MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_021008	GTG	2	6	894008	894013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135521
14003	NC_021008	CAT	2	6	894091	894096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135521
14004	NC_021008	CTG	2	6	894155	894160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14005	NC_021008	GCC	2	6	894185	894190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14006	NC_021008	GCC	2	6	894206	894211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14007	NC_021008	ACC	2	6	894239	894244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135521
14008	NC_021008	CCG	2	6	894248	894253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14009	NC_021008	CGC	3	9	894274	894282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14010	NC_021008	GCG	2	6	894381	894386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135521
14011	NC_021008	TGC	2	6	894396	894401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14012	NC_021008	CG	3	6	894441	894446	0 %	0 %	50 %	50 %	479135521
14013	NC_021008	CG	3	6	894459	894464	0 %	0 %	50 %	50 %	479135521
14014	NC_021008	CGT	2	6	894466	894471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14015	NC_021008	GGC	2	6	894506	894511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135521
14016	NC_021008	CGC	2	6	894655	894660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14017	NC_021008	ACT	2	6	894663	894668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135521
14018	NC_021008	CGGC	2	8	894726	894733	0 %	0 %	50 %	50 %	479135521
14019	NC_021008	GCT	2	6	894784	894789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14020	NC_021008	CGC	2	6	894809	894814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14021	NC_021008	GCC	2	6	894824	894829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14022	NC_021008	GAC	2	6	894842	894847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14023	NC_021008	GCT	3	9	894938	894946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14024	NC_021008	CCG	3	9	894954	894962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14025	NC_021008	TGC	2	6	895017	895022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14026	NC_021008	CGA	2	6	895024	895029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14027	NC_021008	CGC	3	9	895072	895080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14028	NC_021008	TGC	2	6	895111	895116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14029	NC_021008	AGC	2	6	895118	895123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135521
14030	NC_021008	GCC	2	6	895169	895174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14031	NC_021008	CGC	2	6	895177	895182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135521
14032	NC_021008	TCACA	2	10	895287	895296	40 %	20 %	0 %	40 %	479135522
14033	NC_021008	CAT	2	6	895297	895302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135522
14034	NC_021008	GCG	2	6	895319	895324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135522
14035	NC_021008	ACC	2	6	895364	895369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135522
14036	NC_021008	CG	4	8	895405	895412	0 %	0 %	50 %	50 %	479135522
14037	NC_021008	TGA	2	6	895422	895427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135522
14038	NC_021008	CGC	2	6	895444	895449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135522
14039	NC_021008	CGC	2	6	895456	895461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135522
14040	NC_021008	CCGTCA	2	12	895473	895484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	479135522
14041	NC_021008	CCG	2	6	895485	895490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135522
14042	NC_021008	CCG	2	6	895566	895571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135522
14043	NC_021008	CCA	2	6	895614	895619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135522
14044	NC_021008	CCG	2	6	895623	895628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135522
14045	NC_021008	CGA	2	6	895660	895665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135522
14046	NC_021008	GCCGC	2	10	895687	895696	0 %	0 %	40 %	60 %	479135522
14047	NC_021008	TCG	2	6	895713	895718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135522
14048	NC_021008	GCG	3	9	895773	895781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135522
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14050	NC_021008	GGC	2	6	895837	895842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135522
14051	NC_021008	CGC	2	6	895846	895851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135522
14052	NC_021008	GC	3	6	895850	895855	0 %	0 %	50 %	50 %	479135522
14053	NC_021008	CAC	2	6	895906	895911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135522
14054	NC_021008	CCG	2	6	895950	895955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135522
14055	NC_021008	CGG	2	6	895963	895968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135522
14056	NC_021008	CAT	2	6	895978	895983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135522
14057	NC_021008	CGA	2	6	896002	896007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135522
14058	NC_021008	GC	3	6	896124	896129	0 %	0 %	50 %	50 %	479135522
14059	NC_021008	GCA	2	6	896145	896150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135522
14060	NC_021008	GGATT	2	10	896159	896168	20 %	40 %	40 %	0 %	479135522
14061	NC_021008	CGC	3	9	896229	896237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135523
14062	NC_021008	CTGA	2	8	896284	896291	25 %	25 %	25 %	25 %	479135523
14063	NC_021008	CG	3	6	896341	896346	0 %	0 %	50 %	50 %	479135523
14064	NC_021008	CAT	2	6	896363	896368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135523
14065	NC_021008	CCGG	2	8	896388	896395	0 %	0 %	50 %	50 %	479135523
14066	NC_021008	GGC	2	6	896416	896421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135523
14067	NC_021008	GC	3	6	896461	896466	0 %	0 %	50 %	50 %	479135523
14068	NC_021008	CGG	2	6	896585	896590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135523
14069	NC_021008	ATCTCG	2	12	896651	896662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	479135523
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14072	NC_021008	GGA	2	6	896760	896765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135523
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14074	NC_021008	GCC	2	6	896821	896826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135523
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14076	NC_021008	CGAAT	2	10	897036	897045	40 %	20 %	20 %	20 %	479135523
14077	NC_021008	GC	3	6	897046	897051	0 %	0 %	50 %	50 %	479135523
14078	NC_021008	CCT	2	6	897170	897175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135523
14079	NC_021008	GCT	2	6	897204	897209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135523
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14085	NC_021008	CGG	2	6	899403	899408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135524
14086	NC_021008	CGT	2	6	899442	899447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14087	NC_021008	GCT	2	6	899448	899453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14088	NC_021008	TGC	2	6	899495	899500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14089	NC_021008	GTC	2	6	899578	899583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14090	NC_021008	CTG	2	6	899599	899604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14091	NC_021008	CGA	2	6	899616	899621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135524
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14094	NC_021008	GCC	2	6	899686	899691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135524
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14099	NC_021008	GAG	2	6	899803	899808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135524
14100	NC_021008	CTC	2	6	899844	899849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135524
14101	NC_021008	CTG	2	6	899965	899970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14102	NC_021008	CAT	2	6	900048	900053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135524
14103	NC_021008	TCG	2	6	900068	900073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14104	NC_021008	GCCGCT	2	12	900090	900101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479135524
14105	NC_021008	CCGC	2	8	900191	900198	0 %	0 %	25 %	75 %	479135524
14106	NC_021008	TGC	2	6	900251	900256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14107	NC_021008	ACCG	2	8	900259	900266	25 %	0 %	25 %	50 %	479135524
14108	NC_021008	GCTGGC	2	12	900300	900311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479135524
14109	NC_021008	GGT	2	6	900369	900374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135524
14110	NC_021008	AAG	2	6	900379	900384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135524
14111	NC_021008	ACC	2	6	900418	900423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135524
14112	NC_021008	ATGG	2	8	900487	900494	25 %	25 %	50 %	0 %	479135524
14113	NC_021008	ACCA	2	8	900499	900506	50 %	0 %	0 %	50 %	479135524
14114	NC_021008	GCT	2	6	900573	900578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14115	NC_021008	TCC	3	9	900604	900612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135524
14116	NC_021008	CTT	2	6	900735	900740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135524
14117	NC_021008	AAC	2	6	900787	900792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135524
14118	NC_021008	CGA	2	6	900798	900803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135524
14119	NC_021008	TCC	2	6	900850	900855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135524
14120	NC_021008	CCG	2	6	900883	900888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135524
14121	NC_021008	GAG	2	6	900904	900909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135524
14122	NC_021008	ATC	2	6	900976	900981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135524
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14124	NC_021008	AGC	2	6	901016	901021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135524
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14138	NC_021008	CG	4	8	901589	901596	0 %	0 %	50 %	50 %	479135525
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14147	NC_021008	CAT	2	6	902293	902298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135526
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14155	NC_021008	GCG	2	6	902580	902585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135526
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14157	NC_021008	AAGG	2	8	902635	902642	50 %	0 %	50 %	0 %	479135526
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14220	NC_021008	GTG	2	6	908213	908218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135529
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14232	NC_021008	CTT	2	6	908886	908891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135530
14233	NC_021008	CGG	2	6	908892	908897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135530
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14236	NC_021008	GTG	2	6	908968	908973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135530
14237	NC_021008	GTGCTG	2	12	909013	909024	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	479135530
14238	NC_021008	GAA	2	6	909081	909086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135530
14239	NC_021008	ATC	2	6	909175	909180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135530
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14241	NC_021008	CCT	2	6	909203	909208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135530
14242	NC_021008	ACC	2	6	909256	909261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135530
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14244	NC_021008	TCA	2	6	909368	909373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135530
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14249	NC_021008	CTG	2	6	909665	909670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135531
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14254	NC_021008	CGA	2	6	910096	910101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135531
14255	NC_021008	TCA	2	6	910104	910109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135531
14256	NC_021008	CGA	2	6	910123	910128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135531
14257	NC_021008	AAG	2	6	910148	910153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135531
14258	NC_021008	CTG	2	6	910193	910198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135531
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14313	NC_021008	AGCCG	2	10	912531	912540	20 %	0 %	40 %	40 %	479135533
14314	NC_021008	GCC	2	6	912571	912576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135533
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14337	NC_021008	CGA	2	6	914203	914208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135534
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14341	NC_021008	CGG	2	6	914491	914496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135534
14342	NC_021008	CGA	2	6	914530	914535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135534
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14344	NC_021008	CA	4	8	914566	914573	50 %	0 %	0 %	50 %	479135534
14345	NC_021008	GCT	2	6	914614	914619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135534
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14351	NC_021008	GC	3	6	914764	914769	0 %	0 %	50 %	50 %	479135534
14352	NC_021008	GCT	2	6	914779	914784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135534
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14354	NC_021008	TTCCGG	2	12	914950	914961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135534
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14473	NC_021008	ACA	2	6	921107	921112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135537
14474	NC_021008	GTG	2	6	921124	921129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135537
14475	NC_021008	CG	3	6	921161	921166	0 %	0 %	50 %	50 %	479135537
14476	NC_021008	CATC	2	8	921231	921238	25 %	25 %	0 %	50 %	479135537
14477	NC_021008	TGC	2	6	921263	921268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135537
14478	NC_021008	CCAC	2	8	921392	921399	25 %	0 %	0 %	75 %	479135537
14479	NC_021008	GGT	2	6	921429	921434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135537
14480	NC_021008	ACT	2	6	921461	921466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135537
14481	NC_021008	CGG	2	6	921474	921479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135537
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14483	NC_021008	TGC	2	6	921494	921499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135537
14484	NC_021008	AATG	2	8	921675	921682	50 %	25 %	25 %	0 %	479135538
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14486	NC_021008	GAA	2	6	921715	921720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135538
14487	NC_021008	GTGA	2	8	921745	921752	25 %	25 %	50 %	0 %	479135538
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14496	NC_021008	ACGTT	2	10	922144	922153	20 %	40 %	20 %	20 %	479135539
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14498	NC_021008	GAAT	2	8	922226	922233	50 %	25 %	25 %	0 %	479135539
14499	NC_021008	GTC	2	6	922265	922270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135539
14500	NC_021008	TG	3	6	922309	922314	0 %	50 %	50 %	0 %	479135539

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