MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_021008	CAT	2	6	2215193	2215198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136497
36002	NC_021008	CAGC	2	8	2215217	2215224	25 %	0 %	25 %	50 %	479136497
36003	NC_021008	TCGCA	2	10	2215272	2215281	20 %	20 %	20 %	40 %	479136497
36004	NC_021008	CAT	2	6	2215316	2215321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136497
36005	NC_021008	CCA	2	6	2215390	2215395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136497
36006	NC_021008	GTG	2	6	2215413	2215418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136497
36007	NC_021008	GC	3	6	2215449	2215454	0 %	0 %	50 %	50 %	479136497
36008	NC_021008	CCG	2	6	2215489	2215494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136497
36009	NC_021008	GCC	2	6	2215522	2215527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136497
36010	NC_021008	CCG	2	6	2215546	2215551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136497
36011	NC_021008	CGC	2	6	2215588	2215593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136497
36012	NC_021008	CCG	2	6	2215597	2215602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136497
36013	NC_021008	CGG	2	6	2215721	2215726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136497
36014	NC_021008	GGC	2	6	2215736	2215741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136497
36015	NC_021008	CAC	2	6	2215808	2215813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136497
36016	NC_021008	ACCC	2	8	2215835	2215842	25 %	0 %	0 %	75 %	479136497
36017	NC_021008	GCG	2	6	2215905	2215910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136497
36018	NC_021008	GCA	2	6	2215925	2215930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136497
36019	NC_021008	GCG	3	9	2215935	2215943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136497
36020	NC_021008	GCCAAG	2	12	2215944	2215955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136497
36021	NC_021008	AAG	2	6	2215962	2215967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136497
36022	NC_021008	ATC	3	9	2215968	2215976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136497
36023	NC_021008	TTG	2	6	2215996	2216001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136497
36024	NC_021008	CAA	2	6	2216048	2216053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136497
36025	NC_021008	GC	3	6	2216316	2216321	0 %	0 %	50 %	50 %	479136497
36026	NC_021008	CGC	2	6	2216354	2216359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136497
36027	NC_021008	GCC	2	6	2216418	2216423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136497
36028	NC_021008	CAC	2	6	2216444	2216449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136497
36029	NC_021008	AT	3	6	2216457	2216462	50 %	50 %	0 %	0 %	479136497
36030	NC_021008	TTC	2	6	2216465	2216470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136497
36031	NC_021008	ACC	2	6	2216478	2216483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136497
36032	NC_021008	GGTC	2	8	2216498	2216505	0 %	25 %	50 %	25 %	479136497
36033	NC_021008	CAG	2	6	2216526	2216531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136497
36034	NC_021008	TCA	2	6	2216644	2216649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136497
36035	NC_021008	CCG	2	6	2216719	2216724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136497
36036	NC_021008	GCA	2	6	2216776	2216781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136497
36037	NC_021008	GCA	2	6	2216863	2216868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136497
36038	NC_021008	GGC	2	6	2216871	2216876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136497
36039	NC_021008	GGTACC	2	12	2216877	2216888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479136497
36040	NC_021008	GTGA	2	8	2216929	2216936	25 %	25 %	50 %	0 %	479136497
36041	NC_021008	CGG	2	6	2217186	2217191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136498
36042	NC_021008	CAG	2	6	2217238	2217243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136498
36043	NC_021008	TCA	2	6	2217261	2217266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136498
36044	NC_021008	ACGC	2	8	2217313	2217320	25 %	0 %	25 %	50 %	479136498
36045	NC_021008	AAT	2	6	2217325	2217330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136498
36046	NC_021008	ACC	2	6	2217356	2217361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136498
36047	NC_021008	CCA	2	6	2217462	2217467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136498
36048	NC_021008	CATG	2	8	2217480	2217487	25 %	25 %	25 %	25 %	479136498
36049	NC_021008	TGG	2	6	2217489	2217494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136498
36050	NC_021008	AGCG	2	8	2217526	2217533	25 %	0 %	50 %	25 %	479136498
36051	NC_021008	CA	3	6	2217548	2217553	50 %	0 %	0 %	50 %	479136498
36052	NC_021008	CGC	2	6	2217567	2217572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136498
36053	NC_021008	CGT	2	6	2217693	2217698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136498
36054	NC_021008	CAC	2	6	2217703	2217708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136498
36055	NC_021008	CCA	3	9	2217774	2217782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136498
36056	NC_021008	CTG	2	6	2217882	2217887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136499
36057	NC_021008	GGC	3	9	2217903	2217911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136499
36058	NC_021008	CGG	2	6	2217941	2217946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136499
36059	NC_021008	CAG	3	9	2217954	2217962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136499
36060	NC_021008	CAG	2	6	2217966	2217971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136499
36061	NC_021008	CG	3	6	2218053	2218058	0 %	0 %	50 %	50 %	479136499
36062	NC_021008	GCA	2	6	2218067	2218072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136499
36063	NC_021008	GC	3	6	2218127	2218132	0 %	0 %	50 %	50 %	479136499
36064	NC_021008	ACC	2	6	2218138	2218143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136499
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36066	NC_021008	AGT	2	6	2218218	2218223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136499
36067	NC_021008	TGGG	2	8	2218294	2218301	0 %	25 %	75 %	0 %	479136499
36068	NC_021008	GGT	2	6	2218323	2218328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136499
36069	NC_021008	TGG	2	6	2218346	2218351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136499
36070	NC_021008	GCA	2	6	2218403	2218408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136499
36071	NC_021008	ACGA	2	8	2218455	2218462	50 %	0 %	25 %	25 %	479136499
36072	NC_021008	CGGCGA	2	12	2218529	2218540	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479136499
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36074	NC_021008	GCT	2	6	2218601	2218606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136499
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36082	NC_021008	TGCC	2	8	2218902	2218909	0 %	25 %	25 %	50 %	479136499
36083	NC_021008	CGC	2	6	2218937	2218942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136499
36084	NC_021008	ACG	2	6	2218953	2218958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136499
36085	NC_021008	GCC	2	6	2218990	2218995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136499
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36087	NC_021008	TGT	2	6	2219072	2219077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136499
36088	NC_021008	AAC	2	6	2220013	2220018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136500
36089	NC_021008	ATG	2	6	2220208	2220213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136500
36090	NC_021008	GAA	2	6	2220244	2220249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136500
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36092	NC_021008	GTG	2	6	2220331	2220336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136500
36093	NC_021008	TAC	2	6	2220337	2220342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136500
36094	NC_021008	TGA	2	6	2220428	2220433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136500
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36097	NC_021008	CAC	2	6	2221248	2221253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136501
36098	NC_021008	CCA	2	6	2221254	2221259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136501
36099	NC_021008	CCAC	2	8	2221277	2221284	25 %	0 %	0 %	75 %	479136501
36100	NC_021008	GCC	2	6	2221291	2221296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136501
36101	NC_021008	GCCAC	3	15	2221308	2221322	20 %	0 %	20 %	60 %	479136501
36102	NC_021008	ACC	2	6	2221400	2221405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136501
36103	NC_021008	ATG	2	6	2221410	2221415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136501
36104	NC_021008	GCC	2	6	2221513	2221518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136501
36105	NC_021008	TGA	2	6	2221656	2221661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136501
36106	NC_021008	CCA	2	6	2221677	2221682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136501
36107	NC_021008	GCC	2	6	2221694	2221699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136501
36108	NC_021008	TCT	2	6	2222070	2222075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136502
36109	NC_021008	TTC	2	6	2222088	2222093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136502
36110	NC_021008	GCT	2	6	2222096	2222101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136502
36111	NC_021008	CGG	2	6	2222105	2222110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136502
36112	NC_021008	CGC	2	6	2222117	2222122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136502
36113	NC_021008	TTG	2	6	2222125	2222130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136502
36114	NC_021008	AGC	2	6	2222146	2222151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136502
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36116	NC_021008	CTC	2	6	2222195	2222200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136502
36117	NC_021008	GCC	2	6	2222256	2222261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136502
36118	NC_021008	TCA	2	6	2222605	2222610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136503
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36216	NC_021008	GCCC	2	8	2227000	2227007	0 %	0 %	25 %	75 %	479136506
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36224	NC_021008	GC	3	6	2227217	2227222	0 %	0 %	50 %	50 %	479136506
36225	NC_021008	GAG	2	6	2227236	2227241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136506
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36228	NC_021008	GC	3	6	2227513	2227518	0 %	0 %	50 %	50 %	479136507
36229	NC_021008	CGG	2	6	2227535	2227540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136507
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