MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021008	CAC	2	6	1169286	1169291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135726
18502	NC_021008	CTT	2	6	1169310	1169315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135726
18503	NC_021008	GC	3	6	1169339	1169344	0 %	0 %	50 %	50 %	479135726
18504	NC_021008	CAT	2	6	1169427	1169432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135726
18505	NC_021008	GTG	2	6	1169440	1169445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135726
18506	NC_021008	CGC	2	6	1169583	1169588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135726
18507	NC_021008	CTG	2	6	1169602	1169607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135726
18508	NC_021008	CGC	2	6	1169628	1169633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135726
18509	NC_021008	CTGGTG	2	12	1169647	1169658	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479135726
18510	NC_021008	CCG	2	6	1169675	1169680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135726
18511	NC_021008	TGG	2	6	1169681	1169686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135726
18512	NC_021008	ATCGCC	2	12	1169692	1169703	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479135726
18513	NC_021008	CCA	2	6	1169750	1169755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135726
18514	NC_021008	GCG	2	6	1169800	1169805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135726
18515	NC_021008	TCGT	2	8	1169824	1169831	0 %	50 %	25 %	25 %	479135726
18516	NC_021008	CGA	2	6	1169955	1169960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135726
18517	NC_021008	CG	4	8	1169979	1169986	0 %	0 %	50 %	50 %	479135726
18518	NC_021008	GCC	2	6	1170987	1170992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135727
18519	NC_021008	GCG	2	6	1170999	1171004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135727
18520	NC_021008	GATGC	2	10	1171042	1171051	20 %	20 %	40 %	20 %	479135727
18521	NC_021008	TCA	2	6	1171065	1171070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135727
18522	NC_021008	TGA	2	6	1171081	1171086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135727
18523	NC_021008	TTC	2	6	1171091	1171096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135727
18524	NC_021008	CGG	2	6	1171186	1171191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135727
18525	NC_021008	CGG	2	6	1171196	1171201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135727
18526	NC_021008	AGTC	2	8	1171304	1171311	25 %	25 %	25 %	25 %	479135727
18527	NC_021008	TCA	2	6	1171348	1171353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135727
18528	NC_021008	ACG	2	6	1171697	1171702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135728
18529	NC_021008	GAGCC	2	10	1171743	1171752	20 %	0 %	40 %	40 %	479135728
18530	NC_021008	TGC	2	6	1171802	1171807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135728
18531	NC_021008	TGC	3	9	1171886	1171894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135728
18532	NC_021008	GTGTTC	2	12	1171966	1171977	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	479135728
18533	NC_021008	GTTC	2	8	1172003	1172010	0 %	50 %	25 %	25 %	479135728
18534	NC_021008	GCG	2	6	1172068	1172073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135728
18535	NC_021008	TTC	2	6	1172194	1172199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135728
18536	NC_021008	GTT	2	6	1172217	1172222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135728
18537	NC_021008	ACCA	2	8	1172290	1172297	50 %	0 %	0 %	50 %	479135728
18538	NC_021008	CGG	2	6	1172355	1172360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135728
18539	NC_021008	GGA	2	6	1172391	1172396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135728
18540	NC_021008	GTC	2	6	1172401	1172406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135728
18541	NC_021008	GAA	2	6	1172454	1172459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135728
18542	NC_021008	AAG	2	6	1172467	1172472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135728
18543	NC_021008	CAT	2	6	1172478	1172483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135728
18544	NC_021008	CGC	2	6	1172500	1172505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135728
18545	NC_021008	CCG	2	6	1172510	1172515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135728
18546	NC_021008	TGAT	2	8	1172537	1172544	25 %	50 %	25 %	0 %	479135728
18547	NC_021008	GA	3	6	1172574	1172579	50 %	0 %	50 %	0 %	479135728
18548	NC_021008	AGC	2	6	1172703	1172708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135729
18549	NC_021008	ACAG	2	8	1172784	1172791	50 %	0 %	25 %	25 %	479135729
18550	NC_021008	GTCG	2	8	1172956	1172963	0 %	25 %	50 %	25 %	479135729
18551	NC_021008	AAGG	2	8	1172981	1172988	50 %	0 %	50 %	0 %	479135729
18552	NC_021008	AGC	2	6	1173024	1173029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135729
18553	NC_021008	CGT	2	6	1173082	1173087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135729
18554	NC_021008	CCG	2	6	1173129	1173134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135729
18555	NC_021008	TGC	2	6	1173165	1173170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135729
18556	NC_021008	CGA	2	6	1173211	1173216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135729
18557	NC_021008	TGT	2	6	1173286	1173291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135729
18558	NC_021008	GGC	2	6	1173775	1173780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135730
18559	NC_021008	AACG	2	8	1174006	1174013	50 %	0 %	25 %	25 %	479135730
18560	NC_021008	GGCAT	2	10	1174018	1174027	20 %	20 %	40 %	20 %	479135730
18561	NC_021008	GCG	2	6	1174060	1174065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135730
18562	NC_021008	GC	3	6	1174067	1174072	0 %	0 %	50 %	50 %	479135730
18563	NC_021008	TGCG	2	8	1174085	1174092	0 %	25 %	50 %	25 %	479135730
18564	NC_021008	ATC	2	6	1174114	1174119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135730
18565	NC_021008	GGCGCC	2	12	1174162	1174173	0 %	0 %	50 %	50 %	479135730
18566	NC_021008	GCCG	2	8	1174188	1174195	0 %	0 %	50 %	50 %	479135730
18567	NC_021008	AAC	2	6	1174279	1174284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135730
18568	NC_021008	CGA	2	6	1174383	1174388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135730
18569	NC_021008	GAT	2	6	1174557	1174562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135730
18570	NC_021008	CG	3	6	1174574	1174579	0 %	0 %	50 %	50 %	479135730
18571	NC_021008	CCG	2	6	1174597	1174602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135730
18572	NC_021008	CCG	2	6	1174643	1174648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135730
18573	NC_021008	CGG	2	6	1174725	1174730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135730
18574	NC_021008	GGA	2	6	1174758	1174763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135730
18575	NC_021008	TCG	2	6	1174998	1175003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18576	NC_021008	CTG	3	9	1175008	1175016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18577	NC_021008	CTG	2	6	1175062	1175067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18578	NC_021008	GCC	2	6	1175095	1175100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135731
18579	NC_021008	GGC	2	6	1175118	1175123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135731
18580	NC_021008	GAC	2	6	1175134	1175139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18581	NC_021008	GGA	2	6	1175154	1175159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135731
18582	NC_021008	TGC	2	6	1175171	1175176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18583	NC_021008	GGCCGG	2	12	1175178	1175189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135731
18584	NC_021008	TGG	2	6	1175196	1175201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135731
18585	NC_021008	GCC	2	6	1175218	1175223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135731
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18587	NC_021008	GC	3	6	1175304	1175309	0 %	0 %	50 %	50 %	479135731
18588	NC_021008	GGTGCT	2	12	1175319	1175330	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479135731
18589	NC_021008	CCG	2	6	1175372	1175377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135731
18590	NC_021008	GCGA	2	8	1175387	1175394	25 %	0 %	50 %	25 %	479135731
18591	NC_021008	ATC	2	6	1175434	1175439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135731
18592	NC_021008	CGGCAT	2	12	1175451	1175462	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18593	NC_021008	CGC	2	6	1175487	1175492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135731
18594	NC_021008	GCCC	2	8	1175535	1175542	0 %	0 %	25 %	75 %	479135731
18595	NC_021008	GTC	2	6	1175556	1175561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18596	NC_021008	GCCCG	2	10	1175628	1175637	0 %	0 %	40 %	60 %	479135731
18597	NC_021008	CACGGT	2	12	1175649	1175660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18598	NC_021008	TGC	2	6	1175690	1175695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18599	NC_021008	CGCC	2	8	1175696	1175703	0 %	0 %	25 %	75 %	479135731
18600	NC_021008	CGA	2	6	1175751	1175756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135731
18601	NC_021008	GGT	2	6	1175775	1175780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135731
18602	NC_021008	TTCG	2	8	1175787	1175794	0 %	50 %	25 %	25 %	479135731
18603	NC_021008	TGGT	2	8	1175849	1175856	0 %	50 %	50 %	0 %	479135731
18604	NC_021008	GCC	2	6	1175887	1175892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135731
18605	NC_021008	GCC	3	9	1175908	1175916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135731
18606	NC_021008	CG	3	6	1175917	1175922	0 %	0 %	50 %	50 %	479135731
18607	NC_021008	GC	4	8	1175955	1175962	0 %	0 %	50 %	50 %	479135731
18608	NC_021008	CGC	2	6	1175976	1175981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135731
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18611	NC_021008	GTG	2	6	1176166	1176171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135731
18612	NC_021008	CTG	2	6	1176190	1176195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135731
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