MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-107

Total Repeats: 2193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020393	CTTT	2	8	148	155	0 %	75 %	0 %	25 %	452202696
2	NC_020393	ACA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202696
3	NC_020393	ATA	2	6	192	197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202696
4	NC_020393	TCT	2	6	211	216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202696
5	NC_020393	TAG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202696
6	NC_020393	TTA	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202696
7	NC_020393	GAT	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202696
8	NC_020393	ATC	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202696
9	NC_020393	CT	3	6	686	691	0 %	50 %	0 %	50 %	452202697
10	NC_020393	TCG	3	9	787	795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202697
11	NC_020393	AGT	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202697
12	NC_020393	CAGT	2	8	897	904	25 %	25 %	25 %	25 %	452202697
13	NC_020393	TTA	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202697
14	NC_020393	TCT	2	6	999	1004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202697
15	NC_020393	GAA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202697
16	NC_020393	TCGGT	2	10	1039	1048	0 %	40 %	40 %	20 %	452202697
17	NC_020393	TCT	2	6	1113	1118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202697
18	NC_020393	GTC	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202697
19	NC_020393	TCG	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202697
20	NC_020393	AAT	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202697
21	NC_020393	TGT	2	6	1452	1457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202697
22	NC_020393	ATT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202697
23	NC_020393	CGT	2	6	1526	1531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202697
24	NC_020393	TAC	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202697
25	NC_020393	TGGT	2	8	1723	1730	0 %	50 %	50 %	0 %	452202697
26	NC_020393	TTC	2	6	1747	1752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202697
27	NC_020393	AT	3	6	2573	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	452202698
28	NC_020393	T	6	6	2626	2631	0 %	100 %	0 %	0 %	452202698
29	NC_020393	CTC	2	6	2674	2679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202698
30	NC_020393	TA	4	8	2800	2807	50 %	50 %	0 %	0 %	452202698
31	NC_020393	GTTTT	2	10	2826	2835	0 %	80 %	20 %	0 %	452202698
32	NC_020393	TA	3	6	2862	2867	50 %	50 %	0 %	0 %	452202698
33	NC_020393	ATAA	2	8	2892	2899	75 %	25 %	0 %	0 %	452202698
34	NC_020393	CAA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202698
35	NC_020393	TCC	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202698
36	NC_020393	GAA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202698
37	NC_020393	GTA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202698
38	NC_020393	AAG	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202698
39	NC_020393	TAA	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202698
40	NC_020393	AG	3	6	3362	3367	50 %	0 %	50 %	0 %	452202698
41	NC_020393	GTA	2	6	3368	3373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202698
42	NC_020393	TTG	2	6	3379	3384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202698
43	NC_020393	AC	3	6	3395	3400	50 %	0 %	0 %	50 %	452202698
44	NC_020393	AT	3	6	3488	3493	50 %	50 %	0 %	0 %	452202698
45	NC_020393	ATTCAT	2	12	3535	3546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202698
46	NC_020393	TGA	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202699
47	NC_020393	T	6	6	4170	4175	0 %	100 %	0 %	0 %	452202699
48	NC_020393	AGTA	2	8	4231	4238	50 %	25 %	25 %	0 %	452202699
49	NC_020393	ACG	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202699
50	NC_020393	TCA	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202699
51	NC_020393	TAA	2	6	4374	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202699
52	NC_020393	AGC	2	6	4380	4385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202699
53	NC_020393	ACA	2	6	4398	4403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202699
54	NC_020393	ACT	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202699
55	NC_020393	TCT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202699
56	NC_020393	CGTATT	2	12	4480	4491	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202699
57	NC_020393	AGG	2	6	4548	4553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202699
58	NC_020393	TTCATA	2	12	4616	4627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202699
59	NC_020393	ACA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202699
60	NC_020393	TG	3	6	4667	4672	0 %	50 %	50 %	0 %	452202699
61	NC_020393	AT	3	6	4740	4745	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
62	NC_020393	CTA	2	6	4761	4766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202699
63	NC_020393	TC	3	6	4769	4774	0 %	50 %	0 %	50 %	452202699
64	NC_020393	AC	3	6	4787	4792	50 %	0 %	0 %	50 %	452202699
65	NC_020393	GTAT	2	8	4793	4800	25 %	50 %	25 %	0 %	452202699
66	NC_020393	A	7	7	4802	4808	100 %	0 %	0 %	0 %	452202699
67	NC_020393	ATT	2	6	4820	4825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202699
68	NC_020393	GAA	2	6	4835	4840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202699
69	NC_020393	TA	3	6	4858	4863	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
70	NC_020393	AGAT	2	8	4865	4872	50 %	25 %	25 %	0 %	452202699
71	NC_020393	GAAT	2	8	4937	4944	50 %	25 %	25 %	0 %	452202699
72	NC_020393	AACAA	2	10	4980	4989	80 %	0 %	0 %	20 %	452202699
73	NC_020393	CAA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202699
74	NC_020393	A	7	7	5027	5033	100 %	0 %	0 %	0 %	452202699
75	NC_020393	GTA	2	6	5057	5062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202699
76	NC_020393	TA	3	6	5084	5089	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
77	NC_020393	TTTA	2	8	5166	5173	25 %	75 %	0 %	0 %	452202699
78	NC_020393	TCA	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202699
79	NC_020393	ATTG	2	8	5253	5260	25 %	50 %	25 %	0 %	452202699
80	NC_020393	TTC	2	6	5274	5279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202699
81	NC_020393	CTC	2	6	5305	5310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202699
82	NC_020393	GAA	2	6	5313	5318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202699
83	NC_020393	A	6	6	5317	5322	100 %	0 %	0 %	0 %	452202699
84	NC_020393	AT	4	8	5347	5354	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
85	NC_020393	TCT	3	9	5370	5378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202699
86	NC_020393	TCT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202699
87	NC_020393	A	7	7	5479	5485	100 %	0 %	0 %	0 %	452202699
88	NC_020393	AT	3	6	5495	5500	50 %	50 %	0 %	0 %	452202699
89	NC_020393	TTC	2	6	5903	5908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
90	NC_020393	GAG	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202700
91	NC_020393	TTCC	2	8	5944	5951	0 %	50 %	0 %	50 %	452202700
92	NC_020393	TGG	2	6	6029	6034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202700
93	NC_020393	TCT	2	6	6074	6079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
94	NC_020393	TCT	2	6	6096	6101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
95	NC_020393	GTA	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
96	NC_020393	CTT	2	6	6259	6264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
97	NC_020393	GAT	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
98	NC_020393	TGT	2	6	6450	6455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202700
99	NC_020393	ATT	2	6	6494	6499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202700
100	NC_020393	TTC	2	6	6569	6574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
101	NC_020393	CTT	2	6	6730	6735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
102	NC_020393	TA	3	6	6745	6750	50 %	50 %	0 %	0 %	452202700
103	NC_020393	TC	3	6	6786	6791	0 %	50 %	0 %	50 %	452202700
104	NC_020393	T	6	6	6794	6799	0 %	100 %	0 %	0 %	452202700
105	NC_020393	TAA	2	6	6833	6838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202700
106	NC_020393	ACC	2	6	6906	6911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202700
107	NC_020393	ATG	2	6	6968	6973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
108	NC_020393	ATG	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
109	NC_020393	AT	3	6	7157	7162	50 %	50 %	0 %	0 %	452202700
110	NC_020393	T	6	6	7237	7242	0 %	100 %	0 %	0 %	452202700
111	NC_020393	TCCT	2	8	7316	7323	0 %	50 %	0 %	50 %	452202700
112	NC_020393	CCAT	2	8	7349	7356	25 %	25 %	0 %	50 %	452202700
113	NC_020393	TAG	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
114	NC_020393	GATG	2	8	7427	7434	25 %	25 %	50 %	0 %	452202700
115	NC_020393	TTTC	2	8	7458	7465	0 %	75 %	0 %	25 %	452202700
116	NC_020393	TC	3	6	7506	7511	0 %	50 %	0 %	50 %	452202700
117	NC_020393	TCT	2	6	7598	7603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
118	NC_020393	AAT	2	6	7688	7693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202700
119	NC_020393	TA	3	6	7706	7711	50 %	50 %	0 %	0 %	452202700
120	NC_020393	GTAAAA	2	12	7770	7781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202700
121	NC_020393	GTA	2	6	7785	7790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
122	NC_020393	ATT	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202700
123	NC_020393	AGT	2	6	7868	7873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
124	NC_020393	CCA	2	6	7983	7988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202700
125	NC_020393	TTC	2	6	7996	8001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202700
126	NC_020393	GAA	2	6	8002	8007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202700
127	NC_020393	CCA	2	6	8013	8018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202700
128	NC_020393	AAC	2	6	8036	8041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202700
129	NC_020393	TGT	2	6	8228	8233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202700
130	NC_020393	TGG	2	6	8237	8242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202700
131	NC_020393	CCT	2	6	8505	8510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202700
132	NC_020393	TGA	2	6	8573	8578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202700
133	NC_020393	GTT	2	6	8596	8601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202700
134	NC_020393	ATT	3	9	8666	8674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202700
135	NC_020393	TATT	2	8	8755	8762	25 %	75 %	0 %	0 %	452202700
136	NC_020393	TAT	2	6	8893	8898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202700
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251	NC_020393	GTA	2	6	15656	15661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202707
252	NC_020393	AT	3	6	15667	15672	50 %	50 %	0 %	0 %	452202707
253	NC_020393	ATGAT	2	10	15701	15710	40 %	40 %	20 %	0 %	452202708
254	NC_020393	AGA	2	6	15750	15755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202708
255	NC_020393	ATA	2	6	15803	15808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202708
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259	NC_020393	AAG	2	6	15923	15928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202708
260	NC_020393	TTTC	2	8	15984	15991	0 %	75 %	0 %	25 %	452202708
261	NC_020393	A	6	6	16024	16029	100 %	0 %	0 %	0 %	452202708
262	NC_020393	AAG	2	6	16241	16246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202708
263	NC_020393	GTT	2	6	16255	16260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202708
264	NC_020393	GA	3	6	16306	16311	50 %	0 %	50 %	0 %	452202708
265	NC_020393	TAT	2	6	16370	16375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202708
266	NC_020393	AAC	2	6	16409	16414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202708
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