MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_021008	GCT	2	6	2186592	2186597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136479
35502	NC_021008	GC	3	6	2186624	2186629	0 %	0 %	50 %	50 %	479136479
35503	NC_021008	CTC	3	9	2186635	2186643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136479
35504	NC_021008	GCC	2	6	2186659	2186664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136479
35505	NC_021008	GACG	2	8	2186767	2186774	25 %	0 %	50 %	25 %	479136479
35506	NC_021008	GTG	3	9	2186777	2186785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136479
35507	NC_021008	A	6	6	2186969	2186974	100 %	0 %	0 %	0 %	479136479
35508	NC_021008	ACC	2	6	2187077	2187082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136479
35509	NC_021008	GCT	2	6	2187123	2187128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136479
35510	NC_021008	CAT	2	6	2187142	2187147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136479
35511	NC_021008	CAT	2	6	2187207	2187212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136479
35512	NC_021008	AATC	2	8	2187291	2187298	50 %	25 %	0 %	25 %	479136479
35513	NC_021008	CCG	2	6	2187326	2187331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136479
35514	NC_021008	TGC	2	6	2187345	2187350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136479
35515	NC_021008	AAT	2	6	2187387	2187392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136479
35516	NC_021008	TCG	2	6	2187446	2187451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136479
35517	NC_021008	CTG	2	6	2187589	2187594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136479
35518	NC_021008	CT	3	6	2187654	2187659	0 %	50 %	0 %	50 %	479136479
35519	NC_021008	TTCA	2	8	2187706	2187713	25 %	50 %	0 %	25 %	479136479
35520	NC_021008	CGT	2	6	2187885	2187890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136480
35521	NC_021008	CGG	2	6	2187975	2187980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136480
35522	NC_021008	GAA	2	6	2188030	2188035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136480
35523	NC_021008	GAA	2	6	2188063	2188068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136480
35524	NC_021008	CAA	2	6	2188248	2188253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136480
35525	NC_021008	ACA	2	6	2188340	2188345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136481
35526	NC_021008	CTA	2	6	2188547	2188552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136481
35527	NC_021008	GCT	2	6	2188707	2188712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136481
35528	NC_021008	TCCA	2	8	2188802	2188809	25 %	25 %	0 %	50 %	479136481
35529	NC_021008	AT	3	6	2188815	2188820	50 %	50 %	0 %	0 %	479136481
35530	NC_021008	CGC	2	6	2188828	2188833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136481
35531	NC_021008	TTCCG	2	10	2188995	2189004	0 %	40 %	20 %	40 %	479136481
35532	NC_021008	AGG	2	6	2189120	2189125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136481
35533	NC_021008	CACCGG	2	12	2189187	2189198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479136481
35534	NC_021008	CAG	2	6	2189266	2189271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136481
35535	NC_021008	TTC	2	6	2189276	2189281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136481
35536	NC_021008	TGA	2	6	2189319	2189324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136481
35537	NC_021008	AGCA	2	8	2189353	2189360	50 %	0 %	25 %	25 %	479136481
35538	NC_021008	CCG	2	6	2189367	2189372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136481
35539	NC_021008	TCA	2	6	2189466	2189471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136481
35540	NC_021008	TCA	2	6	2189498	2189503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136481
35541	NC_021008	CGCCA	2	10	2189541	2189550	20 %	0 %	20 %	60 %	479136481
35542	NC_021008	ACT	2	6	2189654	2189659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136481
35543	NC_021008	CGA	3	9	2189685	2189693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136481
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35545	NC_021008	CAT	2	6	2189805	2189810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136481
35546	NC_021008	AGG	2	6	2189876	2189881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136481
35547	NC_021008	CAG	2	6	2189911	2189916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136481
35548	NC_021008	CAA	2	6	2189923	2189928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136481
35549	NC_021008	CCG	2	6	2190086	2190091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136481
35550	NC_021008	GCA	2	6	2190113	2190118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136481
35551	NC_021008	GCA	2	6	2190141	2190146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136481
35552	NC_021008	AAAG	2	8	2190178	2190185	75 %	0 %	25 %	0 %	479136481
35553	NC_021008	ACA	3	9	2190215	2190223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136481
35554	NC_021008	GTC	2	6	2190309	2190314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136481
35555	NC_021008	CCG	2	6	2190365	2190370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136481
35556	NC_021008	CATCG	2	10	2190483	2190492	20 %	20 %	20 %	40 %	479136481
35557	NC_021008	GCA	2	6	2190497	2190502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136481
35558	NC_021008	A	6	6	2190530	2190535	100 %	0 %	0 %	0 %	479136481
35559	NC_021008	CAT	2	6	2190553	2190558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136481
35560	NC_021008	GCT	3	9	2190630	2190638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136481
35561	NC_021008	CGA	3	9	2190705	2190713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136481
35562	NC_021008	ATT	2	6	2190839	2190844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136481
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35564	NC_021008	CGAAC	2	10	2190971	2190980	40 %	0 %	20 %	40 %	479136481
35565	NC_021008	TCT	2	6	2190989	2190994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136481
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35568	NC_021008	GTGG	2	8	2191159	2191166	0 %	25 %	75 %	0 %	479136481
35569	NC_021008	GCCA	2	8	2191219	2191226	25 %	0 %	25 %	50 %	479136481
35570	NC_021008	CA	3	6	2191248	2191253	50 %	0 %	0 %	50 %	479136481
35571	NC_021008	GAAAT	2	10	2191255	2191264	60 %	20 %	20 %	0 %	479136481
35572	NC_021008	CA	4	8	2191342	2191349	50 %	0 %	0 %	50 %	479136481
35573	NC_021008	TAC	3	9	2191399	2191407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136481
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35576	NC_021008	CAT	2	6	2191759	2191764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136482
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35581	NC_021008	TG	3	6	2191999	2192004	0 %	50 %	50 %	0 %	479136483
35582	NC_021008	GGT	2	6	2192045	2192050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136483
35583	NC_021008	GA	3	6	2192087	2192092	50 %	0 %	50 %	0 %	479136483
35584	NC_021008	CAGCCG	2	12	2192101	2192112	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479136483
35585	NC_021008	CGA	2	6	2192130	2192135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136483
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35587	NC_021008	CTC	2	6	2192184	2192189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136483
35588	NC_021008	GCG	2	6	2192221	2192226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136483
35589	NC_021008	TG	3	6	2192230	2192235	0 %	50 %	50 %	0 %	479136483
35590	NC_021008	GCG	2	6	2192308	2192313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136483
35591	NC_021008	GCC	2	6	2192331	2192336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136483
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35596	NC_021008	GCCG	2	8	2192507	2192514	0 %	0 %	50 %	50 %	479136483
35597	NC_021008	CTG	2	6	2192526	2192531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136483
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35601	NC_021008	CGG	2	6	2193444	2193449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136484
35602	NC_021008	GC	3	6	2193470	2193475	0 %	0 %	50 %	50 %	479136484
35603	NC_021008	ACC	2	6	2193476	2193481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136484
35604	NC_021008	CGC	2	6	2193502	2193507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136484
35605	NC_021008	TCCA	2	8	2193596	2193603	25 %	25 %	0 %	50 %	479136484
35606	NC_021008	GCCG	2	8	2193649	2193656	0 %	0 %	50 %	50 %	479136484
35607	NC_021008	TCG	2	6	2193761	2193766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136484
35608	NC_021008	GC	3	6	2193784	2193789	0 %	0 %	50 %	50 %	479136484
35609	NC_021008	CGA	2	6	2193855	2193860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136484
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35611	NC_021008	AGC	2	6	2193932	2193937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136484
35612	NC_021008	CG	3	6	2193942	2193947	0 %	0 %	50 %	50 %	479136484
35613	NC_021008	CCG	2	6	2193968	2193973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136484
35614	NC_021008	CTC	2	6	2194015	2194020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136484
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35616	NC_021008	GTC	2	6	2194145	2194150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136484
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35846	NC_021008	CCG	2	6	2208895	2208900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136492
35847	NC_021008	TCA	2	6	2208925	2208930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136492
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35959	NC_021008	CCA	2	6	2213352	2213357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136495
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