	NC_021008	CAG	2	6	2289995	2290000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136545
37088	NC_021008	TGT	2	6	2290030	2290035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136545
37089	NC_021008	CT	3	6	2290067	2290072	0 %	50 %	0 %	50 %	479136545
37090	NC_021008	CGTTGC	2	12	2290080	2290091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136545
37091	NC_021008	GGT	2	6	2290178	2290183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136545
37092	NC_021008	CGT	2	6	2290184	2290189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136545
37093	NC_021008	CGT	2	6	2290195	2290200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136545
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37095	NC_021008	GTG	2	6	2290238	2290243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136545
37096	NC_021008	CCA	2	6	2290516	2290521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136546
37097	NC_021008	ATC	2	6	2290525	2290530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136546
37098	NC_021008	TGA	2	6	2290613	2290618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136546
37099	NC_021008	CGT	2	6	2290674	2290679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136546
37100	NC_021008	G	6	6	2290700	2290705	0 %	0 %	100 %	0 %	479136546
37101	NC_021008	GCG	2	6	2290740	2290745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136546
37102	NC_021008	GC	3	6	2290759	2290764	0 %	0 %	50 %	50 %	479136546
37103	NC_021008	TGT	2	6	2290919	2290924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136546
37104	NC_021008	TTG	2	6	2290989	2290994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136546
37105	NC_021008	AGG	2	6	2290996	2291001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136546
37106	NC_021008	ATTG	2	8	2291052	2291059	25 %	50 %	25 %	0 %	479136546
37107	NC_021008	TCA	2	6	2291083	2291088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136546
37108	NC_021008	TG	3	6	2291095	2291100	0 %	50 %	50 %	0 %	479136546
37109	NC_021008	TTGGT	2	10	2291176	2291185	0 %	60 %	40 %	0 %	479136546
37110	NC_021008	CTG	2	6	2291208	2291213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136546
37111	NC_021008	CCA	2	6	2291218	2291223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136546
37112	NC_021008	TA	3	6	2291269	2291274	50 %	50 %	0 %	0 %	479136546
37113	NC_021008	ACC	2	6	2291313	2291318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136546
37114	NC_021008	AGC	2	6	2291414	2291419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136546
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37116	NC_021008	GAG	2	6	2291468	2291473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136546
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37346	NC_021008	ATG	2	6	2304749	2304754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136553
37347	NC_021008	AC	3	6	2304777	2304782	50 %	0 %	0 %	50 %	479136553
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37350	NC_021008	GATT	2	8	2304966	2304973	25 %	50 %	25 %	0 %	479136553
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37352	NC_021008	GGCTG	2	10	2304995	2305004	0 %	20 %	60 %	20 %	479136553
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