MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-192

Total Repeats: 41577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38004	NC_020515	GCC	2	6	2205143	2205148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470168046
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38117	NC_020515	CAA	2	6	2211252	2211257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470168053
38118	NC_020515	TTA	2	6	2211269	2211274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168053
38119	NC_020515	AAT	2	6	2211294	2211299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38120	NC_020515	TAA	2	6	2211318	2211323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38121	NC_020515	CAA	3	9	2211329	2211337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470168053
38122	NC_020515	TAA	2	6	2211353	2211358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38123	NC_020515	AT	3	6	2211448	2211453	50 %	50 %	0 %	0 %	470168053
38124	NC_020515	TAA	2	6	2211455	2211460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38125	NC_020515	AAT	2	6	2211506	2211511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38126	NC_020515	AATTA	2	10	2211531	2211540	60 %	40 %	0 %	0 %	470168053
38127	NC_020515	TAAAT	2	10	2211558	2211567	60 %	40 %	0 %	0 %	470168053
38128	NC_020515	TTTC	2	8	2211583	2211590	0 %	75 %	0 %	25 %	470168053
38129	NC_020515	TAA	2	6	2211624	2211629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38130	NC_020515	AAT	2	6	2211650	2211655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38131	NC_020515	AAT	2	6	2211705	2211710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38132	NC_020515	A	7	7	2211718	2211724	100 %	0 %	0 %	0 %	470168053
38133	NC_020515	GATAG	2	10	2211742	2211751	40 %	20 %	40 %	0 %	470168053
38134	NC_020515	T	6	6	2211795	2211800	0 %	100 %	0 %	0 %	470168053
38135	NC_020515	TAT	2	6	2211821	2211826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168053
38136	NC_020515	ATA	2	6	2211846	2211851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38137	NC_020515	AG	3	6	2211853	2211858	50 %	0 %	50 %	0 %	470168053
38138	NC_020515	ATAA	2	8	2211862	2211869	75 %	25 %	0 %	0 %	470168053
38139	NC_020515	TA	3	6	2211890	2211895	50 %	50 %	0 %	0 %	470168053
38140	NC_020515	ATG	2	6	2211899	2211904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168053
38141	NC_020515	ATA	2	6	2211918	2211923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168053
38142	NC_020515	CCA	2	6	2211931	2211936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168053
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38144	NC_020515	ATT	2	6	2212053	2212058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168053
38145	NC_020515	AT	3	6	2212122	2212127	50 %	50 %	0 %	0 %	470168053
38146	NC_020515	CCA	2	6	2212129	2212134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168053
38147	NC_020515	ATAAA	2	10	2212137	2212146	80 %	20 %	0 %	0 %	470168053
38148	NC_020515	CTGC	2	8	2212250	2212257	0 %	25 %	25 %	50 %	470168053
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38150	NC_020515	CTAT	2	8	2212297	2212304	25 %	50 %	0 %	25 %	470168053
38151	NC_020515	TGG	2	6	2212313	2212318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470168053
38152	NC_020515	T	6	6	2212383	2212388	0 %	100 %	0 %	0 %	470168053
38153	NC_020515	TGC	2	6	2212763	2212768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470168054
38154	NC_020515	GGT	2	6	2212775	2212780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470168054
38155	NC_020515	TATTCG	2	12	2212880	2212891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470168054
38156	NC_020515	CGCT	2	8	2212933	2212940	0 %	25 %	25 %	50 %	470168054
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38160	NC_020515	TGA	2	6	2213234	2213239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168054
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38169	NC_020515	AATT	2	8	2213557	2213564	50 %	50 %	0 %	0 %	470168054
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38172	NC_020515	CCAA	2	8	2213720	2213727	50 %	0 %	0 %	50 %	470168054
38173	NC_020515	GCC	2	6	2213823	2213828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470168054
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38177	NC_020515	A	6	6	2214044	2214049	100 %	0 %	0 %	0 %	470168054
38178	NC_020515	GCT	2	6	2214092	2214097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470168054
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38181	NC_020515	GCA	2	6	2214242	2214247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168054
38182	NC_020515	GCTT	2	8	2214336	2214343	0 %	50 %	25 %	25 %	470168054
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38184	NC_020515	T	6	6	2214411	2214416	0 %	100 %	0 %	0 %	470168054
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38188	NC_020515	A	6	6	2214562	2214567	100 %	0 %	0 %	0 %	470168054
38189	NC_020515	GTC	2	6	2214813	2214818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470168055
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38191	NC_020515	GTG	2	6	2215070	2215075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470168055
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38206	NC_020515	GTA	2	6	2215948	2215953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168056
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38221	NC_020515	ACC	2	6	2217045	2217050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168056
38222	NC_020515	CTT	2	6	2217192	2217197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470168057
38223	NC_020515	CTT	2	6	2217201	2217206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470168057
38224	NC_020515	AAC	2	6	2217218	2217223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470168057
38225	NC_020515	CCTG	2	8	2217254	2217261	0 %	25 %	25 %	50 %	470168057
38226	NC_020515	GCAAC	2	10	2217295	2217304	40 %	0 %	20 %	40 %	470168057
38227	NC_020515	CTT	2	6	2217405	2217410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470168057
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38229	NC_020515	CAA	2	6	2217462	2217467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470168057
38230	NC_020515	C	6	6	2217486	2217491	0 %	0 %	0 %	100 %	470168057
38231	NC_020515	ACC	2	6	2217493	2217498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168057
38232	NC_020515	CCA	2	6	2217587	2217592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168057
38233	NC_020515	CCA	2	6	2217618	2217623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168057
38234	NC_020515	ATG	2	6	2217673	2217678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168057
38235	NC_020515	CAC	2	6	2217711	2217716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168057
38236	NC_020515	CGC	2	6	2217729	2217734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470168057
38237	NC_020515	T	6	6	2217783	2217788	0 %	100 %	0 %	0 %	470168057
38238	NC_020515	ATC	2	6	2217818	2217823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168057
38239	NC_020515	CCAC	2	8	2217939	2217946	25 %	0 %	0 %	75 %	470168057
38240	NC_020515	CAT	2	6	2217966	2217971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168057
38241	NC_020515	A	7	7	2218406	2218412	100 %	0 %	0 %	0 %	470168058
38242	NC_020515	ACC	2	6	2218503	2218508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168058
38243	NC_020515	GAT	2	6	2218613	2218618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168058
38244	NC_020515	TATC	2	8	2218708	2218715	25 %	50 %	0 %	25 %	470168058
38245	NC_020515	TGA	2	6	2218756	2218761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168058
38246	NC_020515	GAA	2	6	2218766	2218771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470168058
38247	NC_020515	ATG	2	6	2218894	2218899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168059
38248	NC_020515	GTC	2	6	2218920	2218925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470168059
38249	NC_020515	A	6	6	2219162	2219167	100 %	0 %	0 %	0 %	470168060
38250	NC_020515	AGC	2	6	2219275	2219280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168060
38251	NC_020515	ATC	2	6	2219304	2219309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168060
38252	NC_020515	TCA	2	6	2219335	2219340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168060
38253	NC_020515	CAAG	2	8	2219342	2219349	50 %	0 %	25 %	25 %	470168060
38254	NC_020515	CCG	2	6	2219399	2219404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470168060
38255	NC_020515	AGA	2	6	2219427	2219432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470168060
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38257	NC_020515	A	6	6	2219477	2219482	100 %	0 %	0 %	0 %	470168060
38258	NC_020515	GAT	2	6	2219546	2219551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168060
38259	NC_020515	TGA	2	6	2219557	2219562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168060
38260	NC_020515	GCA	2	6	2219609	2219614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168060
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38262	NC_020515	ATT	2	6	2219652	2219657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168060
38263	NC_020515	T	6	6	2219656	2219661	0 %	100 %	0 %	0 %	470168060
38264	NC_020515	ATC	2	6	2219719	2219724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168060
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38266	NC_020515	ATGA	2	8	2219774	2219781	50 %	25 %	25 %	0 %	470168060
38267	NC_020515	GAT	2	6	2219782	2219787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168060
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38269	NC_020515	A	6	6	2219888	2219893	100 %	0 %	0 %	0 %	470168060
38270	NC_020515	TGG	2	6	2219929	2219934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470168060
38271	NC_020515	AT	3	6	2219941	2219946	50 %	50 %	0 %	0 %	470168060
38272	NC_020515	TAAA	2	8	2220048	2220055	75 %	25 %	0 %	0 %	470168060
38273	NC_020515	TTG	2	6	2220079	2220084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168060
38274	NC_020515	AGA	2	6	2220124	2220129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470168060
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38276	NC_020515	A	8	8	2220188	2220195	100 %	0 %	0 %	0 %	470168060
38277	NC_020515	GAG	2	6	2220213	2220218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470168060
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38282	NC_020515	A	6	6	2220396	2220401	100 %	0 %	0 %	0 %	470168061
38283	NC_020515	ATT	2	6	2220491	2220496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168061
38284	NC_020515	CTTT	2	8	2220499	2220506	0 %	75 %	0 %	25 %	470168061
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38289	NC_020515	A	6	6	2220660	2220665	100 %	0 %	0 %	0 %	470168061
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38300	NC_020515	A	6	6	2221067	2221072	100 %	0 %	0 %	0 %	470168061
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38307	NC_020515	ACG	2	6	2221996	2222001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168063
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38349	NC_020515	TGT	2	6	2225054	2225059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168066
38350	NC_020515	ACTG	2	8	2225096	2225103	25 %	25 %	25 %	25 %	470168066
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38352	NC_020515	GTT	2	6	2225256	2225261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168066
38353	NC_020515	GTT	2	6	2225276	2225281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168066
38354	NC_020515	CGTTA	2	10	2225627	2225636	20 %	40 %	20 %	20 %	470168066
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38466	NC_020515	TTG	2	6	2231164	2231169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168066
38467	NC_020515	GCA	2	6	2231178	2231183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168066
38468	NC_020515	ATT	2	6	2231186	2231191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168066
38469	NC_020515	TTA	2	6	2231250	2231255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168066
38470	NC_020515	CATTA	2	10	2231258	2231267	40 %	40 %	0 %	20 %	470168066
38471	NC_020515	CTAGCA	2	12	2231349	2231360	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470168066
38472	NC_020515	ACT	2	6	2231369	2231374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168066
38473	NC_020515	AACC	2	8	2231397	2231404	50 %	0 %	0 %	50 %	470168066
38474	NC_020515	TCA	2	6	2231562	2231567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168066
38475	NC_020515	ACC	2	6	2231588	2231593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470168066
38476	NC_020515	TGT	2	6	2231612	2231617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470168066
38477	NC_020515	GCA	2	6	2231679	2231684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168066
38478	NC_020515	TTGCAT	2	12	2231707	2231718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470168066
38479	NC_020515	GTA	2	6	2231754	2231759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168066
38480	NC_020515	AAC	2	6	2231761	2231766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470168066
38481	NC_020515	TAT	2	6	2231800	2231805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168066
38482	NC_020515	ACT	2	6	2231825	2231830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168066
38483	NC_020515	ATAC	2	8	2231869	2231876	50 %	25 %	0 %	25 %	470168066
38484	NC_020515	AAT	2	6	2231898	2231903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470168066
38485	NC_020515	CAG	2	6	2231941	2231946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168066
38486	NC_020515	ATT	2	6	2231972	2231977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168066
38487	NC_020515	TAC	2	6	2232004	2232009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470168066
38488	NC_020515	TAT	2	6	2232064	2232069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168066
38489	NC_020515	CCG	2	6	2232205	2232210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470168066
38490	NC_020515	CT	3	6	2232213	2232218	0 %	50 %	0 %	50 %	470168066
38491	NC_020515	AGT	2	6	2232272	2232277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470168066
38492	NC_020515	GCT	2	6	2232315	2232320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470168066
38493	NC_020515	AGAA	2	8	2232407	2232414	75 %	0 %	25 %	0 %	470168066
38494	NC_020515	CAA	2	6	2232421	2232426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470168066
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38497	NC_020515	CG	3	6	2232476	2232481	0 %	0 %	50 %	50 %	470168066
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38499	NC_020515	GCA	2	6	2232555	2232560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470168066
38500	NC_020515	ATT	2	6	2232626	2232631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470168066

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