MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021008	CT	3	6	954715	954720	0 %	50 %	0 %	50 %	479135561
15002	NC_021008	CAG	2	6	954729	954734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135561
15003	NC_021008	AGC	2	6	954739	954744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135561
15004	NC_021008	TGG	2	6	954755	954760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135561
15005	NC_021008	TCG	2	6	955072	955077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135561
15006	NC_021008	ATG	2	6	955078	955083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135561
15007	NC_021008	AGC	2	6	955201	955206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135561
15008	NC_021008	CCT	2	6	955222	955227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135561
15009	NC_021008	GGA	2	6	955233	955238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135561
15010	NC_021008	GGC	2	6	955239	955244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135561
15011	NC_021008	TCG	2	6	955291	955296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135561
15012	NC_021008	CAGT	2	8	955310	955317	25 %	25 %	25 %	25 %	479135561
15013	NC_021008	ATG	2	6	955333	955338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135561
15014	NC_021008	GAT	2	6	955347	955352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135561
15015	NC_021008	GTT	2	6	955359	955364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135561
15016	NC_021008	ATG	2	6	955583	955588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135562
15017	NC_021008	AAC	3	9	955589	955597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135562
15018	NC_021008	CGC	2	6	955599	955604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135562
15019	NC_021008	CGC	2	6	955639	955644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135562
15020	NC_021008	CGA	2	6	955709	955714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135562
15021	NC_021008	GC	3	6	955722	955727	0 %	0 %	50 %	50 %	479135562
15022	NC_021008	TGTCT	2	10	955773	955782	0 %	60 %	20 %	20 %	479135562
15023	NC_021008	GA	3	6	955809	955814	50 %	0 %	50 %	0 %	479135562
15024	NC_021008	TC	3	6	955873	955878	0 %	50 %	0 %	50 %	479135562
15025	NC_021008	TGA	2	6	955888	955893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135562
15026	NC_021008	GCT	2	6	955972	955977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135562
15027	NC_021008	ATG	2	6	956003	956008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135562
15028	NC_021008	TGG	2	6	956117	956122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135562
15029	NC_021008	CTG	2	6	956162	956167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135562
15030	NC_021008	GGC	2	6	956188	956193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135562
15031	NC_021008	GAT	2	6	956194	956199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135562
15032	NC_021008	GCC	2	6	956207	956212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135562
15033	NC_021008	AGA	2	6	957941	957946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135563
15034	NC_021008	CAC	2	6	958019	958024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135563
15035	NC_021008	ATC	2	6	958059	958064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135563
15036	NC_021008	CTC	2	6	958289	958294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135563
15037	NC_021008	CAC	2	6	958353	958358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135563
15038	NC_021008	CCA	2	6	958367	958372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135563
15039	NC_021008	ATC	2	6	958470	958475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135563
15040	NC_021008	CAA	2	6	958538	958543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135563
15041	NC_021008	CCG	2	6	958546	958551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135563
15042	NC_021008	CAT	2	6	958622	958627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135563
15043	NC_021008	CGA	2	6	958628	958633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15044	NC_021008	CGG	2	6	958648	958653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135563
15045	NC_021008	TGA	2	6	958676	958681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135563
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15048	NC_021008	CGA	2	6	958775	958780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135563
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15050	NC_021008	CGGC	2	8	958816	958823	0 %	0 %	50 %	50 %	479135563
15051	NC_021008	GTC	2	6	958830	958835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15052	NC_021008	CG	3	6	958867	958872	0 %	0 %	50 %	50 %	479135563
15053	NC_021008	CA	3	6	958887	958892	50 %	0 %	0 %	50 %	479135563
15054	NC_021008	GGC	2	6	958893	958898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135563
15055	NC_021008	TCG	2	6	958909	958914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15056	NC_021008	AGG	2	6	958978	958983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135563
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15058	NC_021008	GCG	2	6	959041	959046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135563
15059	NC_021008	CGG	3	9	959120	959128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135563
15060	NC_021008	CGA	2	6	959243	959248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15061	NC_021008	GAT	2	6	959384	959389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135563
15062	NC_021008	TCG	2	6	959443	959448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15063	NC_021008	GCAC	2	8	959456	959463	25 %	0 %	25 %	50 %	479135563
15064	NC_021008	AGG	2	6	959485	959490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135563
15065	NC_021008	CGC	2	6	959496	959501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135563
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15068	NC_021008	GCC	2	6	959619	959624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135563
15069	NC_021008	GCT	2	6	959645	959650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15070	NC_021008	CAA	2	6	959708	959713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135563
15071	NC_021008	CAT	2	6	959726	959731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135563
15072	NC_021008	GGT	2	6	959735	959740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135563
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15075	NC_021008	CCGATG	2	12	959806	959817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479135563
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15077	NC_021008	CTG	3	9	959841	959849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15078	NC_021008	GCC	2	6	959909	959914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135563
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15083	NC_021008	TGC	2	6	960112	960117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15084	NC_021008	CCGCAT	2	12	960119	960130	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479135563
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15088	NC_021008	CGA	2	6	960176	960181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15089	NC_021008	GCC	2	6	960185	960190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135563
15090	NC_021008	TCG	2	6	960205	960210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135563
15091	NC_021008	CGA	2	6	960218	960223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135563
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15095	NC_021008	GGCA	2	8	960812	960819	25 %	0 %	50 %	25 %	479135564
15096	NC_021008	CCG	2	6	960826	960831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135564
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15098	NC_021008	CCATA	2	10	960907	960916	40 %	20 %	0 %	40 %	479135564
15099	NC_021008	GCGG	2	8	960927	960934	0 %	0 %	75 %	25 %	479135564
15100	NC_021008	GCG	2	6	960942	960947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135564
15101	NC_021008	GCTG	2	8	960991	960998	0 %	25 %	50 %	25 %	479135564
15102	NC_021008	TCGG	2	8	961023	961030	0 %	25 %	50 %	25 %	479135564
15103	NC_021008	CAT	2	6	961037	961042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135564
15104	NC_021008	CT	3	6	961053	961058	0 %	50 %	0 %	50 %	479135564
15105	NC_021008	CAAGGC	2	12	961059	961070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135564
15106	NC_021008	GAA	2	6	961148	961153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135564
15107	NC_021008	CAT	2	6	961195	961200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135564
15108	NC_021008	GA	3	6	961215	961220	50 %	0 %	50 %	0 %	479135564
15109	NC_021008	CTG	2	6	961228	961233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135564
15110	NC_021008	TTC	2	6	961317	961322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135564
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15112	NC_021008	CCG	2	6	961402	961407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135564
15113	NC_021008	CAC	2	6	961557	961562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135564
15114	NC_021008	TGG	2	6	961582	961587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135564
15115	NC_021008	GC	3	6	961603	961608	0 %	0 %	50 %	50 %	479135564
15116	NC_021008	TCG	2	6	961672	961677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135564
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15118	NC_021008	CAT	2	6	961733	961738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135564
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15120	NC_021008	TGG	2	6	962043	962048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135565
15121	NC_021008	TGC	2	6	962060	962065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135565
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15476	NC_021008	CGT	2	6	979229	979234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135576
15477	NC_021008	CTG	2	6	979398	979403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135576
15478	NC_021008	GCC	2	6	979416	979421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135576
15479	NC_021008	CG	3	6	979479	979484	0 %	0 %	50 %	50 %	479135576
15480	NC_021008	TTC	2	6	979485	979490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135576
15481	NC_021008	CTG	2	6	979502	979507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135576
15482	NC_021008	CGA	2	6	979622	979627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135576
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15484	NC_021008	CTG	2	6	979641	979646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135576
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15491	NC_021008	GGC	2	6	979898	979903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135576
15492	NC_021008	CTA	2	6	979937	979942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135576
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