MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_021008	CGG	2	6	1951473	1951478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136318
31502	NC_021008	CGT	2	6	1951485	1951490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136318
31503	NC_021008	GGCCTC	2	12	1951594	1951605	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479136318
31504	NC_021008	CGAC	2	8	1951608	1951615	25 %	0 %	25 %	50 %	479136318
31505	NC_021008	CCCGG	2	10	1951631	1951640	0 %	0 %	40 %	60 %	479136318
31506	NC_021008	GAA	2	6	1951655	1951660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136318
31507	NC_021008	TGGTTT	2	12	1951665	1951676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136318
31508	NC_021008	GTTGAA	2	12	1951709	1951720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136318
31509	NC_021008	CGA	2	6	1951815	1951820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136318
31510	NC_021008	CTT	2	6	1951822	1951827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136318
31511	NC_021008	CGG	2	6	1951839	1951844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136318
31512	NC_021008	CTT	2	6	1951845	1951850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136318
31513	NC_021008	TCT	2	6	1951866	1951871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136318
31514	NC_021008	CCT	2	6	1951938	1951943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136318
31515	NC_021008	GCC	2	6	1951987	1951992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136318
31516	NC_021008	TGG	2	6	1952054	1952059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136318
31517	NC_021008	CAC	2	6	1952063	1952068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136318
31518	NC_021008	TCG	2	6	1952076	1952081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136318
31519	NC_021008	CG	4	8	1952091	1952098	0 %	0 %	50 %	50 %	479136318
31520	NC_021008	TGC	2	6	1952103	1952108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136318
31521	NC_021008	AAG	2	6	1952208	1952213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136319
31522	NC_021008	TG	4	8	1952227	1952234	0 %	50 %	50 %	0 %	479136319
31523	NC_021008	GATT	2	8	1952237	1952244	25 %	50 %	25 %	0 %	479136319
31524	NC_021008	AGC	2	6	1952248	1952253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136319
31525	NC_021008	TCG	2	6	1952278	1952283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136319
31526	NC_021008	TG	3	6	1952315	1952320	0 %	50 %	50 %	0 %	479136319
31527	NC_021008	CGT	2	6	1952384	1952389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136319
31528	NC_021008	GGT	2	6	1952518	1952523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136320
31529	NC_021008	CCTCT	2	10	1952535	1952544	0 %	40 %	0 %	60 %	479136320
31530	NC_021008	TCG	3	9	1952561	1952569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136320
31531	NC_021008	GC	3	6	1952586	1952591	0 %	0 %	50 %	50 %	479136320
31532	NC_021008	CG	3	6	1952638	1952643	0 %	0 %	50 %	50 %	479136320
31533	NC_021008	GCGT	2	8	1952644	1952651	0 %	25 %	50 %	25 %	479136320
31534	NC_021008	AGC	2	6	1952666	1952671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136320
31535	NC_021008	TGA	2	6	1952676	1952681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136320
31536	NC_021008	GAT	2	6	1952695	1952700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136320
31537	NC_021008	TGC	2	6	1952702	1952707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136320
31538	NC_021008	TGG	2	6	1952753	1952758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136320
31539	NC_021008	CG	3	6	1952809	1952814	0 %	0 %	50 %	50 %	479136320
31540	NC_021008	GCC	2	6	1952828	1952833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136320
31541	NC_021008	CAG	2	6	1952866	1952871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136320
31542	NC_021008	TCG	2	6	1952888	1952893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136320
31543	NC_021008	GTCCTC	2	12	1953487	1953498	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479136321
31544	NC_021008	CGA	2	6	1953519	1953524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136321
31545	NC_021008	GCCGC	2	10	1953551	1953560	0 %	0 %	40 %	60 %	479136321
31546	NC_021008	CGG	2	6	1953587	1953592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136321
31547	NC_021008	TCG	2	6	1953677	1953682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136321
31548	NC_021008	GC	3	6	1953840	1953845	0 %	0 %	50 %	50 %	479136321
31549	NC_021008	ACG	2	6	1953863	1953868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136321
31550	NC_021008	TCG	2	6	1953887	1953892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136321
31551	NC_021008	GACG	2	8	1953903	1953910	25 %	0 %	50 %	25 %	479136321
31552	NC_021008	TTC	2	6	1953955	1953960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136321
31553	NC_021008	AGCACG	2	12	1954470	1954481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136322
31554	NC_021008	AGC	2	6	1954572	1954577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136322
31555	NC_021008	CTG	2	6	1954598	1954603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136322
31556	NC_021008	TCCTC	2	10	1954628	1954637	0 %	40 %	0 %	60 %	479136323
31557	NC_021008	CGA	2	6	1954647	1954652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136323
31558	NC_021008	ACG	2	6	1954673	1954678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136323
31559	NC_021008	CAC	2	6	1954688	1954693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136323
31560	NC_021008	TGCA	2	8	1954718	1954725	25 %	25 %	25 %	25 %	479136323
31561	NC_021008	CA	3	6	1954745	1954750	50 %	0 %	0 %	50 %	479136323
31562	NC_021008	GAC	2	6	1954756	1954761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136323
31563	NC_021008	GAC	3	9	1954859	1954867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136324
31564	NC_021008	TCT	2	6	1954975	1954980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136324
31565	NC_021008	CTG	2	6	1955006	1955011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136324
31566	NC_021008	CGG	2	6	1955041	1955046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136324
31567	NC_021008	CTT	2	6	1955063	1955068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136324
31568	NC_021008	TCT	2	6	1955128	1955133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136324
31569	NC_021008	CGC	2	6	1955141	1955146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136324
31570	NC_021008	CGC	2	6	1955176	1955181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136324
31571	NC_021008	CCGG	2	8	1955210	1955217	0 %	0 %	50 %	50 %	479136324
31572	NC_021008	CG	3	6	1955224	1955229	0 %	0 %	50 %	50 %	479136324
31573	NC_021008	CTG	2	6	1955273	1955278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136324
31574	NC_021008	GCTCC	2	10	1955358	1955367	0 %	20 %	20 %	60 %	479136324
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31576	NC_021008	TGA	2	6	1955440	1955445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136324
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31578	NC_021008	TGA	2	6	1955467	1955472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136324
31579	NC_021008	GGCC	2	8	1955518	1955525	0 %	0 %	50 %	50 %	479136324
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31583	NC_021008	CGG	2	6	1955674	1955679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136324
31584	NC_021008	AGC	2	6	1955688	1955693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136324
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31587	NC_021008	CGT	2	6	1956276	1956281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136326
31588	NC_021008	CCG	2	6	1956333	1956338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136326
31589	NC_021008	TCG	2	6	1956341	1956346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136326
31590	NC_021008	CAG	2	6	1956352	1956357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136326
31591	NC_021008	CGC	2	6	1956366	1956371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136326
31592	NC_021008	TCG	2	6	1956425	1956430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136326
31593	NC_021008	CAG	2	6	1956448	1956453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136326
31594	NC_021008	CGGC	2	8	1956454	1956461	0 %	0 %	50 %	50 %	479136326
31595	NC_021008	GCC	2	6	1956500	1956505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136326
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31597	NC_021008	AGCG	2	8	1956618	1956625	25 %	0 %	50 %	25 %	479136327
31598	NC_021008	CTT	2	6	1956636	1956641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136327
31599	NC_021008	TCG	2	6	1956700	1956705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136327
31600	NC_021008	CGG	2	6	1956901	1956906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136328
31601	NC_021008	GAT	2	6	1956944	1956949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136328
31602	NC_021008	CGC	2	6	1956983	1956988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136328
31603	NC_021008	TGC	2	6	1957067	1957072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136328
31604	NC_021008	TTC	2	6	1957077	1957082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136328
31605	NC_021008	GTC	2	6	1957155	1957160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136328
31606	NC_021008	GAC	2	6	1957167	1957172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136328
31607	NC_021008	GCC	2	6	1957218	1957223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136328
31608	NC_021008	CGA	2	6	1957647	1957652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136329
31609	NC_021008	ACG	2	6	1957662	1957667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136329
31610	NC_021008	CCG	2	6	1957777	1957782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136329
31611	NC_021008	CGG	2	6	1957787	1957792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136329
31612	NC_021008	ACC	2	6	1957930	1957935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136329
31613	NC_021008	CGG	2	6	1957945	1957950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136329
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31615	NC_021008	GTC	2	6	1958051	1958056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136329
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31727	NC_021008	CT	3	6	1964139	1964144	0 %	50 %	0 %	50 %	479136333
31728	NC_021008	ATC	2	6	1964253	1964258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136333
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