MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-192

Total Repeats: 41577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_020515	ATTT	2	8	2404101	2404108	25 %	75 %	0 %	0 %	470168238
41502	NC_020515	ATT	2	6	2404121	2404126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168238
41503	NC_020515	GAC	2	6	2404155	2404160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168238
41504	NC_020515	ATG	2	6	2404195	2404200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168238
41505	NC_020515	CCA	2	6	2404203	2404208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168238
41506	NC_020515	TAACGG	2	12	2404217	2404228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470168238
41507	NC_020515	TACCA	2	10	2404256	2404265	40 %	20 %	0 %	40 %	470168238
41508	NC_020515	ACC	2	6	2404304	2404309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168238
41509	NC_020515	AAT	2	6	2404367	2404372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168238
41510	NC_020515	CATGC	2	10	2404409	2404418	20 %	20 %	20 %	40 %	470168238
41511	NC_020515	AAAAT	2	10	2404437	2404446	80 %	20 %	0 %	0 %	470168238
41512	NC_020515	TCCA	2	8	2404491	2404498	25 %	25 %	0 %	50 %	470168238
41513	NC_020515	ATA	2	6	2404545	2404550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168238
41514	NC_020515	ATA	2	6	2404638	2404643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168238
41515	NC_020515	TAAT	2	8	2404678	2404685	50 %	50 %	0 %	0 %	470168238
41516	NC_020515	TAGAA	2	10	2404736	2404745	60 %	20 %	20 %	0 %	470168238
41517	NC_020515	AAT	2	6	2404787	2404792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168238
41518	NC_020515	TAA	2	6	2404804	2404809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168238
41519	NC_020515	TGG	2	6	2404826	2404831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470168238
41520	NC_020515	TAAA	2	8	2404991	2404998	75 %	25 %	0 %	0 %	470168238
41521	NC_020515	TTA	2	6	2405085	2405090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168238
41522	NC_020515	CGCT	2	8	2405100	2405107	0 %	25 %	25 %	50 %	470168238
41523	NC_020515	ACC	2	6	2405108	2405113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168238
41524	NC_020515	TA	3	6	2405122	2405127	50 %	50 %	0 %	0 %	470168238
41525	NC_020515	TAA	2	6	2405149	2405154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168238
41526	NC_020515	TAA	2	6	2405168	2405173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168238
41527	NC_020515	AATC	2	8	2405179	2405186	50 %	25 %	0 %	25 %	470168238
41528	NC_020515	T	6	6	2405219	2405224	0 %	100 %	0 %	0 %	470168238
41529	NC_020515	TAT	2	6	2405264	2405269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168239
41530	NC_020515	TGGT	2	8	2405280	2405287	0 %	50 %	50 %	0 %	470168239
41531	NC_020515	TGC	2	6	2405334	2405339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470168239
41532	NC_020515	CCA	2	6	2405353	2405358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168239
41533	NC_020515	TGT	2	6	2405459	2405464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168239
41534	NC_020515	ATC	2	6	2405628	2405633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168239
41535	NC_020515	TC	3	6	2405663	2405668	0 %	50 %	0 %	50 %	470168239
41536	NC_020515	ACA	2	6	2405672	2405677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470168239
41537	NC_020515	TTAA	2	8	2405716	2405723	50 %	50 %	0 %	0 %	470168239
41538	NC_020515	T	6	6	2405814	2405819	0 %	100 %	0 %	0 %	470168239
41539	NC_020515	TTC	2	6	2405865	2405870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470168239
41540	NC_020515	T	7	7	2406020	2406026	0 %	100 %	0 %	0 %	470168239
41541	NC_020515	CAA	2	6	2406183	2406188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470168239
41542	NC_020515	ATCTTC	2	12	2406195	2406206	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470168239
41543	NC_020515	AAAT	2	8	2406246	2406253	75 %	25 %	0 %	0 %	470168239
41544	NC_020515	GTAG	2	8	2406261	2406268	25 %	25 %	50 %	0 %	470168239
41545	NC_020515	GGTT	2	8	2406269	2406276	0 %	50 %	50 %	0 %	470168239
41546	NC_020515	TCTG	2	8	2406329	2406336	0 %	50 %	25 %	25 %	470168239
41547	NC_020515	ACT	2	6	2406390	2406395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168239
41548	NC_020515	TTA	2	6	2406445	2406450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168239
41549	NC_020515	CTT	2	6	2406458	2406463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470168239
41550	NC_020515	GTT	2	6	2406485	2406490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168239
41551	NC_020515	ATA	2	6	2406495	2406500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168239
41552	NC_020515	TCA	2	6	2406620	2406625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168239
41553	NC_020515	TCT	2	6	2406767	2406772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470168239
41554	NC_020515	AAT	2	6	2406864	2406869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168239
41555	NC_020515	GGT	2	6	2406940	2406945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470168239
41556	NC_020515	AAT	2	6	2406952	2406957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168239
41557	NC_020515	ACC	2	6	2407003	2407008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168239
41558	NC_020515	GTTA	2	8	2407023	2407030	25 %	50 %	25 %	0 %	470168239
41559	NC_020515	A	6	6	2407060	2407065	100 %	0 %	0 %	0 %	470168239
41560	NC_020515	ACG	2	6	2407077	2407082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168239
41561	NC_020515	T	6	6	2407128	2407133	0 %	100 %	0 %	0 %	470168239
41562	NC_020515	GAT	2	6	2407184	2407189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168240
41563	NC_020515	GAT	2	6	2407193	2407198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168240
41564	NC_020515	CAA	2	6	2407238	2407243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470168240
41565	NC_020515	GCA	2	6	2407297	2407302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168240
41566	NC_020515	C	6	6	2407332	2407337	0 %	0 %	0 %	100 %	470168240
41567	NC_020515	CAT	2	6	2407361	2407366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168240
41568	NC_020515	GTT	2	6	2407382	2407387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168240
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41572	NC_020515	TTG	2	6	2407692	2407697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168241
41573	NC_020515	TTGC	2	8	2407712	2407719	0 %	50 %	25 %	25 %	470168241
41574	NC_020515	CAATC	2	10	2407733	2407742	40 %	20 %	0 %	40 %	470168241
41575	NC_020515	CTT	2	6	2407757	2407762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470168241
41576	NC_020515	T	6	6	2407785	2407790	0 %	100 %	0 %	0 %	470168241
41577	NC_020515	CATC	2	8	2407796	2407803	25 %	25 %	0 %	50 %	470168241

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.