MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_021008	GCTGC	2	10	1330855	1330864	0 %	20 %	40 %	40 %	479135847
21003	NC_021008	TGG	2	6	1330901	1330906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135847
21004	NC_021008	CG	3	6	1330921	1330926	0 %	0 %	50 %	50 %	479135847
21005	NC_021008	CGG	2	6	1330959	1330964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135847
21006	NC_021008	GCC	2	6	1330986	1330991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135847
21007	NC_021008	TGGC	2	8	1331050	1331057	0 %	25 %	50 %	25 %	479135847
21008	NC_021008	GAT	2	6	1331060	1331065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135847
21009	NC_021008	CTG	2	6	1331111	1331116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135847
21010	NC_021008	TGGAC	2	10	1331173	1331182	20 %	20 %	40 %	20 %	479135847
21011	NC_021008	CCG	2	6	1331307	1331312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135847
21012	NC_021008	CAG	2	6	1331315	1331320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135847
21013	NC_021008	GGC	2	6	1331327	1331332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135847
21014	NC_021008	ATA	2	6	1331353	1331358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479135847
21015	NC_021008	ATT	2	6	1331452	1331457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135848
21016	NC_021008	TC	3	6	1331545	1331550	0 %	50 %	0 %	50 %	479135848
21017	NC_021008	TGG	2	6	1331633	1331638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135848
21018	NC_021008	T	6	6	1331675	1331680	0 %	100 %	0 %	0 %	479135848
21019	NC_021008	GGC	2	6	1331801	1331806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135849
21020	NC_021008	CGG	2	6	1331815	1331820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135849
21021	NC_021008	GCGG	2	8	1331931	1331938	0 %	0 %	75 %	25 %	479135849
21022	NC_021008	T	6	6	1331968	1331973	0 %	100 %	0 %	0 %	479135849
21023	NC_021008	TGG	2	6	1331990	1331995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135849
21024	NC_021008	CAT	2	6	1332011	1332016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135849
21025	NC_021008	GA	3	6	1332061	1332066	50 %	0 %	50 %	0 %	479135849
21026	NC_021008	CAG	2	6	1332075	1332080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135849
21027	NC_021008	CCG	2	6	1332140	1332145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135849
21028	NC_021008	TAA	2	6	1332163	1332168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479135849
21029	NC_021008	GTG	2	6	1332329	1332334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135849
21030	NC_021008	ACAG	2	8	1332337	1332344	50 %	0 %	25 %	25 %	479135849
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21033	NC_021008	TGGC	2	8	1332394	1332401	0 %	25 %	50 %	25 %	479135849
21034	NC_021008	AAC	2	6	1332486	1332491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135849
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21036	NC_021008	CGCAA	2	10	1332551	1332560	40 %	0 %	20 %	40 %	479135849
21037	NC_021008	CAG	2	6	1332597	1332602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135849
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21039	NC_021008	GCA	2	6	1332644	1332649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135849
21040	NC_021008	TGGA	2	8	1332788	1332795	25 %	25 %	50 %	0 %	479135849
21041	NC_021008	TC	3	6	1332823	1332828	0 %	50 %	0 %	50 %	479135849
21042	NC_021008	TAGA	2	8	1332879	1332886	50 %	25 %	25 %	0 %	479135849
21043	NC_021008	CGC	2	6	1332889	1332894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135849
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21046	NC_021008	CATC	2	8	1332986	1332993	25 %	25 %	0 %	50 %	479135849
21047	NC_021008	GCT	2	6	1333064	1333069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135849
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21050	NC_021008	TCC	2	6	1333180	1333185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135849
21051	NC_021008	TGA	2	6	1333220	1333225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135849
21052	NC_021008	CGG	2	6	1333232	1333237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135849
21053	NC_021008	TTG	2	6	1333297	1333302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135849
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21055	NC_021008	GGAA	2	8	1333493	1333500	50 %	0 %	50 %	0 %	479135849
21056	NC_021008	GTCC	2	8	1333551	1333558	0 %	25 %	25 %	50 %	479135849
21057	NC_021008	GTC	2	6	1333630	1333635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135849
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21059	NC_021008	TGA	2	6	1334192	1334197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135850
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21063	NC_021008	AGCTGA	2	12	1334357	1334368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479135850
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21066	NC_021008	A	6	6	1334502	1334507	100 %	0 %	0 %	0 %	479135850
21067	NC_021008	GTA	2	6	1334581	1334586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135850
21068	NC_021008	TGA	2	6	1334640	1334645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135850
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21072	NC_021008	GTT	2	6	1334718	1334723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135850
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21082	NC_021008	GCG	2	6	1337566	1337571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135851
21083	NC_021008	CCAG	2	8	1337668	1337675	25 %	0 %	25 %	50 %	479135851
21084	NC_021008	GC	3	6	1337698	1337703	0 %	0 %	50 %	50 %	479135851
21085	NC_021008	CCTCG	2	10	1337705	1337714	0 %	20 %	20 %	60 %	479135851
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21089	NC_021008	GATG	2	8	1338146	1338153	25 %	25 %	50 %	0 %	479135852
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21091	NC_021008	TTTGA	2	10	1338192	1338201	20 %	60 %	20 %	0 %	479135852
21092	NC_021008	CTG	2	6	1338207	1338212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135852
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21100	NC_021008	CTG	2	6	1338566	1338571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135852
21101	NC_021008	ACT	2	6	1338600	1338605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135852
21102	NC_021008	CCT	2	6	1338703	1338708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135852
21103	NC_021008	GAA	2	6	1338740	1338745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135852
21104	NC_021008	TGC	2	6	1338748	1338753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135852
21105	NC_021008	TCG	2	6	1338795	1338800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135852
21106	NC_021008	GGA	2	6	1338863	1338868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135852
21107	NC_021008	GAT	2	6	1338928	1338933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135852
21108	NC_021008	CTTT	2	8	1338952	1338959	0 %	75 %	0 %	25 %	479135852
21109	NC_021008	CTA	2	6	1338978	1338983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135852
21110	NC_021008	CTC	2	6	1339006	1339011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135853
21111	NC_021008	TCG	2	6	1339040	1339045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135853
21112	NC_021008	GAG	2	6	1339069	1339074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135853
21113	NC_021008	TGGT	2	8	1339109	1339116	0 %	50 %	50 %	0 %	479135853
21114	NC_021008	ATGCTG	2	12	1339118	1339129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479135853
21115	NC_021008	ATG	2	6	1339139	1339144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135853
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21117	NC_021008	GCGG	2	8	1339174	1339181	0 %	0 %	75 %	25 %	479135853
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21463	NC_021008	GTC	2	6	1355023	1355028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135863
21464	NC_021008	GCA	2	6	1355150	1355155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135864
21465	NC_021008	TCA	2	6	1355210	1355215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135864
21466	NC_021008	CAT	2	6	1355238	1355243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135864
21467	NC_021008	TCG	2	6	1355374	1355379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135864
21468	NC_021008	GCG	2	6	1355413	1355418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135864
21469	NC_021008	AGA	2	6	1355442	1355447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135864
21470	NC_021008	TGC	2	6	1355486	1355491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135864
21471	NC_021008	GCT	2	6	1355502	1355507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135864
21472	NC_021008	TGC	2	6	1355516	1355521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135864
21473	NC_021008	TGG	2	6	1355585	1355590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135864
21474	NC_021008	GCG	2	6	1355645	1355650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135864
21475	NC_021008	CGA	2	6	1355685	1355690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135864
21476	NC_021008	ACC	2	6	1355692	1355697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135864
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21479	NC_021008	CAT	2	6	1355868	1355873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135864
21480	NC_021008	TCGAT	2	10	1355911	1355920	20 %	40 %	20 %	20 %	479135864
21481	NC_021008	GCC	2	6	1355961	1355966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135864
21482	NC_021008	GCACC	2	10	1355974	1355983	20 %	0 %	20 %	60 %	479135864
21483	NC_021008	CGG	2	6	1355996	1356001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135864
21484	NC_021008	TGG	2	6	1356005	1356010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135864
21485	NC_021008	GTG	2	6	1356011	1356016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135864
21486	NC_021008	CG	3	6	1356049	1356054	0 %	0 %	50 %	50 %	479135864
21487	NC_021008	GCA	2	6	1356164	1356169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135864
21488	NC_021008	CTA	2	6	1356171	1356176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135864
21489	NC_021008	TCA	2	6	1356194	1356199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135864
21490	NC_021008	GGC	2	6	1356201	1356206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135864
21491	NC_021008	CCA	2	6	1356337	1356342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135864
21492	NC_021008	ATGG	2	8	1356449	1356456	25 %	25 %	50 %	0 %	479135864
21493	NC_021008	ATC	2	6	1356542	1356547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135864
21494	NC_021008	GTCT	2	8	1356581	1356588	0 %	50 %	25 %	25 %	479135864
21495	NC_021008	GGCC	2	8	1356606	1356613	0 %	0 %	50 %	50 %	479135864
21496	NC_021008	TGA	2	6	1356826	1356831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135865
21497	NC_021008	AGCC	2	8	1356900	1356907	25 %	0 %	25 %	50 %	479135865
21498	NC_021008	CTG	2	6	1357025	1357030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135865
21499	NC_021008	ATG	2	6	1357041	1357046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135865
21500	NC_021008	CAT	2	6	1357064	1357069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135865

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