MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_021008	TGA	2	6	1194591	1194596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135746
19003	NC_021008	CGC	2	6	1194609	1194614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135746
19004	NC_021008	TCG	2	6	1194629	1194634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135746
19005	NC_021008	GATG	2	8	1194661	1194668	25 %	25 %	50 %	0 %	479135746
19006	NC_021008	CAG	2	6	1194688	1194693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135746
19007	NC_021008	CGG	2	6	1194717	1194722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135746
19008	NC_021008	TCG	2	6	1194809	1194814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135746
19009	NC_021008	CGA	2	6	1194858	1194863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135746
19010	NC_021008	ATG	3	9	1195064	1195072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135746
19011	NC_021008	CGC	2	6	1195093	1195098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135746
19012	NC_021008	CAGTTC	2	12	1195318	1195329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479135747
19013	NC_021008	TCG	2	6	1195352	1195357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135747
19014	NC_021008	TG	3	6	1195379	1195384	0 %	50 %	50 %	0 %	479135747
19015	NC_021008	GC	3	6	1195436	1195441	0 %	0 %	50 %	50 %	479135747
19016	NC_021008	ATC	2	6	1195469	1195474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135747
19017	NC_021008	TGG	2	6	1195475	1195480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135747
19018	NC_021008	CAG	2	6	1195550	1195555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135747
19019	NC_021008	CG	3	6	1195561	1195566	0 %	0 %	50 %	50 %	479135747
19020	NC_021008	GTG	2	6	1195595	1195600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135747
19021	NC_021008	CGC	2	6	1195623	1195628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135747
19022	NC_021008	ATG	2	6	1195688	1195693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135747
19023	NC_021008	CGG	2	6	1195719	1195724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135747
19024	NC_021008	CCA	2	6	1195756	1195761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135747
19025	NC_021008	CAG	2	6	1195867	1195872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135747
19026	NC_021008	GC	3	6	1195980	1195985	0 %	0 %	50 %	50 %	479135747
19027	NC_021008	CG	3	6	1195986	1195991	0 %	0 %	50 %	50 %	479135747
19028	NC_021008	GCC	2	6	1196044	1196049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135747
19029	NC_021008	GC	3	6	1196054	1196059	0 %	0 %	50 %	50 %	479135747
19030	NC_021008	GCC	2	6	1196209	1196214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135747
19031	NC_021008	TCT	2	6	1196235	1196240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135747
19032	NC_021008	CGGT	2	8	1196249	1196256	0 %	25 %	50 %	25 %	479135747
19033	NC_021008	CGG	2	6	1196413	1196418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135748
19034	NC_021008	ACG	2	6	1196457	1196462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135748
19035	NC_021008	GAT	2	6	1196470	1196475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135748
19036	NC_021008	GCC	2	6	1196534	1196539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135748
19037	NC_021008	GGC	2	6	1196588	1196593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135748
19038	NC_021008	GCG	2	6	1196616	1196621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135748
19039	NC_021008	GCG	2	6	1196645	1196650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135748
19040	NC_021008	CTG	2	6	1196672	1196677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135748
19041	NC_021008	GTT	2	6	1196770	1196775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135748
19042	NC_021008	GGC	2	6	1196821	1196826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135748
19043	NC_021008	TTC	2	6	1196846	1196851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135748
19044	NC_021008	GC	3	6	1196862	1196867	0 %	0 %	50 %	50 %	479135748
19045	NC_021008	TGA	2	6	1196974	1196979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135748
19046	NC_021008	ATG	2	6	1197016	1197021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135748
19047	NC_021008	GCC	2	6	1197208	1197213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135749
19048	NC_021008	TGGCG	2	10	1197235	1197244	0 %	20 %	60 %	20 %	479135749
19049	NC_021008	CGT	2	6	1197363	1197368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135749
19050	NC_021008	CCA	2	6	1197380	1197385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135749
19051	NC_021008	CATC	2	8	1197444	1197451	25 %	25 %	0 %	50 %	479135749
19052	NC_021008	CGG	2	6	1197514	1197519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135749
19053	NC_021008	GGT	2	6	1197522	1197527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135749
19054	NC_021008	GCG	3	9	1197548	1197556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135749
19055	NC_021008	TGC	2	6	1197745	1197750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135750
19056	NC_021008	TGG	2	6	1197793	1197798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135750
19057	NC_021008	GGT	2	6	1197871	1197876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135750
19058	NC_021008	GAT	2	6	1198003	1198008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135750
19059	NC_021008	CTCG	2	8	1198017	1198024	0 %	25 %	25 %	50 %	479135750
19060	NC_021008	CGT	2	6	1198031	1198036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135750
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19062	NC_021008	GTTCGA	2	12	1198216	1198227	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479135751
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19065	NC_021008	CGA	2	6	1198402	1198407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135751
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19069	NC_021008	GCA	3	9	1198735	1198743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135751
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19071	NC_021008	TGC	2	6	1198891	1198896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135751
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19073	NC_021008	GCCACG	2	12	1199013	1199024	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	479135751
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19084	NC_021008	CG	3	6	1199774	1199779	0 %	0 %	50 %	50 %	479135752
19085	NC_021008	CGT	2	6	1199821	1199826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135752
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19087	NC_021008	GCT	2	6	1199843	1199848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135752
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19089	NC_021008	GCT	2	6	1199929	1199934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135752
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19093	NC_021008	GC	3	6	1200071	1200076	0 %	0 %	50 %	50 %	479135752
19094	NC_021008	CAG	2	6	1200114	1200119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135752
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19097	NC_021008	CAG	2	6	1200270	1200275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135752
19098	NC_021008	GTGAT	2	10	1200462	1200471	20 %	40 %	40 %	0 %	479135753
19099	NC_021008	TGG	2	6	1200587	1200592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135753
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19102	NC_021008	GC	3	6	1200630	1200635	0 %	0 %	50 %	50 %	479135753
19103	NC_021008	TCG	2	6	1200684	1200689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135753
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19105	NC_021008	CTTGG	2	10	1200800	1200809	0 %	40 %	40 %	20 %	479135754
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19110	NC_021008	CGC	2	6	1201447	1201452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135754
19111	NC_021008	CAG	2	6	1201457	1201462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135754
19112	NC_021008	ATG	2	6	1201469	1201474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135754
19113	NC_021008	CTT	2	6	1201553	1201558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135754
19114	NC_021008	TTG	2	6	1201571	1201576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135754
19115	NC_021008	CCG	2	6	1201666	1201671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135754
19116	NC_021008	CGTG	2	8	1201677	1201684	0 %	25 %	50 %	25 %	479135754
19117	NC_021008	GCG	2	6	1201714	1201719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135754
19118	NC_021008	CTG	2	6	1201787	1201792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135754
19119	NC_021008	AT	3	6	1201863	1201868	50 %	50 %	0 %	0 %	479135754
19120	NC_021008	TCA	2	6	1201887	1201892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135754
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19231	NC_021008	T	6	6	1208754	1208759	0 %	100 %	0 %	0 %	479135760
19232	NC_021008	T	6	6	1208762	1208767	0 %	100 %	0 %	0 %	479135760
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19344	NC_021008	GCA	2	6	1216056	1216061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135768
19345	NC_021008	TTC	2	6	1216063	1216068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135768
19346	NC_021008	CTC	2	6	1216090	1216095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135768
19347	NC_021008	CAC	2	6	1216165	1216170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135768
19348	NC_021008	CAG	2	6	1216249	1216254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135768
19349	NC_021008	TGT	2	6	1216275	1216280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135768
19350	NC_021008	GTC	2	6	1216306	1216311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135768
19351	NC_021008	ACG	2	6	1216358	1216363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135768
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19358	NC_021008	GAT	2	6	1216615	1216620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135768
19359	NC_021008	CAT	2	6	1216632	1216637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135768
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19361	NC_021008	CGA	2	6	1216713	1216718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135768
19362	NC_021008	GCA	2	6	1216742	1216747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135768
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19373	NC_021008	GC	3	6	1217805	1217810	0 %	0 %	50 %	50 %	479135770
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19456	NC_021008	TCT	2	6	1222014	1222019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135772
19457	NC_021008	TGT	2	6	1222050	1222055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135772
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19459	NC_021008	CCG	2	6	1222157	1222162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135772
19460	NC_021008	ACC	2	6	1222166	1222171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135772
19461	NC_021008	CG	3	6	1222296	1222301	0 %	0 %	50 %	50 %	479135772
19462	NC_021008	CCA	2	6	1222320	1222325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135772
19463	NC_021008	CGT	2	6	1222332	1222337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135772
19464	NC_021008	CGG	2	6	1222427	1222432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135772
19465	NC_021008	ACC	2	6	1222483	1222488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135772
19466	NC_021008	CGT	2	6	1222494	1222499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135772
19467	NC_021008	GAC	3	9	1222510	1222518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135772
19468	NC_021008	GCT	2	6	1222539	1222544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135772
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19470	NC_021008	CGA	2	6	1222575	1222580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135772
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19473	NC_021008	TCG	2	6	1222664	1222669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135772
19474	NC_021008	CGG	2	6	1222684	1222689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135772
19475	NC_021008	TGG	2	6	1222691	1222696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135772
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19482	NC_021008	CGA	2	6	1228007	1228012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135773
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19485	NC_021008	CACG	2	8	1228204	1228211	25 %	0 %	25 %	50 %	479135773
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19488	NC_021008	GGT	2	6	1228546	1228551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135774
19489	NC_021008	CGG	2	6	1228557	1228562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135774
19490	NC_021008	TGCGA	2	10	1228655	1228664	20 %	20 %	40 %	20 %	479135774
19491	NC_021008	CATA	2	8	1228706	1228713	50 %	25 %	0 %	25 %	479135774
19492	NC_021008	CAC	2	6	1228720	1228725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135774
19493	NC_021008	CTC	2	6	1228756	1228761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135774
19494	NC_021008	CACCG	2	10	1228825	1228834	20 %	0 %	20 %	60 %	479135774
19495	NC_021008	TCT	2	6	1228839	1228844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135774
19496	NC_021008	CGG	2	6	1228860	1228865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135774
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