MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021008	TGG	2	6	1136880	1136885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135691
18002	NC_021008	CGA	2	6	1136905	1136910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135691
18003	NC_021008	TAT	2	6	1136918	1136923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135691
18004	NC_021008	GCC	2	6	1136924	1136929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135691
18005	NC_021008	CCG	2	6	1136949	1136954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135691
18006	NC_021008	AAG	2	6	1136966	1136971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135691
18007	NC_021008	AAGAC	2	10	1136985	1136994	60 %	0 %	20 %	20 %	479135691
18008	NC_021008	TGC	2	6	1137033	1137038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135691
18009	NC_021008	CCA	2	6	1137075	1137080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135691
18010	NC_021008	TCA	2	6	1137156	1137161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135691
18011	NC_021008	TCA	2	6	1137183	1137188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135691
18012	NC_021008	TCC	2	6	1137251	1137256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135691
18013	NC_021008	CG	3	6	1137289	1137294	0 %	0 %	50 %	50 %	479135691
18014	NC_021008	CGG	2	6	1137303	1137308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135691
18015	NC_021008	TGG	2	6	1137399	1137404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135692
18016	NC_021008	TTG	2	6	1137442	1137447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135692
18017	NC_021008	CGG	2	6	1137506	1137511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135692
18018	NC_021008	GCC	2	6	1137572	1137577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135692
18019	NC_021008	GCA	2	6	1137643	1137648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135692
18020	NC_021008	GCC	2	6	1137651	1137656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135692
18021	NC_021008	CAA	2	6	1137701	1137706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135692
18022	NC_021008	CAT	2	6	1137790	1137795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135693
18023	NC_021008	GCA	2	6	1137825	1137830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135693
18024	NC_021008	GAC	2	6	1137864	1137869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135693
18025	NC_021008	GCA	2	6	1137904	1137909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135693
18026	NC_021008	ACC	2	6	1138131	1138136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135693
18027	NC_021008	TGC	2	6	1138141	1138146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135693
18028	NC_021008	CCA	2	6	1138168	1138173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135693
18029	NC_021008	CGA	2	6	1138202	1138207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135693
18030	NC_021008	TCA	2	6	1138255	1138260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135693
18031	NC_021008	TCG	2	6	1138285	1138290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135693
18032	NC_021008	GGA	2	6	1138316	1138321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135693
18033	NC_021008	AC	3	6	1138424	1138429	50 %	0 %	0 %	50 %	479135693
18034	NC_021008	CGC	2	6	1138455	1138460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135693
18035	NC_021008	ACC	2	6	1138479	1138484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135693
18036	NC_021008	TCA	2	6	1138501	1138506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135693
18037	NC_021008	CGGCG	2	10	1138542	1138551	0 %	0 %	60 %	40 %	479135693
18038	NC_021008	CGG	2	6	1138592	1138597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135693
18039	NC_021008	CGC	2	6	1138644	1138649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135693
18040	NC_021008	GTG	2	6	1138656	1138661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135693
18041	NC_021008	TCT	2	6	1138705	1138710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135693
18042	NC_021008	CTGGA	2	10	1138753	1138762	20 %	20 %	40 %	20 %	479135693
18043	NC_021008	CAC	2	6	1138766	1138771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135693
18044	NC_021008	CGC	2	6	1138794	1138799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135693
18045	NC_021008	TGG	2	6	1138813	1138818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135693
18046	NC_021008	ACTC	2	8	1138826	1138833	25 %	25 %	0 %	50 %	479135693
18047	NC_021008	GAA	2	6	1138881	1138886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135693
18048	NC_021008	GCTTC	2	10	1138888	1138897	0 %	40 %	20 %	40 %	479135693
18049	NC_021008	CAT	2	6	1138899	1138904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135693
18050	NC_021008	GAA	2	6	1138950	1138955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135693
18051	NC_021008	GTG	2	6	1139022	1139027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135693
18052	NC_021008	GCC	2	6	1139178	1139183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135693
18053	NC_021008	AC	3	6	1139356	1139361	50 %	0 %	0 %	50 %	479135693
18054	NC_021008	GAA	2	6	1139363	1139368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135693
18055	NC_021008	GCC	2	6	1139467	1139472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135693
18056	NC_021008	CGGC	2	8	1139761	1139768	0 %	0 %	50 %	50 %	479135693
18057	NC_021008	GCT	2	6	1139801	1139806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135693
18058	NC_021008	GCT	2	6	1139849	1139854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135693
18059	NC_021008	CT	3	6	1139901	1139906	0 %	50 %	0 %	50 %	479135693
18060	NC_021008	GGC	2	6	1139961	1139966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135693
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18063	NC_021008	TGC	2	6	1140190	1140195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135693
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18073	NC_021008	CGT	2	6	1140987	1140992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135695
18074	NC_021008	CGA	2	6	1141026	1141031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135695
18075	NC_021008	CAT	2	6	1141062	1141067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135695
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18080	NC_021008	CGT	2	6	1141206	1141211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135695
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18082	NC_021008	TAT	2	6	1141258	1141263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135695
18083	NC_021008	TGC	2	6	1141425	1141430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135695
18084	NC_021008	TGA	2	6	1141448	1141453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135695
18085	NC_021008	CCGG	2	8	1141531	1141538	0 %	0 %	50 %	50 %	479135695
18086	NC_021008	GAA	2	6	1141546	1141551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135695
18087	NC_021008	ATC	2	6	1141567	1141572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135695
18088	NC_021008	GAA	2	6	1141591	1141596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135695
18089	NC_021008	AC	3	6	1141618	1141623	50 %	0 %	0 %	50 %	479135695
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18093	NC_021008	CAGT	2	8	1142558	1142565	25 %	25 %	25 %	25 %	479135697
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18096	NC_021008	ATG	2	6	1142758	1142763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135697
18097	NC_021008	GCC	2	6	1142812	1142817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135697
18098	NC_021008	CTT	2	6	1142853	1142858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135697
18099	NC_021008	CAC	2	6	1142874	1142879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135697
18100	NC_021008	CAA	2	6	1142939	1142944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135697
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18102	NC_021008	AAC	2	6	1143052	1143057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135697
18103	NC_021008	AAT	2	6	1143244	1143249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479135698
18104	NC_021008	GAA	2	6	1143262	1143267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135698
18105	NC_021008	TCG	2	6	1143296	1143301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135698
18106	NC_021008	TTC	2	6	1143305	1143310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135698
18107	NC_021008	GCC	2	6	1143314	1143319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135698
18108	NC_021008	GTC	2	6	1143430	1143435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135698
18109	NC_021008	CGAC	2	8	1143461	1143468	25 %	0 %	25 %	50 %	479135698
18110	NC_021008	CAAG	2	8	1143486	1143493	50 %	0 %	25 %	25 %	479135698
18111	NC_021008	GGT	3	9	1143598	1143606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135698
18112	NC_021008	TGG	2	6	1143642	1143647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135698
18113	NC_021008	TCG	2	6	1143731	1143736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135699
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18115	NC_021008	CCG	2	6	1143806	1143811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135699
18116	NC_021008	TGG	2	6	1143879	1143884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135699
18117	NC_021008	TGA	2	6	1143933	1143938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135699
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18345	NC_021008	TGC	2	6	1155164	1155169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135710
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18457	NC_021008	GAC	2	6	1166860	1166865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135722
18458	NC_021008	GCG	2	6	1166874	1166879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135722
18459	NC_021008	GAC	2	6	1166881	1166886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135722
18460	NC_021008	GAT	2	6	1166927	1166932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135722
18461	NC_021008	CGCC	2	8	1166940	1166947	0 %	0 %	25 %	75 %	479135722
18462	NC_021008	CGG	2	6	1166985	1166990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135722
18463	NC_021008	GCT	2	6	1167089	1167094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135723
18464	NC_021008	CTT	2	6	1167122	1167127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135723
18465	NC_021008	CG	3	6	1167145	1167150	0 %	0 %	50 %	50 %	479135723
18466	NC_021008	CG	3	6	1167207	1167212	0 %	0 %	50 %	50 %	479135723
18467	NC_021008	GAA	2	6	1167222	1167227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135723
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18487	NC_021008	GTC	2	6	1168545	1168550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135726
18488	NC_021008	ATG	2	6	1168553	1168558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135726
18489	NC_021008	GAT	2	6	1168620	1168625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135726
18490	NC_021008	GGC	2	6	1168633	1168638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135726
18491	NC_021008	CAG	2	6	1168681	1168686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135726
18492	NC_021008	GC	3	6	1168724	1168729	0 %	0 %	50 %	50 %	479135726
18493	NC_021008	CCG	3	9	1168895	1168903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135726
18494	NC_021008	GCG	2	6	1168954	1168959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135726
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18497	NC_021008	TCGC	2	8	1169074	1169081	0 %	25 %	25 %	50 %	479135726
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18499	NC_021008	CCG	2	6	1169237	1169242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135726
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