MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_021008	GCCG	2	8	1556501	1556508	0 %	0 %	50 %	50 %	479136014
25002	NC_021008	CGA	2	6	1556655	1556660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136015
25003	NC_021008	GAAG	2	8	1556718	1556725	50 %	0 %	50 %	0 %	479136015
25004	NC_021008	AAC	2	6	1556749	1556754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136015
25005	NC_021008	TCA	2	6	1556756	1556761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136015
25006	NC_021008	CCA	2	6	1556762	1556767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136015
25007	NC_021008	AAG	2	6	1556785	1556790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136015
25008	NC_021008	GAC	2	6	1556824	1556829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136015
25009	NC_021008	TGC	2	6	1556876	1556881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136015
25010	NC_021008	GCC	2	6	1556890	1556895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136015
25011	NC_021008	GGA	2	6	1556922	1556927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136015
25012	NC_021008	GAA	2	6	1556967	1556972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136015
25013	NC_021008	GAT	2	6	1556974	1556979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136015
25014	NC_021008	ACG	2	6	1556999	1557004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136015
25015	NC_021008	TGG	2	6	1557011	1557016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136015
25016	NC_021008	GCT	2	6	1557162	1557167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136015
25017	NC_021008	CGA	2	6	1557174	1557179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136015
25018	NC_021008	CCG	2	6	1557258	1557263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136015
25019	NC_021008	GCA	2	6	1557272	1557277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136015
25020	NC_021008	GAG	2	6	1557301	1557306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136015
25021	NC_021008	AAG	2	6	1557441	1557446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136016
25022	NC_021008	CAG	2	6	1557468	1557473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25023	NC_021008	GC	3	6	1557692	1557697	0 %	0 %	50 %	50 %	479136016
25024	NC_021008	CCG	3	9	1557703	1557711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25025	NC_021008	TCCGC	2	10	1557751	1557760	0 %	20 %	20 %	60 %	479136016
25026	NC_021008	CCGACG	2	12	1557790	1557801	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479136016
25027	NC_021008	GGTGCC	2	12	1557884	1557895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479136016
25028	NC_021008	CGA	2	6	1557959	1557964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25029	NC_021008	GAG	2	6	1558020	1558025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136016
25030	NC_021008	CCA	2	6	1558036	1558041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136016
25031	NC_021008	CAC	2	6	1558091	1558096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136016
25032	NC_021008	GCC	2	6	1558146	1558151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25033	NC_021008	AAG	2	6	1558245	1558250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136016
25034	NC_021008	GTCAAG	2	12	1558302	1558313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479136016
25035	NC_021008	ACG	2	6	1558330	1558335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25036	NC_021008	CTGTTC	2	12	1558344	1558355	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	479136016
25037	NC_021008	ACC	2	6	1558372	1558377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136016
25038	NC_021008	CGG	2	6	1558418	1558423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136016
25039	NC_021008	ACC	2	6	1558551	1558556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136016
25040	NC_021008	GCC	3	9	1558557	1558565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25041	NC_021008	CGA	2	6	1558613	1558618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25042	NC_021008	ACC	2	6	1558624	1558629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136016
25043	NC_021008	GGTG	2	8	1558655	1558662	0 %	25 %	75 %	0 %	479136016
25044	NC_021008	GCC	2	6	1558671	1558676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25045	NC_021008	CGC	2	6	1558695	1558700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25046	NC_021008	ATC	2	6	1558725	1558730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136016
25047	NC_021008	CTG	2	6	1558731	1558736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25048	NC_021008	GGC	2	6	1558737	1558742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136016
25049	NC_021008	CGG	2	6	1558763	1558768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136016
25050	NC_021008	CCG	2	6	1558874	1558879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25051	NC_021008	TGCC	2	8	1558886	1558893	0 %	25 %	25 %	50 %	479136016
25052	NC_021008	GCC	2	6	1559064	1559069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25053	NC_021008	TGA	2	6	1559158	1559163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136016
25054	NC_021008	CAG	2	6	1559253	1559258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25055	NC_021008	CAA	2	6	1559336	1559341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136016
25056	NC_021008	CCA	2	6	1559365	1559370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136016
25057	NC_021008	CGG	2	6	1559399	1559404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136016
25058	NC_021008	ACC	3	9	1559463	1559471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136016
25059	NC_021008	CAT	2	6	1559504	1559509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136016
25060	NC_021008	CGGC	2	8	1559572	1559579	0 %	0 %	50 %	50 %	479136016
25061	NC_021008	CGA	2	6	1559633	1559638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25062	NC_021008	CGG	2	6	1559659	1559664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136016
25063	NC_021008	CCG	2	6	1559665	1559670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25064	NC_021008	GC	3	6	1559677	1559682	0 %	0 %	50 %	50 %	479136016
25065	NC_021008	CGG	2	6	1559717	1559722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136016
25066	NC_021008	GTTC	2	8	1559740	1559747	0 %	50 %	25 %	25 %	479136016
25067	NC_021008	GCC	2	6	1559762	1559767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25068	NC_021008	GCCGTG	2	12	1559784	1559795	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479136016
25069	NC_021008	GC	3	6	1559807	1559812	0 %	0 %	50 %	50 %	479136016
25070	NC_021008	CGCGC	2	10	1559858	1559867	0 %	0 %	40 %	60 %	479136016
25071	NC_021008	GCT	2	6	1559903	1559908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25072	NC_021008	GAG	2	6	1559928	1559933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136016
25073	NC_021008	CCG	2	6	1559986	1559991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25074	NC_021008	AAC	2	6	1560039	1560044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136016
25075	NC_021008	GAC	2	6	1560057	1560062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25076	NC_021008	GTTC	2	8	1560082	1560089	0 %	50 %	25 %	25 %	479136016
25077	NC_021008	TCG	2	6	1560091	1560096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25078	NC_021008	CAC	3	9	1560158	1560166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136016
25079	NC_021008	GCC	2	6	1560186	1560191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
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25081	NC_021008	GAA	2	6	1560317	1560322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479136016
25082	NC_021008	CAA	2	6	1560383	1560388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136016
25083	NC_021008	CCG	3	9	1560403	1560411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136016
25084	NC_021008	CAA	2	6	1560452	1560457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136016
25085	NC_021008	GCCG	2	8	1560464	1560471	0 %	0 %	50 %	50 %	479136016
25086	NC_021008	CGA	2	6	1560500	1560505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25087	NC_021008	CAA	2	6	1560509	1560514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136016
25088	NC_021008	TGA	2	6	1560526	1560531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136016
25089	NC_021008	GGC	2	6	1560537	1560542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136016
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25091	NC_021008	CGA	2	6	1560554	1560559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25092	NC_021008	TCA	2	6	1560580	1560585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136016
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25094	NC_021008	GCCG	2	8	1560602	1560609	0 %	0 %	50 %	50 %	479136016
25095	NC_021008	CGTG	2	8	1560620	1560627	0 %	25 %	50 %	25 %	479136016
25096	NC_021008	CTG	2	6	1560630	1560635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136016
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25098	NC_021008	CG	3	6	1560793	1560798	0 %	0 %	50 %	50 %	479136016
25099	NC_021008	TCGG	2	8	1560834	1560841	0 %	25 %	50 %	25 %	479136016
25100	NC_021008	CGA	2	6	1560893	1560898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25101	NC_021008	GCT	2	6	1560998	1561003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136016
25102	NC_021008	CAA	2	6	1561100	1561105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479136016
25103	NC_021008	CGC	2	6	1561312	1561317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136017
25104	NC_021008	GCC	2	6	1561325	1561330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136017
25105	NC_021008	GGAT	2	8	1561453	1561460	25 %	25 %	50 %	0 %	479136017
25106	NC_021008	CGC	2	6	1561485	1561490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136017
25107	NC_021008	GGA	2	6	1561525	1561530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136017
25108	NC_021008	CCG	2	6	1561581	1561586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136017
25109	NC_021008	TCA	2	6	1561614	1561619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136017
25110	NC_021008	CGC	2	6	1561689	1561694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136017
25111	NC_021008	GGC	2	6	1561736	1561741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136017
25112	NC_021008	GC	3	6	1561764	1561769	0 %	0 %	50 %	50 %	479136017
25113	NC_021008	GGCT	2	8	1561815	1561822	0 %	25 %	50 %	25 %	479136017
25114	NC_021008	CTG	2	6	1561842	1561847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136017
25115	NC_021008	GTGG	2	8	1561907	1561914	0 %	25 %	75 %	0 %	479136017
25116	NC_021008	TGTTGA	2	12	1561918	1561929	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479136017
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25122	NC_021008	TGC	2	6	1562106	1562111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136017
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25214	NC_021008	GCT	2	6	1567136	1567141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136020
25215	NC_021008	TGA	2	6	1567247	1567252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136020
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25218	NC_021008	CA	3	6	1567401	1567406	50 %	0 %	0 %	50 %	479136021
25219	NC_021008	CGG	2	6	1567488	1567493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136021
25220	NC_021008	CTT	2	6	1567546	1567551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479136021
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25223	NC_021008	ACC	2	6	1567784	1567789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136021
25224	NC_021008	GC	3	6	1567807	1567812	0 %	0 %	50 %	50 %	479136021
25225	NC_021008	CAAGG	2	10	1567832	1567841	40 %	0 %	40 %	20 %	479136021
25226	NC_021008	GAG	2	6	1567862	1567867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479136021
25227	NC_021008	CAT	2	6	1567900	1567905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479136021
25228	NC_021008	TCGGCA	2	12	1568004	1568015	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479136021
25229	NC_021008	CAC	2	6	1568017	1568022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136021
25230	NC_021008	CTG	2	6	1568045	1568050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136021
25231	NC_021008	GCCG	2	8	1568080	1568087	0 %	0 %	50 %	50 %	479136021
25232	NC_021008	CG	3	6	1568091	1568096	0 %	0 %	50 %	50 %	479136021
25233	NC_021008	ACC	2	6	1568112	1568117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479136021
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25237	NC_021008	GCA	2	6	1568227	1568232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136021
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25342	NC_021008	GGC	2	6	1574273	1574278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136026
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25344	NC_021008	GTG	2	6	1574325	1574330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479136026
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25462	NC_021008	GTT	2	6	1583039	1583044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479136030
25463	NC_021008	CGG	3	9	1585518	1585526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136031
25464	NC_021008	GGC	2	6	1585624	1585629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136031
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25466	NC_021008	TGA	2	6	1585686	1585691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479136031
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25469	NC_021008	GGC	2	6	1585834	1585839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479136031
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25489	NC_021008	TTCATG	2	12	1586692	1586703	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479136032
25490	NC_021008	AGC	2	6	1586735	1586740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136032
25491	NC_021008	GC	3	6	1586877	1586882	0 %	0 %	50 %	50 %	479136032
25492	NC_021008	AGC	2	6	1586898	1586903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479136032
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25494	NC_021008	CGT	2	6	1587142	1587147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479136033
25495	NC_021008	CGC	2	6	1587148	1587153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479136033
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