MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_021008	GCA	2	6	1846291	1846296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136211
29502	NC_021008	ATTG	2	8	1846355	1846362	25 %	50 %	25 %	0 %	479136211
29503	NC_021008	GC	3	6	1846388	1846393	0 %	0 %	50 %	50 %	479136211
29504	NC_021008	TCGGC	2	10	1846408	1846417	0 %	20 %	40 %	40 %	479136211
29505	NC_021008	AT	3	6	1846447	1846452	50 %	50 %	0 %	0 %	479136211
29506	NC_021008	CA	3	6	1846460	1846465	50 %	0 %	0 %	50 %	479136211
29507	NC_021008	CGC	2	6	1846588	1846593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136211
29508	NC_021008	CTG	2	6	1846643	1846648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136211
29509	NC_021008	GCG	2	6	1846678	1846683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136211
29510	NC_021008	CCA	2	6	1846698	1846703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136211
29511	NC_021008	TG	3	6	1846745	1846750	0 %	50 %	50 %	0 %	479136211
29512	NC_021008	GTC	2	6	1846763	1846768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136211
29513	NC_021008	CAG	2	6	1846769	1846774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136211
29514	NC_021008	AGA	2	6	1846836	1846841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136211
29515	NC_021008	GA	3	6	1846882	1846887	50 %	0 %	50 %	0 %	479136211
29516	NC_021008	GCA	3	9	1846911	1846919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136211
29517	NC_021008	CAAC	2	8	1847003	1847010	50 %	0 %	0 %	50 %	479136212
29518	NC_021008	GCAGAA	2	12	1847031	1847042	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	479136212
29519	NC_021008	CTG	2	6	1847109	1847114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136212
29520	NC_021008	GCA	2	6	1847132	1847137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136212
29521	NC_021008	AC	3	6	1847168	1847173	50 %	0 %	0 %	50 %	479136212
29522	NC_021008	AGG	2	6	1847179	1847184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136212
29523	NC_021008	ACG	3	9	1847215	1847223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136212
29524	NC_021008	CGA	2	6	1847339	1847344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136212
29525	NC_021008	AC	4	8	1847360	1847367	50 %	0 %	0 %	50 %	479136212
29526	NC_021008	CAAGC	2	10	1847388	1847397	40 %	0 %	20 %	40 %	479136212
29527	NC_021008	GCA	2	6	1847441	1847446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136212
29528	NC_021008	CGA	2	6	1847492	1847497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136212
29529	NC_021008	GCA	3	9	1847561	1847569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136212
29530	NC_021008	CCA	2	6	1847573	1847578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136212
29531	NC_021008	ATG	2	6	1847611	1847616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136212
29532	NC_021008	CCT	2	6	1847633	1847638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136212
29533	NC_021008	CAC	2	6	1847763	1847768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136212
29534	NC_021008	GCG	2	6	1847856	1847861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136213
29535	NC_021008	GAT	2	6	1847942	1847947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136213
29536	NC_021008	TGG	2	6	1847965	1847970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136213
29537	NC_021008	CCG	2	6	1847985	1847990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136213
29538	NC_021008	CCG	2	6	1848024	1848029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136213
29539	NC_021008	TCA	2	6	1848031	1848036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136213
29540	NC_021008	GAC	2	6	1848050	1848055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136213
29541	NC_021008	GAA	2	6	1848089	1848094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136213
29542	NC_021008	CTG	2	6	1848095	1848100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136213
29543	NC_021008	CCG	2	6	1848142	1848147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136213
29544	NC_021008	GCCA	2	8	1848246	1848253	25 %	0 %	25 %	50 %	479136213
29545	NC_021008	TCA	2	6	1848292	1848297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136213
29546	NC_021008	GA	3	6	1848313	1848318	50 %	0 %	50 %	0 %	479136213
29547	NC_021008	ATG	2	6	1848342	1848347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136213
29548	NC_021008	GAA	3	9	1848368	1848376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136213
29549	NC_021008	TTG	2	6	1848411	1848416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136213
29550	NC_021008	GTG	2	6	1848459	1848464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136213
29551	NC_021008	CAG	2	6	1848476	1848481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136213
29552	NC_021008	AGC	2	6	1848501	1848506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136213
29553	NC_021008	CGT	2	6	1848571	1848576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136213
29554	NC_021008	AGA	2	6	1848592	1848597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136213
29555	NC_021008	ACG	2	6	1848615	1848620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136213
29556	NC_021008	GAA	2	6	1848629	1848634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136213
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29558	NC_021008	AGA	2	6	1848651	1848656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136213
29559	NC_021008	GAG	2	6	1848666	1848671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136213
29560	NC_021008	GAT	2	6	1848690	1848695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136213
29561	NC_021008	TTTGG	2	10	1848708	1848717	0 %	60 %	40 %	0 %	479136213
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29564	NC_021008	GCT	2	6	1848937	1848942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136214
29565	NC_021008	AGT	2	6	1849015	1849020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136214
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29568	NC_021008	GGC	2	6	1849400	1849405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136214
29569	NC_021008	AGTCC	2	10	1849430	1849439	20 %	20 %	20 %	40 %	479136214
29570	NC_021008	TAGC	2	8	1849509	1849516	25 %	25 %	25 %	25 %	479136214
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29583	NC_021008	GAC	2	6	1849958	1849963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136214
29584	NC_021008	CTT	2	6	1850105	1850110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136215
29585	NC_021008	TTAT	2	8	1850142	1850149	25 %	75 %	0 %	0 %	479136215
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29587	NC_021008	CGATC	2	10	1850335	1850344	20 %	20 %	20 %	40 %	479136216
29588	NC_021008	GGC	2	6	1850360	1850365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136216
29589	NC_021008	CA	3	6	1850486	1850491	50 %	0 %	0 %	50 %	479136216
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29598	NC_021008	TCA	2	6	1850877	1850882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136216
29599	NC_021008	TCG	2	6	1850958	1850963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136216
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29601	NC_021008	ACC	2	6	1851015	1851020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136216
29602	NC_021008	T	6	6	1851161	1851166	0 %	100 %	0 %	0 %	479136216
29603	NC_021008	TCA	2	6	1851196	1851201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136216
29604	NC_021008	GC	3	6	1851231	1851236	0 %	0 %	50 %	50 %	479136216
29605	NC_021008	CCAT	2	8	1851259	1851266	25 %	25 %	0 %	50 %	479136216
29606	NC_021008	TTC	2	6	1852685	1852690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136217
29607	NC_021008	GC	3	6	1852747	1852752	0 %	0 %	50 %	50 %	479136217
29608	NC_021008	CTG	2	6	1852805	1852810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136217
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29611	NC_021008	GCC	2	6	1852883	1852888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136217
29612	NC_021008	GCCAA	2	10	1852911	1852920	40 %	0 %	20 %	40 %	479136217
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