MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_021008	TCGT	2	8	1619006	1619013	0 %	50 %	25 %	25 %	479136054
26002	NC_021008	CAG	2	6	1619069	1619074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136054
26003	NC_021008	CG	3	6	1619105	1619110	0 %	0 %	50 %	50 %	479136054
26004	NC_021008	CCT	2	6	1619116	1619121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136054
26005	NC_021008	TAG	2	6	1619124	1619129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136054
26006	NC_021008	TGG	2	6	1619154	1619159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136054
26007	NC_021008	TGG	2	6	1619206	1619211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136054
26008	NC_021008	ACC	2	6	1619217	1619222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136054
26009	NC_021008	TGA	2	6	1619236	1619241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136054
26010	NC_021008	GCC	2	6	1619253	1619258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136054
26011	NC_021008	CG	3	6	1619262	1619267	0 %	0 %	50 %	50 %	479136054
26012	NC_021008	GCC	2	6	1619279	1619284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136054
26013	NC_021008	GGT	2	6	1619339	1619344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136054
26014	NC_021008	CAG	2	6	1619504	1619509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136054
26015	NC_021008	CGGTGG	2	12	1619536	1619547	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479136054
26016	NC_021008	CACC	2	8	1619557	1619564	25 %	0 %	0 %	75 %	479136054
26017	NC_021008	ACG	2	6	1619611	1619616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136054
26018	NC_021008	TCG	2	6	1619677	1619682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136054
26019	NC_021008	GGC	2	6	1619687	1619692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136054
26020	NC_021008	CAG	2	6	1619738	1619743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136054
26021	NC_021008	CGG	3	9	1619755	1619763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136054
26022	NC_021008	TCG	2	6	1619787	1619792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136054
26023	NC_021008	TGA	2	6	1619809	1619814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136054
26024	NC_021008	CGGC	2	8	1619818	1619825	0 %	0 %	50 %	50 %	479136054
26025	NC_021008	GCG	2	6	1619910	1619915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136054
26026	NC_021008	GCAA	2	8	1619979	1619986	50 %	0 %	25 %	25 %	479136054
26027	NC_021008	GCC	2	6	1620057	1620062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136054
26028	NC_021008	TCTCC	2	10	1620258	1620267	0 %	40 %	0 %	60 %	479136055
26029	NC_021008	CGG	2	6	1620282	1620287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136055
26030	NC_021008	TGC	2	6	1620288	1620293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136055
26031	NC_021008	CCACA	2	10	1620342	1620351	40 %	0 %	0 %	60 %	479136055
26032	NC_021008	ATA	2	6	1620384	1620389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479136055
26033	NC_021008	ACC	2	6	1620422	1620427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136055
26034	NC_021008	CAT	2	6	1620460	1620465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136055
26035	NC_021008	TTGC	2	8	1620482	1620489	0 %	50 %	25 %	25 %	479136055
26036	NC_021008	TCG	2	6	1620510	1620515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136055
26037	NC_021008	GAA	2	6	1620590	1620595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136055
26038	NC_021008	AGC	2	6	1620612	1620617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136055
26039	NC_021008	CCG	2	6	1620645	1620650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136055
26040	NC_021008	CCA	2	6	1620792	1620797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136055
26041	NC_021008	CCG	2	6	1620828	1620833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136055
26042	NC_021008	CCGA	2	8	1620849	1620856	25 %	0 %	25 %	50 %	479136055
26043	NC_021008	ACA	2	6	1620879	1620884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136055
26044	NC_021008	TGT	2	6	1620943	1620948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136055
26045	NC_021008	TGC	2	6	1620952	1620957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136055
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26047	NC_021008	TGA	2	6	1621033	1621038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136055
26048	NC_021008	ACTG	2	8	1621252	1621259	25 %	25 %	25 %	25 %	479136055
26049	NC_021008	GGC	2	6	1621304	1621309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136055
26050	NC_021008	ATG	2	6	1621449	1621454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136055
26051	NC_021008	CAC	2	6	1621552	1621557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136055
26052	NC_021008	GGT	2	6	1621558	1621563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136055
26053	NC_021008	AAG	2	6	1621565	1621570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136055
26054	NC_021008	CCG	2	6	1621596	1621601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136055
26055	NC_021008	CCAG	2	8	1621684	1621691	25 %	0 %	25 %	50 %	479136055
26056	NC_021008	CTA	2	6	1621708	1621713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136055
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26063	NC_021008	GTG	2	6	1622197	1622202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136056
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26069	NC_021008	GGCG	2	8	1622372	1622379	0 %	0 %	75 %	25 %	479136056
26070	NC_021008	CCAG	2	8	1622531	1622538	25 %	0 %	25 %	50 %	479136056
26071	NC_021008	CGG	2	6	1622564	1622569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136056
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26085	NC_021008	GCA	3	9	1623002	1623010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136056
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26087	NC_021008	GAG	2	6	1623031	1623036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136056
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26100	NC_021008	CCT	2	6	1623642	1623647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136057
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26102	NC_021008	GTC	2	6	1623703	1623708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136057
26103	NC_021008	TCC	2	6	1623743	1623748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479136057
26104	NC_021008	TGG	2	6	1623770	1623775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136057
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26106	NC_021008	TGCCGG	2	12	1623867	1623878	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479136057
26107	NC_021008	GCC	2	6	1623886	1623891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136057
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26109	NC_021008	GTA	2	6	1623961	1623966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136057
26110	NC_021008	GCC	2	6	1624012	1624017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136057
26111	NC_021008	GTA	2	6	1624051	1624056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136057
26112	NC_021008	GTC	2	6	1624066	1624071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136057
26113	NC_021008	GC	3	6	1624115	1624120	0 %	0 %	50 %	50 %	479136057
26114	NC_021008	CG	3	6	1624126	1624131	0 %	0 %	50 %	50 %	479136057
26115	NC_021008	GCT	2	6	1624182	1624187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136057
26116	NC_021008	CGA	2	6	1624233	1624238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136057
26117	NC_021008	CGC	2	6	1624242	1624247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136057
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26122	NC_021008	TGG	2	6	1624350	1624355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136057
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26219	NC_021008	GC	3	6	1629894	1629899	0 %	0 %	50 %	50 %	479136061
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26222	NC_021008	CTGA	2	8	1630213	1630220	25 %	25 %	25 %	25 %	479136062
26223	NC_021008	ATC	2	6	1630267	1630272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136062
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26225	NC_021008	TGG	3	9	1630343	1630351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136062
26226	NC_021008	GGC	2	6	1630450	1630455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136062
26227	NC_021008	TGG	2	6	1630463	1630468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136062
26228	NC_021008	CCA	2	6	1630484	1630489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136062
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