MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_021008	TGG	2	6	2151049	2151054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136460
35002	NC_021008	GCA	2	6	2151063	2151068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136460
35003	NC_021008	GCG	2	6	2151071	2151076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136460
35004	NC_021008	ACT	2	6	2151125	2151130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136460
35005	NC_021008	CG	4	8	2151138	2151145	0 %	0 %	50 %	50 %	479136460
35006	NC_021008	TGG	2	6	2151295	2151300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136460
35007	NC_021008	CGG	2	6	2151312	2151317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136460
35008	NC_021008	CGA	2	6	2151336	2151341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136460
35009	NC_021008	GCT	2	6	2151404	2151409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136460
35010	NC_021008	GC	3	6	2151522	2151527	0 %	0 %	50 %	50 %	479136460
35011	NC_021008	TGG	2	6	2151548	2151553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136460
35012	NC_021008	CGC	2	6	2151585	2151590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136460
35013	NC_021008	CTG	2	6	2151628	2151633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136460
35014	NC_021008	TCC	2	6	2151664	2151669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136460
35015	NC_021008	CTT	2	6	2151717	2151722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136460
35016	NC_021008	ACGG	2	8	2151755	2151762	25 %	0 %	50 %	25 %	479136460
35017	NC_021008	CGG	2	6	2151813	2151818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136460
35018	NC_021008	GCA	2	6	2151876	2151881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136460
35019	NC_021008	ATC	2	6	2151889	2151894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136460
35020	NC_021008	GGA	2	6	2151930	2151935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136460
35021	NC_021008	ACC	2	6	2151970	2151975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136460
35022	NC_021008	ATG	2	6	2152154	2152159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136460
35023	NC_021008	ACG	2	6	2152234	2152239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136460
35024	NC_021008	GCC	2	6	2152243	2152248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136460
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35026	NC_021008	CCGT	2	8	2152430	2152437	0 %	25 %	25 %	50 %	479136460
35027	NC_021008	TGC	2	6	2152454	2152459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136460
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35030	NC_021008	GC	3	6	2153941	2153946	0 %	0 %	50 %	50 %	479136461
35031	NC_021008	CGG	2	6	2153971	2153976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136461
35032	NC_021008	GCGA	2	8	2154009	2154016	25 %	0 %	50 %	25 %	479136461
35033	NC_021008	GCGCA	2	10	2154024	2154033	20 %	0 %	40 %	40 %	479136461
35034	NC_021008	GCG	2	6	2154070	2154075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136461
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35038	NC_021008	GGCCG	2	10	2154173	2154182	0 %	0 %	60 %	40 %	479136461
35039	NC_021008	GGC	2	6	2154233	2154238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136461
35040	NC_021008	GC	3	6	2154237	2154242	0 %	0 %	50 %	50 %	479136461
35041	NC_021008	AGC	2	6	2154261	2154266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136461
35042	NC_021008	ATC	2	6	2154270	2154275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136461
35043	NC_021008	CGG	3	9	2154298	2154306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136461
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35047	NC_021008	CGT	2	6	2154421	2154426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136461
35048	NC_021008	GC	3	6	2154427	2154432	0 %	0 %	50 %	50 %	479136461
35049	NC_021008	TGG	2	6	2154448	2154453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136461
35050	NC_021008	TGG	2	6	2154460	2154465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136461
35051	NC_021008	TGA	2	6	2154478	2154483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136461
35052	NC_021008	CG	3	6	2154526	2154531	0 %	0 %	50 %	50 %	479136461
35053	NC_021008	TCC	2	6	2154537	2154542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136461
35054	NC_021008	GAA	2	6	2154545	2154550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136461
35055	NC_021008	GTA	2	6	2154557	2154562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136461
35056	NC_021008	TCT	2	6	2154598	2154603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136461
35057	NC_021008	GGA	2	6	2154650	2154655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136461
35058	NC_021008	CAC	2	6	2154662	2154667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136461
35059	NC_021008	GATC	2	8	2154682	2154689	25 %	25 %	25 %	25 %	479136461
35060	NC_021008	CGG	2	6	2154700	2154705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136461
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35062	NC_021008	CGG	2	6	2154736	2154741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136461
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35068	NC_021008	CG	3	6	2154901	2154906	0 %	0 %	50 %	50 %	479136461
35069	NC_021008	GCC	2	6	2154938	2154943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136461
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35087	NC_021008	CG	3	6	2158228	2158233	0 %	0 %	50 %	50 %	479136462
35088	NC_021008	GAA	2	6	2158244	2158249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136462
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35098	NC_021008	TCA	2	6	2158713	2158718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136462
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35100	NC_021008	CTT	2	6	2158775	2158780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136462
35101	NC_021008	AGC	2	6	2159095	2159100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136463
35102	NC_021008	CGG	2	6	2159114	2159119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136463
35103	NC_021008	CA	3	6	2159121	2159126	50 %	0 %	0 %	50 %	479136463
35104	NC_021008	ACG	2	6	2159178	2159183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136463
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35106	NC_021008	CAT	2	6	2159259	2159264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136463
35107	NC_021008	TAG	2	6	2159293	2159298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136463
35108	NC_021008	CAT	2	6	2159301	2159306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136463
35109	NC_021008	TGA	2	6	2159339	2159344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136463
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35111	NC_021008	TTG	2	6	2159400	2159405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136463
35112	NC_021008	CCG	2	6	2159446	2159451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136463
35113	NC_021008	ACAG	2	8	2159453	2159460	50 %	0 %	25 %	25 %	479136463
35114	NC_021008	ATC	2	6	2159461	2159466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136463
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35116	NC_021008	GTCGG	2	10	2159493	2159502	0 %	20 %	60 %	20 %	479136464
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35118	NC_021008	CTG	3	9	2159585	2159593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136464
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35218	NC_021008	GACG	2	8	2169457	2169464	25 %	0 %	50 %	25 %	479136468
35219	NC_021008	CGG	2	6	2169522	2169527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136468
35220	NC_021008	GGA	2	6	2169568	2169573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136468
35221	NC_021008	TCACCT	2	12	2169606	2169617	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479136468
35222	NC_021008	GTCGGG	2	12	2169710	2169721	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479136468
35223	NC_021008	CGG	2	6	2169774	2169779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136468
35224	NC_021008	CACCTT	2	12	2169829	2169840	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479136468
35225	NC_021008	TCG	2	6	2169845	2169850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136468
35226	NC_021008	TCA	2	6	2169947	2169952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136468
35227	NC_021008	GA	4	8	2169958	2169965	50 %	0 %	50 %	0 %	479136468
35228	NC_021008	ACC	2	6	2170007	2170012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136468
35229	NC_021008	TGT	2	6	2170056	2170061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136468
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35231	NC_021008	GTG	2	6	2170226	2170231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136468
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35331	NC_021008	TTGGCG	2	12	2178042	2178053	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479136473
35332	NC_021008	CG	3	6	2178052	2178057	0 %	0 %	50 %	50 %	479136473
35333	NC_021008	GCA	2	6	2178067	2178072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136473
35334	NC_021008	GC	3	6	2178077	2178082	0 %	0 %	50 %	50 %	479136473
35335	NC_021008	ACG	2	6	2178109	2178114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136473
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35338	NC_021008	CGG	2	6	2178211	2178216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136473
35339	NC_021008	GAC	2	6	2178302	2178307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136473
35340	NC_021008	GGCCA	2	10	2178325	2178334	20 %	0 %	40 %	40 %	479136473
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35342	NC_021008	CAC	2	6	2178527	2178532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136473
35343	NC_021008	GCT	2	6	2178538	2178543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136473
35344	NC_021008	GAA	2	6	2178569	2178574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136473
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35346	NC_021008	GCG	2	6	2178675	2178680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136473
35347	NC_021008	AGC	2	6	2178684	2178689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136473
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35452	NC_021008	ACC	2	6	2183630	2183635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136475
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