MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_021008	CAT	2	6	2095273	2095278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136418
34002	NC_021008	AC	3	6	2095357	2095362	50 %	0 %	0 %	50 %	479136418
34003	NC_021008	AAT	2	6	2095573	2095578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136418
34004	NC_021008	CCG	2	6	2095618	2095623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136418
34005	NC_021008	GAA	2	6	2095647	2095652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136418
34006	NC_021008	GC	3	6	2095658	2095663	0 %	0 %	50 %	50 %	479136418
34007	NC_021008	TCCA	2	8	2095709	2095716	25 %	25 %	0 %	50 %	479136418
34008	NC_021008	AGT	2	6	2095737	2095742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136418
34009	NC_021008	ACT	2	6	2095794	2095799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136418
34010	NC_021008	GCCA	2	8	2095807	2095814	25 %	0 %	25 %	50 %	479136418
34011	NC_021008	CAT	2	6	2095870	2095875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136418
34012	NC_021008	AAC	2	6	2095887	2095892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136418
34013	NC_021008	AAC	2	6	2095904	2095909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136418
34014	NC_021008	TTC	2	6	2095966	2095971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136418
34015	NC_021008	GAG	2	6	2095999	2096004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136418
34016	NC_021008	TCGA	2	8	2096045	2096052	25 %	25 %	25 %	25 %	479136418
34017	NC_021008	TCA	2	6	2096097	2096102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136418
34018	NC_021008	CTC	2	6	2096114	2096119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136418
34019	NC_021008	GA	3	6	2096132	2096137	50 %	0 %	50 %	0 %	479136418
34020	NC_021008	AGA	2	6	2096270	2096275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136418
34021	NC_021008	CGA	3	9	2096806	2096814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136419
34022	NC_021008	C	6	6	2096886	2096891	0 %	0 %	0 %	100 %	479136419
34023	NC_021008	AAC	2	6	2097299	2097304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136420
34024	NC_021008	GCA	2	6	2097365	2097370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136420
34025	NC_021008	GCAAC	2	10	2097436	2097445	40 %	0 %	20 %	40 %	479136420
34026	NC_021008	CAT	2	6	2097460	2097465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136420
34027	NC_021008	TGC	2	6	2097474	2097479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136420
34028	NC_021008	CGC	2	6	2097484	2097489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136420
34029	NC_021008	GCC	2	6	2097545	2097550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136420
34030	NC_021008	CCA	2	6	2097558	2097563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136420
34031	NC_021008	GCTG	2	8	2097578	2097585	0 %	25 %	50 %	25 %	479136420
34032	NC_021008	CGG	2	6	2097615	2097620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136420
34033	NC_021008	ACA	2	6	2097630	2097635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136420
34034	NC_021008	CGC	3	9	2097688	2097696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136420
34035	NC_021008	AGG	2	6	2097700	2097705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136420
34036	NC_021008	GCG	2	6	2097717	2097722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136420
34037	NC_021008	AAAG	2	8	2097736	2097743	75 %	0 %	25 %	0 %	479136420
34038	NC_021008	GTTG	2	8	2097940	2097947	0 %	50 %	50 %	0 %	479136420
34039	NC_021008	CTT	2	6	2097991	2097996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136420
34040	NC_021008	TGA	2	6	2098110	2098115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136420
34041	NC_021008	CG	3	6	2098213	2098218	0 %	0 %	50 %	50 %	479136420
34042	NC_021008	GGC	2	6	2098252	2098257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136420
34043	NC_021008	TCA	2	6	2098266	2098271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136420
34044	NC_021008	ACG	2	6	2098282	2098287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136420
34045	NC_021008	CGCA	2	8	2098297	2098304	25 %	0 %	25 %	50 %	479136420
34046	NC_021008	TGCCC	2	10	2098396	2098405	0 %	20 %	20 %	60 %	479136421
34047	NC_021008	TCG	2	6	2098415	2098420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136421
34048	NC_021008	TGG	3	9	2098509	2098517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136421
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34050	NC_021008	CG	3	6	2098674	2098679	0 %	0 %	50 %	50 %	479136421
34051	NC_021008	TCA	2	6	2098692	2098697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136421
34052	NC_021008	CG	3	6	2098845	2098850	0 %	0 %	50 %	50 %	479136421
34053	NC_021008	GC	3	6	2098893	2098898	0 %	0 %	50 %	50 %	479136421
34054	NC_021008	GCC	2	6	2098920	2098925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136421
34055	NC_021008	ATT	2	6	2098999	2099004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136422
34056	NC_021008	CTT	2	6	2099015	2099020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136422
34057	NC_021008	TTC	2	6	2099043	2099048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136422
34058	NC_021008	ATC	2	6	2099051	2099056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136422
34059	NC_021008	T	6	6	2099075	2099080	0 %	100 %	0 %	0 %	479136422
34060	NC_021008	TCG	2	6	2099103	2099108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136422
34061	NC_021008	TCGCC	2	10	2099122	2099131	0 %	20 %	20 %	60 %	479136422
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34063	NC_021008	CTGC	2	8	2099305	2099312	0 %	25 %	25 %	50 %	479136422
34064	NC_021008	GAA	2	6	2099415	2099420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136422
34065	NC_021008	GTC	2	6	2099453	2099458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136422
34066	NC_021008	GCC	2	6	2099472	2099477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136422
34067	NC_021008	ATC	2	6	2099510	2099515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136422
34068	NC_021008	GAG	2	6	2099518	2099523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136422
34069	NC_021008	CTG	2	6	2099525	2099530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136422
34070	NC_021008	TCG	2	6	2099613	2099618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136422
34071	NC_021008	TGGC	2	8	2099653	2099660	0 %	25 %	50 %	25 %	479136422
34072	NC_021008	AGC	2	6	2099720	2099725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136422
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34074	NC_021008	AGC	2	6	2099807	2099812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136422
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34076	NC_021008	CGGC	2	8	2099863	2099870	0 %	0 %	50 %	50 %	479136422
34077	NC_021008	TTC	2	6	2099898	2099903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136422
34078	NC_021008	GTC	2	6	2099942	2099947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136422
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34084	NC_021008	CAAG	2	8	2100278	2100285	50 %	0 %	25 %	25 %	479136422
34085	NC_021008	GCG	2	6	2100366	2100371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136422
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34088	NC_021008	CGG	2	6	2100457	2100462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136422
34089	NC_021008	GC	3	6	2100463	2100468	0 %	0 %	50 %	50 %	479136422
34090	NC_021008	GGC	2	6	2100482	2100487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136422
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34093	NC_021008	CAGA	2	8	2100529	2100536	50 %	0 %	25 %	25 %	479136422
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34099	NC_021008	AGC	2	6	2100749	2100754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136422
34100	NC_021008	GGC	2	6	2100759	2100764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136422
34101	NC_021008	AGA	2	6	2100770	2100775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136422
34102	NC_021008	CAA	2	6	2100821	2100826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136422
34103	NC_021008	CG	3	6	2100828	2100833	0 %	0 %	50 %	50 %	479136422
34104	NC_021008	CAG	2	6	2100836	2100841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136422
34105	NC_021008	TGA	2	6	2100895	2100900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136422
34106	NC_021008	CTTGG	2	10	2100938	2100947	0 %	40 %	40 %	20 %	479136422
34107	NC_021008	CAG	2	6	2101028	2101033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136422
34108	NC_021008	CGA	2	6	2101060	2101065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136422
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34110	NC_021008	CAT	2	6	2101201	2101206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136422
34111	NC_021008	AACC	2	8	2101228	2101235	50 %	0 %	0 %	50 %	479136422
34112	NC_021008	GCC	2	6	2101274	2101279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136422
34113	NC_021008	GC	3	6	2101284	2101289	0 %	0 %	50 %	50 %	479136422
34114	NC_021008	CCTT	2	8	2101326	2101333	0 %	50 %	0 %	50 %	479136422
34115	NC_021008	ACGGA	2	10	2101382	2101391	40 %	0 %	40 %	20 %	479136422
34116	NC_021008	GTG	2	6	2101394	2101399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136422
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34233	NC_021008	CA	3	6	2107922	2107927	50 %	0 %	0 %	50 %	479136432
34234	NC_021008	CGA	2	6	2108036	2108041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136432
34235	NC_021008	CGT	2	6	2108201	2108206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136432
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34333	NC_021008	CGA	2	6	2114460	2114465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136437
34334	NC_021008	CGCC	2	8	2114493	2114500	0 %	0 %	25 %	75 %	479136437
34335	NC_021008	ACAGC	2	10	2114526	2114535	40 %	0 %	20 %	40 %	479136437
34336	NC_021008	GAT	2	6	2114539	2114544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136437
34337	NC_021008	GCGTGC	2	12	2114550	2114561	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479136437
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34339	NC_021008	CCA	2	6	2114627	2114632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136437
34340	NC_021008	GCC	2	6	2114657	2114662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136437
34341	NC_021008	GCC	2	6	2114723	2114728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136437
34342	NC_021008	GAA	2	6	2114773	2114778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136437
34343	NC_021008	GA	3	6	2114862	2114867	50 %	0 %	50 %	0 %	479136437
34344	NC_021008	CCA	2	6	2114871	2114876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136437
34345	NC_021008	GCG	2	6	2114888	2114893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136437
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