MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_021008	TTG	2	6	1674550	1674555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136092
27002	NC_021008	TGA	2	6	1674564	1674569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136092
27003	NC_021008	CAT	2	6	1674603	1674608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136092
27004	NC_021008	GAA	2	6	1674832	1674837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136092
27005	NC_021008	GCG	2	6	1674923	1674928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136092
27006	NC_021008	CAG	2	6	1674940	1674945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136092
27007	NC_021008	GAT	2	6	1675018	1675023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136092
27008	NC_021008	ACCGGC	2	12	1675054	1675065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479136092
27009	NC_021008	ACC	2	6	1675067	1675072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136092
27010	NC_021008	GAT	2	6	1675099	1675104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136092
27011	NC_021008	GGC	2	6	1675105	1675110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136092
27012	NC_021008	ACA	2	6	1679583	1679588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136093
27013	NC_021008	CCG	2	6	1679600	1679605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136093
27014	NC_021008	TA	3	6	1679667	1679672	50 %	50 %	0 %	0 %	479136093
27015	NC_021008	GGC	2	6	1679864	1679869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136093
27016	NC_021008	ACA	2	6	1679874	1679879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136093
27017	NC_021008	CAT	2	6	1679881	1679886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136093
27018	NC_021008	GC	3	6	1679943	1679948	0 %	0 %	50 %	50 %	479136093
27019	NC_021008	GCA	2	6	1679964	1679969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136093
27020	NC_021008	ATC	2	6	1679972	1679977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136093
27021	NC_021008	TCA	2	6	1680006	1680011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136093
27022	NC_021008	CGC	2	6	1680087	1680092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136093
27023	NC_021008	GCC	2	6	1680140	1680145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136093
27024	NC_021008	GGC	2	6	1680160	1680165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136093
27025	NC_021008	TCG	2	6	1680183	1680188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136093
27026	NC_021008	GCT	2	6	1680189	1680194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136093
27027	NC_021008	GCCTC	2	10	1680265	1680274	0 %	20 %	20 %	60 %	479136093
27028	NC_021008	GCCG	2	8	1680289	1680296	0 %	0 %	50 %	50 %	479136093
27029	NC_021008	TGC	2	6	1680309	1680314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136093
27030	NC_021008	TAC	2	6	1680347	1680352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136093
27031	NC_021008	GATCA	2	10	1680488	1680497	40 %	20 %	20 %	20 %	479136093
27032	NC_021008	GCG	2	6	1680551	1680556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136093
27033	NC_021008	GAT	2	6	1680656	1680661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136093
27034	NC_021008	ACA	2	6	1680663	1680668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136093
27035	NC_021008	AAT	2	6	1680674	1680679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136093
27036	NC_021008	TTCC	2	8	1680717	1680724	0 %	50 %	0 %	50 %	479136093
27037	NC_021008	GCG	2	6	1680749	1680754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136093
27038	NC_021008	GCA	2	6	1680834	1680839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136093
27039	NC_021008	GC	3	6	1680852	1680857	0 %	0 %	50 %	50 %	479136093
27040	NC_021008	TCG	2	6	1681193	1681198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27041	NC_021008	GCC	2	6	1681222	1681227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27042	NC_021008	CTG	2	6	1681275	1681280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27043	NC_021008	TTG	2	6	1681291	1681296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136094
27044	NC_021008	CGC	2	6	1681326	1681331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27045	NC_021008	AGG	2	6	1681411	1681416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136094
27046	NC_021008	TCC	3	9	1681431	1681439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136094
27047	NC_021008	CCA	2	6	1681504	1681509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27048	NC_021008	ACC	2	6	1681560	1681565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27049	NC_021008	CGG	2	6	1681574	1681579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136094
27050	NC_021008	TG	3	6	1681616	1681621	0 %	50 %	50 %	0 %	479136094
27051	NC_021008	CAC	2	6	1681658	1681663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27052	NC_021008	TCCGA	2	10	1681665	1681674	20 %	20 %	20 %	40 %	479136094
27053	NC_021008	GGGC	2	8	1681691	1681698	0 %	0 %	75 %	25 %	479136094
27054	NC_021008	TGC	2	6	1681756	1681761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27055	NC_021008	CAG	2	6	1681775	1681780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27056	NC_021008	AGC	2	6	1681819	1681824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27057	NC_021008	GGC	2	6	1681896	1681901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136094
27058	NC_021008	CACCCT	2	12	1681925	1681936	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	479136094
27059	NC_021008	TAC	2	6	1682189	1682194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136094
27060	NC_021008	ACCA	2	8	1682214	1682221	50 %	0 %	0 %	50 %	479136094
27061	NC_021008	TG	3	6	1682258	1682263	0 %	50 %	50 %	0 %	479136094
27062	NC_021008	CCA	2	6	1682278	1682283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27063	NC_021008	TCA	2	6	1682287	1682292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136094
27064	NC_021008	CAG	2	6	1682337	1682342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27065	NC_021008	AAC	2	6	1682343	1682348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136094
27066	NC_021008	CAA	2	6	1682357	1682362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136094
27067	NC_021008	CCA	2	6	1682363	1682368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27068	NC_021008	GAT	2	6	1682418	1682423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136094
27069	NC_021008	ACA	2	6	1682527	1682532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136094
27070	NC_021008	ACG	2	6	1682557	1682562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27071	NC_021008	CCG	2	6	1682587	1682592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27072	NC_021008	TTAC	2	8	1682614	1682621	25 %	50 %	0 %	25 %	479136094
27073	NC_021008	ATG	2	6	1682677	1682682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136094
27074	NC_021008	CTC	2	6	1682713	1682718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136094
27075	NC_021008	AGC	2	6	1682766	1682771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27076	NC_021008	CAGGTG	2	12	1682832	1682843	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	479136094
27077	NC_021008	ACGGC	2	10	1682926	1682935	20 %	0 %	40 %	40 %	479136094
27078	NC_021008	ACCGGC	2	12	1682937	1682948	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479136094
27079	NC_021008	ACC	2	6	1683012	1683017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27080	NC_021008	CGT	2	6	1683035	1683040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27081	NC_021008	CGA	2	6	1683118	1683123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27082	NC_021008	CCA	2	6	1683124	1683129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27083	NC_021008	GCG	2	6	1683132	1683137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136094
27084	NC_021008	CCA	2	6	1683160	1683165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27085	NC_021008	TAT	2	6	1683177	1683182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479136094
27086	NC_021008	CAT	2	6	1683191	1683196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136094
27087	NC_021008	TCGAG	2	10	1683230	1683239	20 %	20 %	40 %	20 %	479136094
27088	NC_021008	GCC	2	6	1683261	1683266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27089	NC_021008	GCC	2	6	1683276	1683281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27090	NC_021008	ATA	2	6	1683307	1683312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136094
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27093	NC_021008	GCC	2	6	1683530	1683535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27094	NC_021008	CAC	2	6	1683647	1683652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27095	NC_021008	AAC	2	6	1683666	1683671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136094
27096	NC_021008	GCC	2	6	1683888	1683893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27097	NC_021008	CGA	3	9	1683944	1683952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136094
27098	NC_021008	CAA	2	6	1683971	1683976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136094
27099	NC_021008	ACT	2	6	1684015	1684020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136094
27100	NC_021008	GGA	2	6	1684076	1684081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136094
27101	NC_021008	GC	3	6	1684094	1684099	0 %	0 %	50 %	50 %	479136094
27102	NC_021008	ACA	2	6	1684231	1684236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136094
27103	NC_021008	CAC	2	6	1684313	1684318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27104	NC_021008	CCA	2	6	1684330	1684335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27105	NC_021008	GCC	2	6	1684416	1684421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27106	NC_021008	GCC	2	6	1684427	1684432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27107	NC_021008	CCG	2	6	1684459	1684464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136094
27108	NC_021008	CCA	2	6	1684465	1684470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27109	NC_021008	AAG	2	6	1684476	1684481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136094
27110	NC_021008	GTGGAT	2	12	1684485	1684496	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479136094
27111	NC_021008	GCTCAC	2	12	1684569	1684580	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479136094
27112	NC_021008	GCG	2	6	1684588	1684593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136094
27113	NC_021008	ACC	2	6	1684602	1684607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
27114	NC_021008	ACA	2	6	1684669	1684674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136094
27115	NC_021008	CG	3	6	1684762	1684767	0 %	0 %	50 %	50 %	479136094
27116	NC_021008	CCA	2	6	1684852	1684857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136094
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27225	NC_021008	TTGCCT	2	12	1690504	1690515	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479136097
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27228	NC_021008	ATC	2	6	1690584	1690589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136097
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