MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-192

Total Repeats: 41577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21003	NC_020515	CTT	2	6	1237500	1237505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167119
21004	NC_020515	TCGT	2	8	1237538	1237545	0 %	50 %	25 %	25 %	470167119
21005	NC_020515	AAT	2	6	1237570	1237575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470167119
21006	NC_020515	A	6	6	1237961	1237966	100 %	0 %	0 %	0 %	470167120
21007	NC_020515	TGG	2	6	1237984	1237989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470167120
21008	NC_020515	A	6	6	1238038	1238043	100 %	0 %	0 %	0 %	470167120
21009	NC_020515	TTA	2	6	1238048	1238053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470167120
21010	NC_020515	ATC	2	6	1238073	1238078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167120
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21012	NC_020515	GAA	2	6	1238180	1238185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470167120
21013	NC_020515	AC	3	6	1238220	1238225	50 %	0 %	0 %	50 %	470167120
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21017	NC_020515	A	6	6	1238555	1238560	100 %	0 %	0 %	0 %	470167120
21018	NC_020515	A	6	6	1238565	1238570	100 %	0 %	0 %	0 %	470167120
21019	NC_020515	CTT	2	6	1238611	1238616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167120
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21021	NC_020515	TGA	2	6	1238715	1238720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167120
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21107	NC_020515	CTG	2	6	1244304	1244309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470167126
21108	NC_020515	AAAT	2	8	1244340	1244347	75 %	25 %	0 %	0 %	470167126
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21111	NC_020515	GAT	2	6	1244514	1244519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167127
21112	NC_020515	CAT	2	6	1244536	1244541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167127
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21115	NC_020515	AAT	2	6	1244683	1244688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470167127
21116	NC_020515	ACC	2	6	1244707	1244712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470167127
21117	NC_020515	C	6	6	1244719	1244724	0 %	0 %	0 %	100 %	470167127
21118	NC_020515	TCA	2	6	1244759	1244764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167127
21119	NC_020515	T	7	7	1244950	1244956	0 %	100 %	0 %	0 %	470167127
21120	NC_020515	CAAT	2	8	1245035	1245042	50 %	25 %	0 %	25 %	470167127
21121	NC_020515	GATT	2	8	1245069	1245076	25 %	50 %	25 %	0 %	470167127
21122	NC_020515	ATAA	2	8	1245096	1245103	75 %	25 %	0 %	0 %	470167127
21123	NC_020515	GCG	2	6	1245158	1245163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470167127
21124	NC_020515	AGA	2	6	1245187	1245192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470167127
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21126	NC_020515	TTG	2	6	1245229	1245234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470167127
21127	NC_020515	ATA	2	6	1245272	1245277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470167127
21128	NC_020515	GGT	2	6	1245337	1245342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470167127
21129	NC_020515	TCA	2	6	1245377	1245382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167127
21130	NC_020515	CGG	2	6	1245389	1245394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470167127
21131	NC_020515	G	6	6	1245393	1245398	0 %	0 %	100 %	0 %	470167127
21132	NC_020515	GGT	2	6	1245473	1245478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470167127
21133	NC_020515	CAA	2	6	1245486	1245491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470167127
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21136	NC_020515	ATC	2	6	1245838	1245843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167128
21137	NC_020515	CTG	2	6	1245948	1245953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470167128
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21139	NC_020515	AAC	2	6	1246087	1246092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470167128
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21143	NC_020515	ATG	2	6	1246370	1246375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167128
21144	NC_020515	GA	3	6	1246407	1246412	50 %	0 %	50 %	0 %	470167128
21145	NC_020515	AAG	2	6	1246451	1246456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470167128
21146	NC_020515	TAA	2	6	1246584	1246589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470167128
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21149	NC_020515	T	6	6	1246686	1246691	0 %	100 %	0 %	0 %	470167128
21150	NC_020515	TCT	2	6	1246755	1246760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167128
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21152	NC_020515	CAG	2	6	1246963	1246968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470167128
21153	NC_020515	TAAA	2	8	1246971	1246978	75 %	25 %	0 %	0 %	470167128
21154	NC_020515	TCT	2	6	1247000	1247005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167128
21155	NC_020515	CAA	2	6	1247079	1247084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470167128
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21157	NC_020515	A	6	6	1247139	1247144	100 %	0 %	0 %	0 %	470167128
21158	NC_020515	TAA	2	6	1247158	1247163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470167128
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21164	NC_020515	TAG	2	6	1247294	1247299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167128
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21210	NC_020515	TGTT	2	8	1250363	1250370	0 %	75 %	25 %	0 %	470167129
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21218	NC_020515	ATTTTC	2	12	1251122	1251133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470167131
21219	NC_020515	GCTG	2	8	1251135	1251142	0 %	25 %	50 %	25 %	470167131
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21222	NC_020515	TC	3	6	1251221	1251226	0 %	50 %	0 %	50 %	470167131
21223	NC_020515	CCA	2	6	1251288	1251293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470167131
21224	NC_020515	GAA	2	6	1251295	1251300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470167131
21225	NC_020515	ATTTAA	2	12	1251347	1251358	50 %	50 %	0 %	0 %	470167131
21226	NC_020515	GGC	2	6	1251388	1251393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470167131
21227	NC_020515	ATG	2	6	1251403	1251408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167131
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21229	NC_020515	ATG	2	6	1251488	1251493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167131
21230	NC_020515	CAA	2	6	1251544	1251549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470167131
21231	NC_020515	TA	3	6	1251659	1251664	50 %	50 %	0 %	0 %	470167131
21232	NC_020515	CAC	2	6	1251974	1251979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470167132
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21234	NC_020515	GAA	2	6	1252068	1252073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470167132
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21351	NC_020515	CAT	2	6	1258360	1258365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167135
21352	NC_020515	TAA	2	6	1258414	1258419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470167135
21353	NC_020515	TCA	2	6	1258459	1258464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167135
21354	NC_020515	CTT	3	9	1258492	1258500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167135
21355	NC_020515	CTT	2	6	1258516	1258521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167135
21356	NC_020515	TACCAA	2	12	1258555	1258566	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470167135
21357	NC_020515	TAA	2	6	1258616	1258621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470167135
21358	NC_020515	TCA	2	6	1258767	1258772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167135
21359	NC_020515	CAT	2	6	1258796	1258801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167135
21360	NC_020515	AAAT	2	8	1258831	1258838	75 %	25 %	0 %	0 %	470167135
21361	NC_020515	GCA	2	6	1258980	1258985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470167135
21362	NC_020515	TGG	2	6	1258991	1258996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470167135
21363	NC_020515	CAT	2	6	1259044	1259049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167135
21364	NC_020515	CTA	3	9	1259050	1259058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167135
21365	NC_020515	ATC	2	6	1259172	1259177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167135
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21369	NC_020515	GAT	2	6	1259448	1259453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167135
21370	NC_020515	TTGAT	2	10	1259487	1259496	20 %	60 %	20 %	0 %	470167135
21371	NC_020515	GTA	2	6	1259550	1259555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167135
21372	NC_020515	TAA	2	6	1259583	1259588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470167135
21373	NC_020515	GTT	2	6	1259618	1259623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470167135
21374	NC_020515	GCA	2	6	1259646	1259651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470167135
21375	NC_020515	ACC	2	6	1259714	1259719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470167135
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21378	NC_020515	CAT	2	6	1259842	1259847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167135
21379	NC_020515	ATC	2	6	1259876	1259881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167135
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21382	NC_020515	CTT	2	6	1260043	1260048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167135
21383	NC_020515	AGT	2	6	1260097	1260102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167135
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21386	NC_020515	TGT	2	6	1260271	1260276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470167136
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21402	NC_020515	CACC	2	8	1261309	1261316	25 %	0 %	0 %	75 %	470167136
21403	NC_020515	GCT	2	6	1261335	1261340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470167136
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21420	NC_020515	ATT	2	6	1262782	1262787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470167140
21421	NC_020515	TAAT	2	8	1262792	1262799	50 %	50 %	0 %	0 %	470167140
21422	NC_020515	ATG	2	6	1262804	1262809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167140
21423	NC_020515	CGATAA	2	12	1262838	1262849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470167140
21424	NC_020515	GCTC	2	8	1262871	1262878	0 %	25 %	25 %	50 %	470167140
21425	NC_020515	AGCAG	2	10	1262880	1262889	40 %	0 %	40 %	20 %	470167140
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21432	NC_020515	CGG	2	6	1263218	1263223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470167140
21433	NC_020515	TTA	2	6	1263259	1263264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470167140
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21436	NC_020515	A	6	6	1263418	1263423	100 %	0 %	0 %	0 %	470167140
21437	NC_020515	TAC	2	6	1263470	1263475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167140
21438	NC_020515	TGA	2	6	1263480	1263485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167140
21439	NC_020515	AGTTT	2	10	1263516	1263525	20 %	60 %	20 %	0 %	470167141
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21442	NC_020515	GGT	2	6	1263587	1263592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470167141
21443	NC_020515	TCA	2	6	1263600	1263605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167141
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21445	NC_020515	TGG	2	6	1263676	1263681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470167141
21446	NC_020515	CTG	2	6	1263690	1263695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470167141
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21448	NC_020515	TAATTT	2	12	1263837	1263848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470167141
21449	NC_020515	ATTT	2	8	1263854	1263861	25 %	75 %	0 %	0 %	470167141
21450	NC_020515	TCCA	2	8	1263871	1263878	25 %	25 %	0 %	50 %	470167141
21451	NC_020515	AC	3	6	1263912	1263917	50 %	0 %	0 %	50 %	470167141
21452	NC_020515	CTG	2	6	1263930	1263935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470167141
21453	NC_020515	TTA	2	6	1263962	1263967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470167141
21454	NC_020515	CA	4	8	1264041	1264048	50 %	0 %	0 %	50 %	470167141
21455	NC_020515	T	6	6	1264088	1264093	0 %	100 %	0 %	0 %	470167141
21456	NC_020515	GGT	2	6	1264100	1264105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470167141
21457	NC_020515	GGT	2	6	1264154	1264159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470167141
21458	NC_020515	TGG	2	6	1264236	1264241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470167141
21459	NC_020515	AACA	2	8	1264354	1264361	75 %	0 %	0 %	25 %	470167142
21460	NC_020515	ATTG	2	8	1264446	1264453	25 %	50 %	25 %	0 %	470167142
21461	NC_020515	TC	3	6	1264461	1264466	0 %	50 %	0 %	50 %	470167142
21462	NC_020515	AT	3	6	1264572	1264577	50 %	50 %	0 %	0 %	470167142
21463	NC_020515	TTTA	2	8	1264590	1264597	25 %	75 %	0 %	0 %	470167142
21464	NC_020515	GAA	2	6	1264675	1264680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470167142
21465	NC_020515	CAAC	2	8	1264744	1264751	50 %	0 %	0 %	50 %	470167142
21466	NC_020515	ACT	2	6	1264836	1264841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167142
21467	NC_020515	TTGCA	2	10	1264908	1264917	20 %	40 %	20 %	20 %	470167142
21468	NC_020515	TAT	2	6	1264941	1264946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470167142
21469	NC_020515	A	6	6	1264970	1264975	100 %	0 %	0 %	0 %	470167142
21470	NC_020515	TCA	2	6	1265188	1265193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167143
21471	NC_020515	AAAC	2	8	1265281	1265288	75 %	0 %	0 %	25 %	470167143
21472	NC_020515	TCT	2	6	1265395	1265400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167143
21473	NC_020515	GCTG	2	8	1265465	1265472	0 %	25 %	50 %	25 %	470167143
21474	NC_020515	GTA	2	6	1265481	1265486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167143
21475	NC_020515	GCT	2	6	1265515	1265520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470167143
21476	NC_020515	TCA	2	6	1265578	1265583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167143
21477	NC_020515	CGA	2	6	1265597	1265602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470167143
21478	NC_020515	AGA	2	6	1265609	1265614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470167143
21479	NC_020515	T	6	6	1265688	1265693	0 %	100 %	0 %	0 %	470167143
21480	NC_020515	TTC	2	6	1265730	1265735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167143
21481	NC_020515	CAA	2	6	1265918	1265923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470167143
21482	NC_020515	CAT	2	6	1265946	1265951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167143
21483	NC_020515	AGT	2	6	1265954	1265959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470167143
21484	NC_020515	TTGT	2	8	1266090	1266097	0 %	75 %	25 %	0 %	470167143
21485	NC_020515	AGTG	2	8	1266110	1266117	25 %	25 %	50 %	0 %	470167143
21486	NC_020515	GTAA	2	8	1266159	1266166	50 %	25 %	25 %	0 %	470167143
21487	NC_020515	CAT	2	6	1266251	1266256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167143
21488	NC_020515	ACC	2	6	1266312	1266317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470167143
21489	NC_020515	ACC	2	6	1266333	1266338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470167143
21490	NC_020515	AAACCA	2	12	1266358	1266369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470167143
21491	NC_020515	TGGCGT	2	12	1266439	1266450	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470167143
21492	NC_020515	ACC	2	6	1266462	1266467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470167143
21493	NC_020515	CTG	2	6	1266521	1266526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470167143
21494	NC_020515	TCT	2	6	1266574	1266579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470167143
21495	NC_020515	TAA	2	6	1266585	1266590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470167143
21496	NC_020515	AAG	2	6	1266631	1266636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470167143
21497	NC_020515	CAT	2	6	1266681	1266686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470167143
21498	NC_020515	CT	3	6	1266787	1266792	0 %	50 %	0 %	50 %	470167143
21499	NC_020515	T	6	6	1266798	1266803	0 %	100 %	0 %	0 %	470167143
21500	NC_020515	GCC	2	6	1266868	1266873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470167143

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