MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021008	CCG	2	6	834207	834212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135481
13002	NC_021008	CTC	2	6	834224	834229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135481
13003	NC_021008	GCC	2	6	834240	834245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135481
13004	NC_021008	ACG	2	6	834364	834369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135481
13005	NC_021008	GAA	2	6	834467	834472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135481
13006	NC_021008	AAG	2	6	834489	834494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135481
13007	NC_021008	GGT	2	6	834519	834524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135481
13008	NC_021008	GAC	2	6	834531	834536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135481
13009	NC_021008	TAC	2	6	834537	834542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135481
13010	NC_021008	ACA	2	6	834640	834645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135481
13011	NC_021008	CAG	3	9	834663	834671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135481
13012	NC_021008	TGA	2	6	835724	835729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135482
13013	NC_021008	GTC	2	6	835762	835767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135482
13014	NC_021008	TCTGAT	3	18	835773	835790	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479135482
13015	NC_021008	CTG	2	6	835795	835800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135482
13016	NC_021008	TCG	2	6	835802	835807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135482
13017	NC_021008	CAAGGG	2	12	835839	835850	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479135482
13018	NC_021008	TGG	2	6	835961	835966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135482
13019	NC_021008	GTGGC	2	10	836037	836046	0 %	20 %	60 %	20 %	479135482
13020	NC_021008	TGA	2	6	836102	836107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135482
13021	NC_021008	TCCA	2	8	836131	836138	25 %	25 %	0 %	50 %	479135482
13022	NC_021008	GCT	2	6	836151	836156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135482
13023	NC_021008	GCCTG	2	10	836169	836178	0 %	20 %	40 %	40 %	479135482
13024	NC_021008	GGC	2	6	836244	836249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135482
13025	NC_021008	TGG	2	6	836252	836257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135482
13026	NC_021008	TTC	2	6	836281	836286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135482
13027	NC_021008	TCG	2	6	836342	836347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135482
13028	NC_021008	GCC	2	6	836464	836469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135482
13029	NC_021008	GC	3	6	836471	836476	0 %	0 %	50 %	50 %	479135482
13030	NC_021008	ATC	2	6	836494	836499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135482
13031	NC_021008	TCT	3	9	836501	836509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135482
13032	NC_021008	GCT	2	6	836510	836515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135482
13033	NC_021008	CTT	2	6	836526	836531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135482
13034	NC_021008	CAA	2	6	836760	836765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479135483
13035	NC_021008	CGC	2	6	836785	836790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135483
13036	NC_021008	CAG	2	6	837064	837069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135483
13037	NC_021008	CCA	2	6	837191	837196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135483
13038	NC_021008	TCG	2	6	837274	837279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135483
13039	NC_021008	GTG	3	9	837453	837461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135483
13040	NC_021008	CT	3	6	837510	837515	0 %	50 %	0 %	50 %	479135483
13041	NC_021008	CGA	2	6	837525	837530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135483
13042	NC_021008	CGC	2	6	837573	837578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135483
13043	NC_021008	GTG	2	6	837622	837627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135483
13044	NC_021008	CAT	2	6	837735	837740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135483
13045	NC_021008	GGC	2	6	837753	837758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135483
13046	NC_021008	CG	3	6	837774	837779	0 %	0 %	50 %	50 %	479135483
13047	NC_021008	CGA	2	6	837804	837809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135483
13048	NC_021008	CGC	2	6	837819	837824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135483
13049	NC_021008	CTA	2	6	837828	837833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135483
13050	NC_021008	ATCA	2	8	838038	838045	50 %	25 %	0 %	25 %	479135484
13051	NC_021008	CGC	2	6	838046	838051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13052	NC_021008	CAAG	2	8	838175	838182	50 %	0 %	25 %	25 %	479135484
13053	NC_021008	GGGC	2	8	838196	838203	0 %	0 %	75 %	25 %	479135484
13054	NC_021008	CTG	2	6	838221	838226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13055	NC_021008	GTG	2	6	838299	838304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135484
13056	NC_021008	CTC	2	6	838363	838368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479135484
13057	NC_021008	GCG	2	6	838387	838392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135484
13058	NC_021008	TGC	2	6	838396	838401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13059	NC_021008	CCA	2	6	838402	838407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135484
13060	NC_021008	ATTCG	2	10	838427	838436	20 %	40 %	20 %	20 %	479135484
13061	NC_021008	GGAAGC	2	12	838448	838459	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	479135484
13062	NC_021008	CGC	2	6	838466	838471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13063	NC_021008	CAGC	2	8	838480	838487	25 %	0 %	25 %	50 %	479135484
13064	NC_021008	GCA	2	6	838630	838635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13065	NC_021008	GTG	2	6	838659	838664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135484
13066	NC_021008	GGC	2	6	838676	838681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135484
13067	NC_021008	CCG	2	6	838717	838722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13068	NC_021008	GCC	2	6	838757	838762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13069	NC_021008	GCGT	2	8	838774	838781	0 %	25 %	50 %	25 %	479135484
13070	NC_021008	TTG	2	6	838832	838837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135484
13071	NC_021008	CGC	2	6	838964	838969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13072	NC_021008	CG	3	6	839012	839017	0 %	0 %	50 %	50 %	479135484
13073	NC_021008	GAA	2	6	839022	839027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479135484
13074	NC_021008	GGC	2	6	839048	839053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135484
13075	NC_021008	CGT	2	6	839073	839078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13076	NC_021008	CCG	2	6	839131	839136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13077	NC_021008	TGCCA	2	10	839141	839150	20 %	20 %	20 %	40 %	479135484
13078	NC_021008	GATGCC	2	12	839151	839162	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13079	NC_021008	ATG	2	6	839233	839238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135484
13080	NC_021008	CGA	2	6	839324	839329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13081	NC_021008	GCT	2	6	839335	839340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13082	NC_021008	CCG	2	6	839368	839373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13083	NC_021008	TGG	2	6	839401	839406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135484
13084	NC_021008	GGC	2	6	839435	839440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135484
13085	NC_021008	GCA	2	6	839503	839508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13086	NC_021008	CGA	2	6	839537	839542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13087	NC_021008	ACC	2	6	839661	839666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479135484
13088	NC_021008	GTT	2	6	839673	839678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479135484
13089	NC_021008	GGT	3	9	839681	839689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135484
13090	NC_021008	CCG	2	6	839731	839736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13091	NC_021008	GCC	2	6	839818	839823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13092	NC_021008	CTGC	2	8	839835	839842	0 %	25 %	25 %	50 %	479135484
13093	NC_021008	GCC	2	6	839886	839891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135484
13094	NC_021008	GCG	2	6	839907	839912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135484
13095	NC_021008	ATGC	2	8	839976	839983	25 %	25 %	25 %	25 %	479135484
13096	NC_021008	CG	3	6	839997	840002	0 %	0 %	50 %	50 %	479135484
13097	NC_021008	GTC	2	6	840088	840093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13098	NC_021008	GGCG	2	8	840143	840150	0 %	0 %	75 %	25 %	479135484
13099	NC_021008	TGA	2	6	840203	840208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135484
13100	NC_021008	GAT	2	6	840252	840257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479135484
13101	NC_021008	GAC	2	6	840270	840275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135484
13102	NC_021008	GGC	2	6	840650	840655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479135485
13103	NC_021008	CGC	2	6	840854	840859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135485
13104	NC_021008	CGC	2	6	840863	840868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135485
13105	NC_021008	GCCG	2	8	840890	840897	0 %	0 %	50 %	50 %	479135485
13106	NC_021008	TTC	2	6	840939	840944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135485
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13108	NC_021008	ACT	2	6	840988	840993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135485
13109	NC_021008	ATT	2	6	841006	841011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479135485
13110	NC_021008	ACG	2	6	841060	841065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135485
13111	NC_021008	CGA	2	6	841174	841179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479135485
13112	NC_021008	TCT	2	6	841180	841185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479135485
13113	NC_021008	GAG	2	6	841201	841206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479135485
13114	NC_021008	TGG	2	6	841273	841278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479135485
13115	NC_021008	CTG	2	6	841339	841344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479135485
13116	NC_021008	ATC	2	6	841377	841382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135485
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13118	NC_021008	ACT	2	6	841525	841530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479135485
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13356	NC_021008	GCC	2	6	858807	858812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479135494
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